MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	CG	3	6	567	572	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
2	NC_021501	CG	3	6	731	736	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
3	NC_021501	GC	4	8	1075	1082	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
4	NC_021501	GA	3	6	1123	1128	50 %	0 %	50 %	0 %	512442355
5	NC_021501	TC	3	6	2015	2020	0 %	50 %	0 %	50 %	512442356
6	NC_021501	CG	3	6	2293	2298	0 %	0 %	50 %	50 %	512442356
7	NC_021501	GA	4	8	2313	2320	50 %	0 %	50 %	0 %	512442356
8	NC_021501	AT	3	6	2454	2459	50 %	50 %	0 %	0 %	512442356
9	NC_021501	TC	3	6	2682	2687	0 %	50 %	0 %	50 %	512442356
10	NC_021501	AT	3	6	3821	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	512442357
11	NC_021501	TA	4	8	4297	4304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021501	AC	3	6	5601	5606	50 %	0 %	0 %	50 %	512442359
13	NC_021501	GC	3	6	5766	5771	0 %	0 %	50 %	50 %	512442359
14	NC_021501	TA	4	8	6878	6885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021501	AG	3	6	8623	8628	50 %	0 %	50 %	0 %	512442360
16	NC_021501	TA	3	6	9316	9321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021501	AC	3	6	10486	10491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021501	AT	3	6	11128	11133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021501	TA	3	6	11182	11187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021501	CT	3	6	11289	11294	0 %	50 %	0 %	50 %	512442363
21	NC_021501	TC	3	6	11788	11793	0 %	50 %	0 %	50 %	512442363
22	NC_021501	GC	3	6	11802	11807	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
23	NC_021501	GC	3	6	12322	12327	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
24	NC_021501	TG	3	6	12361	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	512442363
25	NC_021501	GC	3	6	12893	12898	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
26	NC_021501	GC	3	6	13678	13683	0 %	0 %	50 %	50 %	512442364
27	NC_021501	TC	3	6	14295	14300	0 %	50 %	0 %	50 %	512442364
28	NC_021501	TC	3	6	16551	16556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021501	TC	3	6	16955	16960	0 %	50 %	0 %	50 %	512442368
30	NC_021501	CG	3	6	17073	17078	0 %	0 %	50 %	50 %	512442368
31	NC_021501	GA	3	6	17884	17889	50 %	0 %	50 %	0 %	512442369
32	NC_021501	GC	3	6	18736	18741	0 %	0 %	50 %	50 %	512442369
33	NC_021501	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	512442369
34	NC_021501	AT	3	6	19828	19833	50 %	50 %	0 %	0 %	512442369
35	NC_021501	GC	3	6	21243	21248	0 %	0 %	50 %	50 %	512442372
36	NC_021501	GC	3	6	21332	21337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021501	GC	3	6	21849	21854	0 %	0 %	50 %	50 %	512442373
38	NC_021501	TC	3	6	25047	25052	0 %	50 %	0 %	50 %	512442378
39	NC_021501	CA	3	6	26631	26636	50 %	0 %	0 %	50 %	512442379
40	NC_021501	CG	3	6	27544	27549	0 %	0 %	50 %	50 %	512442382
41	NC_021501	TA	3	6	28269	28274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021501	TA	3	6	28399	28404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021501	TA	3	6	28582	28587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021501	AG	3	6	28645	28650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021501	CT	3	6	29017	29022	0 %	50 %	0 %	50 %	512442383
46	NC_021501	GT	3	6	29187	29192	0 %	50 %	50 %	0 %	512442383
47	NC_021501	GA	3	6	29475	29480	50 %	0 %	50 %	0 %	512442383
48	NC_021501	AG	3	6	29692	29697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021501	TC	3	6	30234	30239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021501	CT	3	6	30483	30488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021501	GA	3	6	30509	30514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021501	GA	3	6	30944	30949	50 %	0 %	50 %	0 %	512442384
53	NC_021501	GA	3	6	32456	32461	50 %	0 %	50 %	0 %	512442385
54	NC_021501	CG	3	6	33784	33789	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
55	NC_021501	GC	3	6	33849	33854	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
56	NC_021501	GC	3	6	33887	33892	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
57	NC_021501	CG	3	6	34424	34429	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
58	NC_021501	CG	3	6	34576	34581	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
59	NC_021501	GC	3	6	34727	34732	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
60	NC_021501	GC	3	6	35548	35553	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
61	NC_021501	GC	3	6	35623	35628	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
62	NC_021501	GC	3	6	35723	35728	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
63	NC_021501	TG	3	6	35797	35802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021501	CG	3	6	35810	35815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021501	CG	3	6	35937	35942	0 %	0 %	50 %	50 %	512442388
66	NC_021501	CG	3	6	36162	36167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021501	GC	3	6	37112	37117	0 %	0 %	50 %	50 %	512442390
68	NC_021501	TC	3	6	37271	37276	0 %	50 %	0 %	50 %	512442390
69	NC_021501	GC	3	6	37736	37741	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
70	NC_021501	GC	3	6	37782	37787	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
71	NC_021501	GC	3	6	37901	37906	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
72	NC_021501	CG	4	8	38023	38030	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
73	NC_021501	GC	3	6	38164	38169	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
74	NC_021501	CG	3	6	38649	38654	0 %	0 %	50 %	50 %	512442392
75	NC_021501	CG	4	8	38797	38804	0 %	0 %	50 %	50 %	512442393
76	NC_021501	GT	3	6	39967	39972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021501	TC	3	6	40180	40185	0 %	50 %	0 %	50 %	512442394
78	NC_021501	TA	3	6	40286	40291	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
79	NC_021501	AT	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
80	NC_021501	AT	3	6	40903	40908	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
81	NC_021501	TG	3	6	41183	41188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021501	GC	5	10	41218	41227	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
83	NC_021501	GC	3	6	41254	41259	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
84	NC_021501	GC	3	6	41508	41513	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
85	NC_021501	GC	3	6	41559	41564	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
86	NC_021501	AC	3	6	42005	42010	50 %	0 %	0 %	50 %	512442395
87	NC_021501	CG	3	6	42405	42410	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
88	NC_021501	CT	3	6	42459	42464	0 %	50 %	0 %	50 %	512442395
89	NC_021501	GC	3	6	42647	42652	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
90	NC_021501	GC	3	6	42685	42690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021501	GC	3	6	42989	42994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021501	GC	3	6	43356	43361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021501	CG	3	6	43477	43482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021501	CG	3	6	45717	45722	0 %	0 %	50 %	50 %	512442398
95	NC_021501	CT	3	6	45939	45944	0 %	50 %	0 %	50 %	512442399
96	NC_021501	CG	3	6	46610	46615	0 %	0 %	50 %	50 %	512442399
97	NC_021501	CG	3	6	46964	46969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021501	CG	3	6	48318	48323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021501	GC	3	6	48496	48501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021501	GA	4	8	49179	49186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021501	GC	3	6	49440	49445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021501	GT	4	8	52855	52862	0 %	50 %	50 %	0 %	512442405
103	NC_021501	GA	3	6	53244	53249	50 %	0 %	50 %	0 %	512442406
104	NC_021501	GA	3	6	54549	54554	50 %	0 %	50 %	0 %	512442407
105	NC_021501	TA	3	6	55044	55049	50 %	50 %	0 %	0 %	512442408
106	NC_021501	GA	3	6	55417	55422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021501	CA	3	6	56069	56074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021501	GC	3	6	56306	56311	0 %	0 %	50 %	50 %	512442409
109	NC_021501	GC	3	6	56373	56378	0 %	0 %	50 %	50 %	512442409
110	NC_021501	AG	4	8	57019	57026	50 %	0 %	50 %	0 %	512442410
111	NC_021501	GA	3	6	57664	57669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021501	AT	3	6	58093	58098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021501	GC	3	6	59227	59232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021501	TA	3	6	59819	59824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021501	CA	3	6	60133	60138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021501	GT	3	6	62576	62581	0 %	50 %	50 %	0 %	512442415
117	NC_021501	CG	3	6	64050	64055	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
118	NC_021501	GC	3	6	64472	64477	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
119	NC_021501	CA	3	6	64655	64660	50 %	0 %	0 %	50 %	512442417
120	NC_021501	GC	3	6	64721	64726	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
121	NC_021501	AT	3	6	65436	65441	50 %	50 %	0 %	0 %	512442418
122	NC_021501	CG	3	6	66692	66697	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
123	NC_021501	CG	3	6	66919	66924	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
124	NC_021501	CG	3	6	68161	68166	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
125	NC_021501	CG	3	6	68605	68610	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
126	NC_021501	CG	3	6	68928	68933	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
127	NC_021501	CG	3	6	69644	69649	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
128	NC_021501	TG	3	6	69652	69657	0 %	50 %	50 %	0 %	512442418
129	NC_021501	GA	3	6	70586	70591	50 %	0 %	50 %	0 %	512442419
130	NC_021501	GC	3	6	71485	71490	0 %	0 %	50 %	50 %	512442419
131	NC_021501	AT	3	6	71915	71920	50 %	50 %	0 %	0 %	512442419
132	NC_021501	GA	3	6	72328	72333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021501	AC	3	6	72546	72551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021501	TA	3	6	73249	73254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021501	CT	3	6	73537	73542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021501	TC	4	8	73764	73771	0 %	50 %	0 %	50 %	512442420
137	NC_021501	CT	3	6	74750	74755	0 %	50 %	0 %	50 %	512442420
138	NC_021501	GA	3	6	75191	75196	50 %	0 %	50 %	0 %	512442420
139	NC_021501	GC	3	6	76377	76382	0 %	0 %	50 %	50 %	512442421
140	NC_021501	CG	3	6	77554	77559	0 %	0 %	50 %	50 %	512442421
141	NC_021501	CA	3	6	77711	77716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021501	GA	3	6	77722	77727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021501	CG	3	6	77991	77996	0 %	0 %	50 %	50 %	512442422
144	NC_021501	CT	3	6	78099	78104	0 %	50 %	0 %	50 %	512442422
145	NC_021501	TG	3	6	78648	78653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021501	GC	3	6	79511	79516	0 %	0 %	50 %	50 %	512442425
147	NC_021501	AG	3	6	83427	83432	50 %	0 %	50 %	0 %	512442429
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.