MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	GGATC	2	10	1446	1455	20 %	20 %	40 %	20 %	512442355
2	NC_021501	ACGCA	2	10	3630	3639	40 %	0 %	20 %	40 %	512442357
3	NC_021501	GTGAT	2	10	4581	4590	20 %	40 %	40 %	0 %	512442358
4	NC_021501	GATCA	2	10	5096	5105	40 %	20 %	20 %	20 %	512442359
5	NC_021501	GCAAA	2	10	5138	5147	60 %	0 %	20 %	20 %	512442359
6	NC_021501	ATGCG	2	10	7396	7405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021501	AATAA	2	10	9493	9502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021501	CATAT	2	10	9561	9570	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021501	ATCCA	2	10	9861	9870	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021501	GTGAT	2	10	10630	10639	20 %	40 %	40 %	0 %	512442362
11	NC_021501	CCAGC	2	10	11578	11587	20 %	0 %	20 %	60 %	512442363
12	NC_021501	GGGCT	2	10	12476	12485	0 %	20 %	60 %	20 %	512442363
13	NC_021501	GTGAA	2	10	13490	13499	40 %	20 %	40 %	0 %	512442364
14	NC_021501	CGAAG	2	10	13662	13671	40 %	0 %	40 %	20 %	512442364
15	NC_021501	CATGC	2	10	13870	13879	20 %	20 %	20 %	40 %	512442364
16	NC_021501	TCATT	2	10	16439	16448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021501	TGCTC	2	10	17081	17090	0 %	40 %	20 %	40 %	512442368
18	NC_021501	AGGCC	2	10	17270	17279	20 %	0 %	40 %	40 %	512442368
19	NC_021501	GCAGC	2	10	17801	17810	20 %	0 %	40 %	40 %	512442369
20	NC_021501	ACAAA	2	10	19601	19610	80 %	0 %	0 %	20 %	512442369
21	NC_021501	AGTTG	2	10	21459	21468	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021501	GCCCG	2	10	22352	22361	0 %	0 %	40 %	60 %	512442375
23	NC_021501	TGGTC	2	10	22373	22382	0 %	40 %	40 %	20 %	512442375
24	NC_021501	GCCTG	2	10	22450	22459	0 %	20 %	40 %	40 %	512442375
25	NC_021501	GCATT	2	10	22594	22603	20 %	40 %	20 %	20 %	512442376
26	NC_021501	GATGC	2	10	24123	24132	20 %	20 %	40 %	20 %	512442377
27	NC_021501	TCATT	2	10	24935	24944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021501	GCCGT	2	10	28310	28319	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021501	CTTCT	2	10	36048	36057	0 %	60 %	0 %	40 %	512442388
30	NC_021501	GCACC	2	10	36832	36841	20 %	0 %	20 %	60 %	512442390
31	NC_021501	CGATA	2	10	40068	40077	40 %	20 %	20 %	20 %	512442394
32	NC_021501	GAGTA	2	10	40278	40287	40 %	20 %	40 %	0 %	512442394
33	NC_021501	CGGAT	2	10	40326	40335	20 %	20 %	40 %	20 %	512442394
34	NC_021501	GAAAA	2	10	40472	40481	80 %	0 %	20 %	0 %	512442394
35	NC_021501	ATCGG	2	10	41153	41162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021501	TGGCT	2	10	41167	41176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021501	GCGCG	2	10	41426	41435	0 %	0 %	60 %	40 %	512442395
38	NC_021501	CCCTG	2	10	41665	41674	0 %	20 %	20 %	60 %	512442395
39	NC_021501	CGCGG	2	10	42822	42831	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021501	GCTGC	2	10	44639	44648	0 %	20 %	40 %	40 %	512442397
41	NC_021501	GCGCC	2	10	45739	45748	0 %	0 %	40 %	60 %	512442398
42	NC_021501	CAGCG	2	10	47608	47617	20 %	0 %	40 %	40 %	512442400
43	NC_021501	GGGAT	2	10	47751	47760	20 %	20 %	60 %	0 %	512442400
44	NC_021501	CGGGG	2	10	48456	48465	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021501	GCATG	2	10	49922	49931	20 %	20 %	40 %	20 %	512442402
46	NC_021501	GGGGA	2	10	54922	54931	20 %	0 %	80 %	0 %	512442408
47	NC_021501	TCCTG	2	10	55092	55101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021501	CACGT	2	10	56635	56644	20 %	20 %	20 %	40 %	512442409
49	NC_021501	ACCAC	2	10	57301	57310	40 %	0 %	0 %	60 %	512442410
50	NC_021501	CCTTT	2	10	57727	57736	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021501	TTTGC	2	10	57923	57932	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021501	AACAT	2	10	59014	59023	60 %	20 %	0 %	20 %	512442411
53	NC_021501	TGCCG	2	10	59690	59699	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021501	CCCGG	2	10	63819	63828	0 %	0 %	40 %	60 %	512442416
55	NC_021501	ATCAC	2	10	63990	63999	40 %	20 %	0 %	40 %	512442417
56	NC_021501	GCCAG	2	10	64293	64302	20 %	0 %	40 %	40 %	512442417
57	NC_021501	CGCCT	2	10	65153	65162	0 %	20 %	20 %	60 %	512442418
58	NC_021501	GCGCG	2	10	65482	65491	0 %	0 %	60 %	40 %	512442418
59	NC_021501	GCGCT	2	10	66615	66624	0 %	20 %	40 %	40 %	512442418
60	NC_021501	GCGCA	2	10	68396	68405	20 %	0 %	40 %	40 %	512442418
61	NC_021501	CCGAT	2	10	69952	69961	20 %	20 %	20 %	40 %	512442418
62	NC_021501	GCAGC	2	10	71477	71486	20 %	0 %	40 %	40 %	512442419
63	NC_021501	AGTAA	2	10	74293	74302	60 %	20 %	20 %	0 %	512442420
64	NC_021501	CTGCG	2	10	74595	74604	0 %	20 %	40 %	40 %	512442420
65	NC_021501	ATGCA	2	10	74740	74749	40 %	20 %	20 %	20 %	512442420
66	NC_021501	CACTA	2	10	74860	74869	40 %	20 %	0 %	40 %	512442420
67	NC_021501	GCCCA	2	10	76193	76202	20 %	0 %	20 %	60 %	512442420
68	NC_021501	GGCGC	2	10	79297	79306	0 %	0 %	60 %	40 %	512442425
69	NC_021501	TGTTT	2	10	81273	81282	0 %	80 %	20 %	0 %	512442427
70	NC_021501	CGGGT	2	10	81983	81992	0 %	20 %	60 %	20 %	512442428
71	NC_021501	CGGTA	2	10	84904	84913	20 %	20 %	40 %	20 %	512442432
72	NC_021501	CTGCG	2	10	91458	91467	0 %	20 %	40 %	40 %	512442439
73	NC_021501	CCCCA	2	10	91977	91986	20 %	0 %	0 %	80 %	512442440
74	NC_021501	ATGGG	2	10	94618	94627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021501	TAAAT	2	10	95203	95212	60 %	40 %	0 %	0 %	512442445
76	NC_021501	ATCTC	2	10	99651	99660	20 %	40 %	0 %	40 %	512442450
77	NC_021501	GATAT	2	10	99704	99713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021501	CAGCG	2	10	100017	100026	20 %	0 %	40 %	40 %	512442451
79	NC_021501	CCGCG	2	10	100668	100677	0 %	0 %	40 %	60 %	512442452
80	NC_021501	ACGGA	2	10	101808	101817	40 %	0 %	40 %	20 %	512442454
81	NC_021501	TGCCC	2	10	102785	102794	0 %	20 %	20 %	60 %	512442454
82	NC_021501	CTTTT	2	10	104189	104198	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021501	GGAGA	2	10	104855	104864	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021501	CGACA	2	10	105763	105772	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021501	CGCAG	2	10	105813	105822	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021501	CAAAG	2	10	106716	106725	60 %	0 %	20 %	20 %	512442460
87	NC_021501	CACCG	2	10	107152	107161	20 %	0 %	20 %	60 %	512442461
88	NC_021501	ATTCC	2	10	107250	107259	20 %	40 %	0 %	40 %	512442461
89	NC_021501	CGCAG	2	10	108372	108381	20 %	0 %	40 %	40 %	512442464
90	NC_021501	CTGTT	2	10	109685	109694	0 %	60 %	20 %	20 %	512442467
91	NC_021501	ATGCG	2	10	110602	110611	20 %	20 %	40 %	20 %	512442467

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.