MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	ATA	3	9	1792	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021501	ACA	2	6	4113	4118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021501	ATT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021501	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021501	CAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021501	TTG	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021501	CAA	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021501	CCA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021501	ACA	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021501	TGA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021501	TAT	2	6	6448	6453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021501	AAT	2	6	6550	6555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021501	AGA	2	6	6567	6572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021501	TGA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021501	TCA	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021501	AGC	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021501	TAA	2	6	7034	7039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021501	ATT	2	6	7158	7163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021501	GCT	2	6	7189	7194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021501	ATT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021501	TAA	2	6	7384	7389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021501	TGC	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021501	GAT	2	6	7563	7568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021501	TTA	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021501	CAG	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021501	CGT	2	6	8736	8741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021501	CTA	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021501	TGA	2	6	8905	8910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021501	TTA	2	6	8929	8934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021501	TTC	2	6	8994	8999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021501	GAA	2	6	9017	9022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021501	TTA	2	6	9067	9072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021501	CAT	2	6	9105	9110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021501	ATA	2	6	9165	9170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021501	AAT	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021501	TTA	2	6	9230	9235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021501	TTA	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021501	ATA	2	6	9386	9391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021501	AAG	2	6	9533	9538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021501	CAT	2	6	9770	9775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021501	TAA	2	6	9780	9785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021501	AGA	2	6	10156	10161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021501	TAA	2	6	10165	10170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021501	AGT	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021501	CCT	2	6	10358	10363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021501	GTG	2	6	10381	10386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021501	TTA	2	6	13307	13312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021501	TCA	2	6	13324	13329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021501	TCA	2	6	13349	13354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021501	CGG	2	6	14650	14655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021501	CGC	2	6	14682	14687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021501	GTC	2	6	14887	14892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021501	CAT	2	6	15853	15858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021501	GCA	2	6	15878	15883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021501	TCA	2	6	15909	15914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021501	TTG	2	6	15964	15969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021501	AAT	2	6	16110	16115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021501	ATC	2	6	16325	16330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021501	TTC	2	6	16420	16425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021501	TTC	2	6	16510	16515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021501	GGT	2	6	16597	16602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021501	ATC	2	6	16612	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021501	TTC	2	6	20098	20103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021501	TGC	2	6	20124	20129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021501	ATG	2	6	20149	20154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021501	GCA	2	6	20766	20771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021501	CTT	2	6	21077	21082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021501	TAT	2	6	21107	21112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021501	AAT	2	6	21128	21133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021501	AGC	2	6	21338	21343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021501	CAG	2	6	21607	21612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021501	CGT	2	6	23400	23405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021501	TTC	2	6	24916	24921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021501	TTC	2	6	25006	25011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021501	GGA	2	6	25761	25766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021501	ACA	2	6	25806	25811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021501	GCA	2	6	27206	27211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021501	TAT	2	6	27217	27222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021501	CTT	2	6	27354	27359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021501	AAC	2	6	27642	27647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021501	GTT	2	6	27683	27688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021501	CCG	2	6	27718	27723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021501	ACG	2	6	27731	27736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021501	CTG	2	6	27771	27776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021501	CTC	2	6	27795	27800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021501	CCA	2	6	27838	27843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021501	CAC	2	6	28039	28044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021501	CCG	2	6	28051	28056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021501	GGC	2	6	28297	28302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021501	ATG	2	6	28335	28340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021501	TCC	2	6	28350	28355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_021501	TGG	2	6	28521	28526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021501	TTG	2	6	28531	28536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021501	TCA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021501	GCA	2	6	28617	28622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021501	AGC	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021501	TGA	2	6	29797	29802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021501	TTA	2	6	29843	29848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021501	ATA	2	6	29864	29869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021501	TCT	2	6	29970	29975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021501	TTA	2	6	30006	30011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021501	CTG	2	6	30042	30047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021501	CAA	2	6	30097	30102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021501	GCG	2	6	30180	30185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021501	TTC	2	6	30283	30288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021501	TAT	2	6	30414	30419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021501	CAA	2	6	30468	30473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021501	AGC	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021501	GAC	2	6	30564	30569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021501	GAA	2	6	30582	30587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021501	GCA	2	6	30591	30596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021501	CGT	2	6	30672	30677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021501	CTC	2	6	30681	30686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021501	GAG	2	6	30690	30695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021501	CGC	2	6	30758	30763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021501	TAA	2	6	30786	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021501	GAA	2	6	32497	32502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021501	GAA	2	6	32559	32564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021501	GAA	2	6	32587	32592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021501	CAA	2	6	32895	32900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021501	TCA	2	6	33081	33086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021501	TGT	2	6	33113	33118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021501	ATG	2	6	33217	33222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021501	CCG	2	6	33223	33228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021501	GCT	2	6	33237	33242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021501	CGC	2	6	33363	33368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021501	TGT	2	6	33447	33452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021501	AGC	2	6	33460	33465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021501	ATT	2	6	33517	33522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021501	TCC	2	6	33571	33576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021501	AAT	2	6	33704	33709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021501	GCT	2	6	33955	33960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021501	ATT	2	6	35780	35785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021501	ACA	2	6	36188	36193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021501	CCG	2	6	36234	36239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021501	CCG	2	6	36274	36279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021501	GAT	2	6	39558	39563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021501	CAA	2	6	39643	39648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021501	ATT	2	6	39718	39723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021501	TCC	2	6	39772	39777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021501	AAT	2	6	39905	39910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021501	TAT	2	6	40020	40025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021501	TCT	2	6	40042	40047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021501	ATT	2	6	40924	40929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021501	TAA	2	6	40931	40936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_021501	CAA	2	6	42835	42840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_021501	CGC	2	6	43027	43032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_021501	GTA	2	6	43069	43074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021501	AGC	2	6	43115	43120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021501	TGC	2	6	43206	43211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021501	CAA	2	6	43245	43250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021501	GCC	2	6	43283	43288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_021501	CGG	2	6	43331	43336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_021501	GGC	2	6	44258	44263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_021501	TCG	2	6	46865	46870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021501	TCA	2	6	46929	46934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021501	TTC	2	6	47028	47033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_021501	GCC	2	6	48082	48087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_021501	GGC	2	6	48165	48170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_021501	CGG	2	6	48482	48487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_021501	TGG	2	6	48643	48648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021501	CGG	2	6	48747	48752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_021501	CGC	2	6	49240	49245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_021501	GAG	2	6	49323	49328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_021501	CGG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_021501	ATC	2	6	93182	93187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_021501	CCT	2	6	93657	93662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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276	NC_021501	GAC	2	6	94331	94336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.