MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	A	8	8	695	702	100 %	0 %	0 %	0 %	512656347
2	NC_021503	A	9	9	801	809	100 %	0 %	0 %	0 %	512656347
3	NC_021503	T	6	6	1129	1134	0 %	100 %	0 %	0 %	512656347
4	NC_021503	A	6	6	2067	2072	100 %	0 %	0 %	0 %	512656347
5	NC_021503	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021503	T	6	6	4146	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021503	T	6	6	4456	4461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021503	A	6	6	4514	4519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021503	T	6	6	4580	4585	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
10	NC_021503	T	6	6	4591	4596	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
11	NC_021503	T	6	6	4602	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
12	NC_021503	T	7	7	4612	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
13	NC_021503	T	6	6	4670	4675	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
14	NC_021503	T	7	7	4684	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
15	NC_021503	T	6	6	4708	4713	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
16	NC_021503	T	6	6	4847	4852	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
17	NC_021503	T	7	7	4965	4971	0 %	100 %	0 %	0 %	512656351
18	NC_021503	T	6	6	5682	5687	0 %	100 %	0 %	0 %	512656352
19	NC_021503	T	6	6	5774	5779	0 %	100 %	0 %	0 %	512656352
20	NC_021503	T	6	6	6009	6014	0 %	100 %	0 %	0 %	512656352
21	NC_021503	A	6	6	6101	6106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021503	A	6	6	6186	6191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021503	T	6	6	6599	6604	0 %	100 %	0 %	0 %	512656353
24	NC_021503	T	6	6	7048	7053	0 %	100 %	0 %	0 %	512656353
25	NC_021503	T	6	6	7503	7508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021503	T	6	6	7544	7549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021503	T	7	7	7700	7706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021503	A	7	7	7930	7936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021503	T	7	7	8139	8145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021503	A	7	7	8403	8409	100 %	0 %	0 %	0 %	512656354
31	NC_021503	A	6	6	8625	8630	100 %	0 %	0 %	0 %	512656354
32	NC_021503	A	6	6	8783	8788	100 %	0 %	0 %	0 %	512656354
33	NC_021503	A	6	6	9322	9327	100 %	0 %	0 %	0 %	512656355
34	NC_021503	A	6	6	10061	10066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021503	T	6	6	10118	10123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021503	T	6	6	10181	10186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021503	T	6	6	10293	10298	0 %	100 %	0 %	0 %	512656356
38	NC_021503	A	8	8	12246	12253	100 %	0 %	0 %	0 %	512656358
39	NC_021503	A	6	6	12348	12353	100 %	0 %	0 %	0 %	512656358
40	NC_021503	A	6	6	12516	12521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021503	T	6	6	13348	13353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021503	T	6	6	13431	13436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021503	A	6	6	13481	13486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021503	T	6	6	14908	14913	0 %	100 %	0 %	0 %	512656360
45	NC_021503	A	7	7	14945	14951	100 %	0 %	0 %	0 %	512656360
46	NC_021503	T	8	8	15003	15010	0 %	100 %	0 %	0 %	512656360
47	NC_021503	T	6	6	15027	15032	0 %	100 %	0 %	0 %	512656360
48	NC_021503	T	6	6	15577	15582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021503	T	6	6	15604	15609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021503	A	7	7	15742	15748	100 %	0 %	0 %	0 %	512656362
51	NC_021503	A	7	7	15770	15776	100 %	0 %	0 %	0 %	512656362
52	NC_021503	T	6	6	15957	15962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021503	A	7	7	16683	16689	100 %	0 %	0 %	0 %	512656363
54	NC_021503	A	7	7	16743	16749	100 %	0 %	0 %	0 %	512656363
55	NC_021503	T	7	7	17725	17731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021503	T	6	6	17881	17886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021503	A	6	6	18411	18416	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
58	NC_021503	A	6	6	19009	19014	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
59	NC_021503	A	7	7	19142	19148	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
60	NC_021503	A	7	7	19494	19500	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
61	NC_021503	A	6	6	19647	19652	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
62	NC_021503	A	7	7	19849	19855	100 %	0 %	0 %	0 %	512656365
63	NC_021503	G	6	6	20015	20020	0 %	0 %	100 %	0 %	512656365
64	NC_021503	T	6	6	20509	20514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021503	T	7	7	21444	21450	0 %	100 %	0 %	0 %	512656368
66	NC_021503	A	6	6	21885	21890	100 %	0 %	0 %	0 %	512656369
67	NC_021503	A	6	6	21909	21914	100 %	0 %	0 %	0 %	512656369
68	NC_021503	A	6	6	21957	21962	100 %	0 %	0 %	0 %	512656369
69	NC_021503	A	6	6	22376	22381	100 %	0 %	0 %	0 %	512656369
70	NC_021503	T	6	6	23134	23139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021503	A	6	6	23318	23323	100 %	0 %	0 %	0 %	512656370
72	NC_021503	T	7	7	27603	27609	0 %	100 %	0 %	0 %	512656374
73	NC_021503	T	7	7	27759	27765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021503	A	6	6	28918	28923	100 %	0 %	0 %	0 %	512656376
75	NC_021503	A	6	6	29089	29094	100 %	0 %	0 %	0 %	512656376
76	NC_021503	A	7	7	29485	29491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021503	T	7	7	31775	31781	0 %	100 %	0 %	0 %	512656378
78	NC_021503	T	6	6	32700	32705	0 %	100 %	0 %	0 %	512656378
79	NC_021503	A	7	7	34455	34461	100 %	0 %	0 %	0 %	512656379
80	NC_021503	T	7	7	34881	34887	0 %	100 %	0 %	0 %	512656380
81	NC_021503	T	6	6	34906	34911	0 %	100 %	0 %	0 %	512656380
82	NC_021503	A	7	7	35471	35477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021503	A	7	7	35632	35638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021503	T	6	6	36073	36078	0 %	100 %	0 %	0 %	512656382
85	NC_021503	T	6	6	36662	36667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021503	A	6	6	36878	36883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021503	T	6	6	37274	37279	0 %	100 %	0 %	0 %	512656383
88	NC_021503	T	6	6	37579	37584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021503	T	7	7	37832	37838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021503	T	7	7	39349	39355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021503	A	6	6	39681	39686	100 %	0 %	0 %	0 %	512656385
92	NC_021503	A	8	8	40927	40934	100 %	0 %	0 %	0 %	512656385
93	NC_021503	T	6	6	41076	41081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021503	T	8	8	41099	41106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021503	T	6	6	41382	41387	0 %	100 %	0 %	0 %	512656386
96	NC_021503	T	6	6	42252	42257	0 %	100 %	0 %	0 %	512656387
97	NC_021503	T	7	7	42518	42524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021503	A	6	6	44494	44499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021503	T	6	6	44850	44855	0 %	100 %	0 %	0 %	512656390
100	NC_021503	T	6	6	45200	45205	0 %	100 %	0 %	0 %	512656392
101	NC_021503	A	7	7	48341	48347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021503	T	7	7	48509	48515	0 %	100 %	0 %	0 %	512656395
103	NC_021503	T	6	6	48557	48562	0 %	100 %	0 %	0 %	512656395
104	NC_021503	T	6	6	49188	49193	0 %	100 %	0 %	0 %	512656396
105	NC_021503	A	8	8	49390	49397	100 %	0 %	0 %	0 %	512656396
106	NC_021503	A	6	6	49847	49852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021503	A	7	7	49885	49891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021503	A	6	6	50594	50599	100 %	0 %	0 %	0 %	512656398
109	NC_021503	T	6	6	51443	51448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021503	A	6	6	51766	51771	100 %	0 %	0 %	0 %	512656399
111	NC_021503	A	6	6	52983	52988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.