MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	CTTCAT	2	12	8227	8238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512442360
2	NC_021501	TTAAAA	2	12	9827	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021501	TCCATC	2	12	10339	10350	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021501	GCTGGT	2	12	12706	12717	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512442363
5	NC_021501	ACAGTG	2	12	21748	21759	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512442373
6	NC_021501	GACAGC	2	12	21760	21771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512442373
7	NC_021501	GCCCTG	2	12	22804	22815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512442376
8	NC_021501	GCTTCG	2	12	26878	26889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512442380
9	NC_021501	TTCAGG	2	12	28957	28968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512442383
10	NC_021501	TATCCA	2	12	29417	29428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512442383
11	NC_021501	TTGTCC	2	12	29680	29691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021501	CGGTGG	2	12	35482	35493	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512442387
13	NC_021501	AAGGCC	2	12	37493	37504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512442390
14	NC_021501	CGCTGG	2	12	37976	37987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512442391
15	NC_021501	TGCAGC	2	12	38065	38076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512442391
16	NC_021501	GGCCGG	2	12	38937	38948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512442393
17	NC_021501	GTTCAG	2	12	42149	42160	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512442395
18	NC_021501	GCGGCT	2	12	43502	43513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021501	ATCGAC	2	12	46678	46689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512442399
20	NC_021501	ACGCCT	2	12	49143	49154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021501	CCCCGG	2	12	49755	49766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512442402
22	NC_021501	CAATTT	2	12	52581	52592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512442405
23	NC_021501	CCGATG	2	12	56403	56414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512442409
24	NC_021501	GACTCA	2	12	56705	56716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512442409
25	NC_021501	CGGGCG	2	12	60336	60347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512442412
26	NC_021501	CGGGTT	2	12	60953	60964	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512442412
27	NC_021501	GAGCGC	2	12	63577	63588	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512442416
28	NC_021501	CAGCGT	2	12	63892	63903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512442416
29	NC_021501	CAGCAT	2	12	64240	64251	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512442417
30	NC_021501	GCCGTC	2	12	65520	65531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512442418
31	NC_021501	CTGCGC	2	12	66305	66316	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512442418
32	NC_021501	AGGCTG	2	12	67275	67286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512442418
33	NC_021501	CCGACA	2	12	68797	68808	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512442418
34	NC_021501	GTCTCA	2	12	69321	69332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512442418
35	NC_021501	TTGCGC	2	12	82473	82484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512442429
36	NC_021501	CCTTCA	2	12	86326	86337	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512442432
37	NC_021501	GCATCC	2	12	86457	86468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512442432
38	NC_021501	TCCATC	2	12	86529	86540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512442432
39	NC_021501	TCCTGC	2	12	88380	88391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021501	ATCAAA	2	12	93217	93228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021501	TGAATT	2	12	96028	96039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021501	CAAGCT	2	12	96775	96786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512442446
43	NC_021501	GTTGCT	2	12	98229	98240	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021501	TGACGT	2	12	98647	98658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512442449
45	NC_021501	AGCCGA	2	12	102746	102757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512442454
46	NC_021501	TGCTTT	2	12	103218	103229	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512442454
47	NC_021501	AACGGG	2	12	104073	104084	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021501	ATCCTT	2	12	106068	106079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021501	CAGGAA	2	12	109404	109415	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.