MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	CATA	2	8	427	434	50 %	25 %	0 %	25 %	512442354
2	NC_021501	CGGC	2	8	810	817	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
3	NC_021501	TGCT	2	8	938	945	0 %	50 %	25 %	25 %	512442355
4	NC_021501	CCGT	2	8	1130	1137	0 %	25 %	25 %	50 %	512442355
5	NC_021501	GAAC	2	8	1353	1360	50 %	0 %	25 %	25 %	512442355
6	NC_021501	TTTC	2	8	1981	1988	0 %	75 %	0 %	25 %	512442356
7	NC_021501	AACG	2	8	2662	2669	50 %	0 %	25 %	25 %	512442356
8	NC_021501	ATCC	2	8	2987	2994	25 %	25 %	0 %	50 %	512442357
9	NC_021501	ACTG	2	8	3657	3664	25 %	25 %	25 %	25 %	512442357
10	NC_021501	TTTC	2	8	3842	3849	0 %	75 %	0 %	25 %	512442357
11	NC_021501	GCTG	2	8	4499	4506	0 %	25 %	50 %	25 %	512442358
12	NC_021501	ACCA	2	8	4696	4703	50 %	0 %	0 %	50 %	512442358
13	NC_021501	CTGG	2	8	4961	4968	0 %	25 %	50 %	25 %	512442358
14	NC_021501	CTGG	2	8	5212	5219	0 %	25 %	50 %	25 %	512442359
15	NC_021501	TGAT	2	8	5490	5497	25 %	50 %	25 %	0 %	512442359
16	NC_021501	GTGC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	512442359
17	NC_021501	GCGT	2	8	6042	6049	0 %	25 %	50 %	25 %	512442359
18	NC_021501	TGCC	2	8	7868	7875	0 %	25 %	25 %	50 %	512442360
19	NC_021501	CGCC	2	8	8015	8022	0 %	0 %	25 %	75 %	512442360
20	NC_021501	ATAG	2	8	9907	9914	50 %	25 %	25 %	0 %	512442361
21	NC_021501	TGGA	2	8	10073	10080	25 %	25 %	50 %	0 %	512442361
22	NC_021501	CCGC	2	8	10538	10545	0 %	0 %	25 %	75 %	512442362
23	NC_021501	GCTG	2	8	10696	10703	0 %	25 %	50 %	25 %	512442362
24	NC_021501	TGGC	2	8	10829	10836	0 %	25 %	50 %	25 %	512442362
25	NC_021501	TGCC	2	8	11338	11345	0 %	25 %	25 %	50 %	512442363
26	NC_021501	GCTG	2	8	12340	12347	0 %	25 %	50 %	25 %	512442363
27	NC_021501	GCCG	2	8	12688	12695	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
28	NC_021501	CGTG	2	8	12796	12803	0 %	25 %	50 %	25 %	512442363
29	NC_021501	CCTC	2	8	12972	12979	0 %	25 %	0 %	75 %	512442363
30	NC_021501	CGTG	2	8	14121	14128	0 %	25 %	50 %	25 %	512442364
31	NC_021501	GCCC	2	8	14304	14311	0 %	0 %	25 %	75 %	512442364
32	NC_021501	GCCA	2	8	15330	15337	25 %	0 %	25 %	50 %	512442366
33	NC_021501	CAGC	2	8	15463	15470	25 %	0 %	25 %	50 %	512442366
34	NC_021501	GCGG	2	8	15621	15628	0 %	0 %	75 %	25 %	512442367
35	NC_021501	GCTG	2	8	16742	16749	0 %	25 %	50 %	25 %	512442368
36	NC_021501	CAGC	2	8	17513	17520	25 %	0 %	25 %	50 %	512442369
37	NC_021501	GGCT	2	8	19546	19553	0 %	25 %	50 %	25 %	512442369
38	NC_021501	CCGC	2	8	20379	20386	0 %	0 %	25 %	75 %	512442370
39	NC_021501	GCTG	2	8	20537	20544	0 %	25 %	50 %	25 %	512442371
40	NC_021501	AGTG	2	8	22716	22723	25 %	25 %	50 %	0 %	512442376
41	NC_021501	TCGC	2	8	22831	22838	0 %	25 %	25 %	50 %	512442376
42	NC_021501	GCAG	2	8	22918	22925	25 %	0 %	50 %	25 %	512442376
43	NC_021501	CAGC	2	8	22968	22975	25 %	0 %	25 %	50 %	512442376
44	NC_021501	ACCG	2	8	23065	23072	25 %	0 %	25 %	50 %	512442376
45	NC_021501	TGAA	2	8	23090	23097	50 %	25 %	25 %	0 %	512442376
46	NC_021501	AGTC	2	8	23234	23241	25 %	25 %	25 %	25 %	512442376
47	NC_021501	GCAG	2	8	23719	23726	25 %	0 %	50 %	25 %	512442377
48	NC_021501	GCAC	2	8	23739	23746	25 %	0 %	25 %	50 %	512442377
49	NC_021501	CAGC	2	8	24388	24395	25 %	0 %	25 %	50 %	512442377
50	NC_021501	GCCA	2	8	25630	25637	25 %	0 %	25 %	50 %	512442378
51	NC_021501	GCGG	2	8	25905	25912	0 %	0 %	75 %	25 %	512442379
52	NC_021501	CGGG	2	8	26863	26870	0 %	0 %	75 %	25 %	512442380
53	NC_021501	AATG	2	8	28838	28845	50 %	25 %	25 %	0 %	512442383
54	NC_021501	TTCA	2	8	31236	31243	25 %	50 %	0 %	25 %	512442384
55	NC_021501	TGCA	2	8	31682	31689	25 %	25 %	25 %	25 %	512442385
56	NC_021501	GCTG	2	8	31869	31876	0 %	25 %	50 %	25 %	512442385
57	NC_021501	GCGG	2	8	33761	33768	0 %	0 %	75 %	25 %	512442386
58	NC_021501	CGGC	2	8	33875	33882	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
59	NC_021501	CCTT	2	8	35244	35251	0 %	50 %	0 %	50 %	512442387
60	NC_021501	CTTC	2	8	35533	35540	0 %	50 %	0 %	50 %	512442387
61	NC_021501	TGGC	2	8	36598	36605	0 %	25 %	50 %	25 %	512442389
62	NC_021501	GCTG	2	8	36663	36670	0 %	25 %	50 %	25 %	512442390
63	NC_021501	CGGC	2	8	36975	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	512442390
64	NC_021501	TGGA	2	8	37307	37314	25 %	25 %	50 %	0 %	512442390
65	NC_021501	ATCT	2	8	37328	37335	25 %	50 %	0 %	25 %	512442390
66	NC_021501	CCGC	2	8	38243	38250	0 %	0 %	25 %	75 %	512442391
67	NC_021501	GATC	2	8	38361	38368	25 %	25 %	25 %	25 %	512442392
68	NC_021501	ATCG	2	8	40787	40794	25 %	25 %	25 %	25 %	512442394
69	NC_021501	CGGC	2	8	41206	41213	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
70	NC_021501	CAGC	2	8	41862	41869	25 %	0 %	25 %	50 %	512442395
71	NC_021501	AGCC	2	8	41979	41986	25 %	0 %	25 %	50 %	512442395
72	NC_021501	AGCG	2	8	42558	42565	25 %	0 %	50 %	25 %	512442395
73	NC_021501	CGCC	2	8	44121	44128	0 %	0 %	25 %	75 %	512442396
74	NC_021501	CCGA	2	8	45116	45123	25 %	0 %	25 %	50 %	512442398
75	NC_021501	CCCG	2	8	45916	45923	0 %	0 %	25 %	75 %	512442399
76	NC_021501	GCCG	2	8	47399	47406	0 %	0 %	50 %	50 %	512442400
77	NC_021501	GTTC	2	8	48961	48968	0 %	50 %	25 %	25 %	512442401
78	NC_021501	GCCT	2	8	49022	49029	0 %	25 %	25 %	50 %	512442401
79	NC_021501	GTAT	2	8	50720	50727	25 %	50 %	25 %	0 %	512442403
80	NC_021501	GCCA	2	8	51726	51733	25 %	0 %	25 %	50 %	512442404
81	NC_021501	ATCA	2	8	52375	52382	50 %	25 %	0 %	25 %	512442405
82	NC_021501	GAAA	2	8	52542	52549	75 %	0 %	25 %	0 %	512442405
83	NC_021501	TCAT	2	8	52670	52677	25 %	50 %	0 %	25 %	512442405
84	NC_021501	GTCG	2	8	52773	52780	0 %	25 %	50 %	25 %	512442405
85	NC_021501	TGCA	2	8	53775	53782	25 %	25 %	25 %	25 %	512442407
86	NC_021501	GCTG	2	8	53962	53969	0 %	25 %	50 %	25 %	512442407
87	NC_021501	CACT	2	8	56438	56445	25 %	25 %	0 %	50 %	512442409
88	NC_021501	TGCC	2	8	57169	57176	0 %	25 %	25 %	50 %	512442410
89	NC_021501	TCAA	2	8	57184	57191	50 %	25 %	0 %	25 %	512442410
90	NC_021501	AGAA	2	8	58472	58479	75 %	0 %	25 %	0 %	512442411
91	NC_021501	ATTG	2	8	58952	58959	25 %	50 %	25 %	0 %	512442411
92	NC_021501	TCGG	2	8	60564	60571	0 %	25 %	50 %	25 %	512442412
93	NC_021501	AGCG	2	8	60834	60841	25 %	0 %	50 %	25 %	512442412
94	NC_021501	ATGG	2	8	60854	60861	25 %	25 %	50 %	0 %	512442412
95	NC_021501	GTCA	2	8	61001	61008	25 %	25 %	25 %	25 %	512442412
96	NC_021501	TGAG	2	8	61377	61384	25 %	25 %	50 %	0 %	512442413
97	NC_021501	TTTC	2	8	61534	61541	0 %	75 %	0 %	25 %	512442413
98	NC_021501	AGGT	2	8	61783	61790	25 %	25 %	50 %	0 %	512442414
99	NC_021501	CATG	2	8	61913	61920	25 %	25 %	25 %	25 %	512442414
100	NC_021501	CTGG	2	8	61983	61990	0 %	25 %	50 %	25 %	512442414
101	NC_021501	GTTC	2	8	63249	63256	0 %	50 %	25 %	25 %	512442416
102	NC_021501	CCGT	2	8	63542	63549	0 %	25 %	25 %	50 %	512442416
103	NC_021501	CCTC	2	8	63657	63664	0 %	25 %	0 %	75 %	512442416
104	NC_021501	CAGG	2	8	63776	63783	25 %	0 %	50 %	25 %	512442416
105	NC_021501	CATA	2	8	64222	64229	50 %	25 %	0 %	25 %	512442417
106	NC_021501	GGCG	2	8	64494	64501	0 %	0 %	75 %	25 %	512442417
107	NC_021501	GGTC	2	8	64635	64642	0 %	25 %	50 %	25 %	512442417
108	NC_021501	CAGC	2	8	64672	64679	25 %	0 %	25 %	50 %	512442417
109	NC_021501	CCGG	2	8	64950	64957	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
110	NC_021501	CGCC	2	8	65362	65369	0 %	0 %	25 %	75 %	512442418
111	NC_021501	GGCA	2	8	65495	65502	25 %	0 %	50 %	25 %	512442418
112	NC_021501	GGCG	2	8	65533	65540	0 %	0 %	75 %	25 %	512442418
113	NC_021501	GCTC	2	8	65752	65759	0 %	25 %	25 %	50 %	512442418
114	NC_021501	CTGC	2	8	65812	65819	0 %	25 %	25 %	50 %	512442418
115	NC_021501	GACC	2	8	65891	65898	25 %	0 %	25 %	50 %	512442418
116	NC_021501	GCCG	2	8	66392	66399	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
117	NC_021501	CGTT	2	8	66794	66801	0 %	50 %	25 %	25 %	512442418
118	NC_021501	GGTG	2	8	66895	66902	0 %	25 %	75 %	0 %	512442418
119	NC_021501	ACCC	2	8	66986	66993	25 %	0 %	0 %	75 %	512442418
120	NC_021501	CTTC	2	8	68320	68327	0 %	50 %	0 %	50 %	512442418
121	NC_021501	TTTC	2	8	68425	68432	0 %	75 %	0 %	25 %	512442418
122	NC_021501	GGCC	2	8	68644	68651	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
123	NC_021501	CGCC	2	8	68981	68988	0 %	0 %	25 %	75 %	512442418
124	NC_021501	CAGC	2	8	70446	70453	25 %	0 %	25 %	50 %	512442419
125	NC_021501	GAAT	2	8	70497	70504	50 %	25 %	25 %	0 %	512442419
126	NC_021501	CCGA	2	8	70649	70656	25 %	0 %	25 %	50 %	512442419
127	NC_021501	CAGC	2	8	71071	71078	25 %	0 %	25 %	50 %	512442419
128	NC_021501	CTTC	2	8	71394	71401	0 %	50 %	0 %	50 %	512442419
129	NC_021501	GGCG	2	8	71586	71593	0 %	0 %	75 %	25 %	512442419
130	NC_021501	CAGA	2	8	71647	71654	50 %	0 %	25 %	25 %	512442419
131	NC_021501	TTTA	2	8	73711	73718	25 %	75 %	0 %	0 %	512442420
132	NC_021501	CCTG	2	8	74429	74436	0 %	25 %	25 %	50 %	512442420
133	NC_021501	TCTG	2	8	74972	74979	0 %	50 %	25 %	25 %	512442420
134	NC_021501	GACC	2	8	75420	75427	25 %	0 %	25 %	50 %	512442420
135	NC_021501	GCAG	2	8	76070	76077	25 %	0 %	50 %	25 %	512442420
136	NC_021501	TGCG	2	8	77548	77555	0 %	25 %	50 %	25 %	512442421
137	NC_021501	TGGC	2	8	77610	77617	0 %	25 %	50 %	25 %	512442421
138	NC_021501	CGCT	2	8	77684	77691	0 %	25 %	25 %	50 %	512442421
139	NC_021501	GCCC	2	8	78022	78029	0 %	0 %	25 %	75 %	512442422
140	NC_021501	CAGG	2	8	78917	78924	25 %	0 %	50 %	25 %	512442424
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.