MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	AATA	2	8	4098	4105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021501	TACC	2	8	4153	4160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021501	CCAG	2	8	6063	6070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021501	TTAT	2	8	6095	6102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021501	AAAT	2	8	6513	6520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021501	GCTT	2	8	6582	6589	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021501	GGCT	2	8	7291	7298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021501	TCAT	2	8	7324	7331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021501	ATTT	2	8	7615	7622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021501	CAGC	2	8	7623	7630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021501	TGGT	2	8	8796	8803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021501	TTCA	2	8	9762	9769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021501	AAAT	2	8	10191	10198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021501	TTTA	2	8	11166	11173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021501	AATA	2	8	14817	14824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021501	GCTG	2	8	14849	14856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021501	ACGC	2	8	14871	14878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021501	AAGG	2	8	16394	16401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021501	TTTA	2	8	20043	20050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021501	AAGG	2	8	20072	20079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021501	TGGC	2	8	20670	20677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021501	TGGC	2	8	21520	21527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021501	AAGG	2	8	24890	24897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021501	GCCG	2	8	27248	27255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021501	ATGT	2	8	27389	27396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021501	GTGC	2	8	27612	27619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021501	AGTG	2	8	27785	27792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021501	GGCC	2	8	28237	28244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021501	AGTG	2	8	28411	28418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021501	ACTG	2	8	32754	32761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021501	CAGC	2	8	32914	32921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021501	CCAG	2	8	33174	33181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021501	CTTG	2	8	34099	34106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021501	TTGA	2	8	36126	36133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021501	GGGC	2	8	36226	36233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021501	CCTG	2	8	43465	43472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021501	TGCG	2	8	43617	43624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021501	CGCC	2	8	48302	48309	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021501	GCTC	2	8	48503	48510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021501	AAGT	2	8	53494	53501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021501	GAAG	2	8	55750	55757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021501	TCAT	2	8	57642	57649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021501	GTAA	2	8	59057	59064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021501	CCTG	2	8	59113	59120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021501	ATCC	2	8	59351	59358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021501	CAGG	2	8	59635	59642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021501	TGAG	2	8	59658	59665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021501	GGGC	2	8	59771	59778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021501	ATGA	2	8	59830	59837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021501	AGGA	2	8	60048	60055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021501	CCAA	2	8	61244	61251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021501	CTGA	2	8	63961	63968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021501	AATG	2	8	72342	72349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021501	TAAC	2	8	73455	73462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021501	CCAG	2	8	73466	73473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021501	CCTT	2	8	79716	79723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021501	TGAG	2	8	79942	79949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021501	GTAC	2	8	88245	88252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021501	GCAG	2	8	88327	88334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021501	TAAT	2	8	93284	93291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021501	TTTA	2	8	93313	93320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021501	GAAA	2	8	93489	93496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021501	GATT	2	8	93533	93540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021501	GCAG	2	8	96247	96254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021501	CGGT	2	8	97443	97450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021501	TGGC	2	8	98033	98040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021501	CGTT	2	8	99192	99199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021501	TGAT	2	8	103262	103269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021501	GCCC	2	8	104049	104056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_021501	TTCC	2	8	104276	104283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021501	GCTG	2	8	108395	108402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021501	TGTA	2	8	109455	109462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.