MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_NDM1

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021501	CG	3	6	567	572	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
2	NC_021501	CG	3	6	731	736	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
3	NC_021501	GC	4	8	1075	1082	0 %	0 %	50 %	50 %	512442355
4	NC_021501	GA	3	6	1123	1128	50 %	0 %	50 %	0 %	512442355
5	NC_021501	TC	3	6	2015	2020	0 %	50 %	0 %	50 %	512442356
6	NC_021501	CG	3	6	2293	2298	0 %	0 %	50 %	50 %	512442356
7	NC_021501	GA	4	8	2313	2320	50 %	0 %	50 %	0 %	512442356
8	NC_021501	AT	3	6	2454	2459	50 %	50 %	0 %	0 %	512442356
9	NC_021501	TC	3	6	2682	2687	0 %	50 %	0 %	50 %	512442356
10	NC_021501	AT	3	6	3821	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	512442357
11	NC_021501	AC	3	6	5601	5606	50 %	0 %	0 %	50 %	512442359
12	NC_021501	GC	3	6	5766	5771	0 %	0 %	50 %	50 %	512442359
13	NC_021501	AG	3	6	8623	8628	50 %	0 %	50 %	0 %	512442360
14	NC_021501	CT	3	6	11289	11294	0 %	50 %	0 %	50 %	512442363
15	NC_021501	TC	3	6	11788	11793	0 %	50 %	0 %	50 %	512442363
16	NC_021501	GC	3	6	11802	11807	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
17	NC_021501	GC	3	6	12322	12327	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
18	NC_021501	TG	3	6	12361	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	512442363
19	NC_021501	GC	3	6	12893	12898	0 %	0 %	50 %	50 %	512442363
20	NC_021501	GC	3	6	13678	13683	0 %	0 %	50 %	50 %	512442364
21	NC_021501	TC	3	6	14295	14300	0 %	50 %	0 %	50 %	512442364
22	NC_021501	TC	3	6	16955	16960	0 %	50 %	0 %	50 %	512442368
23	NC_021501	CG	3	6	17073	17078	0 %	0 %	50 %	50 %	512442368
24	NC_021501	GA	3	6	17884	17889	50 %	0 %	50 %	0 %	512442369
25	NC_021501	GC	3	6	18736	18741	0 %	0 %	50 %	50 %	512442369
26	NC_021501	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	512442369
27	NC_021501	AT	3	6	19828	19833	50 %	50 %	0 %	0 %	512442369
28	NC_021501	GC	3	6	21243	21248	0 %	0 %	50 %	50 %	512442372
29	NC_021501	GC	3	6	21849	21854	0 %	0 %	50 %	50 %	512442373
30	NC_021501	TC	3	6	25047	25052	0 %	50 %	0 %	50 %	512442378
31	NC_021501	CA	3	6	26631	26636	50 %	0 %	0 %	50 %	512442379
32	NC_021501	CG	3	6	27544	27549	0 %	0 %	50 %	50 %	512442382
33	NC_021501	CT	3	6	29017	29022	0 %	50 %	0 %	50 %	512442383
34	NC_021501	GT	3	6	29187	29192	0 %	50 %	50 %	0 %	512442383
35	NC_021501	GA	3	6	29475	29480	50 %	0 %	50 %	0 %	512442383
36	NC_021501	GA	3	6	30944	30949	50 %	0 %	50 %	0 %	512442384
37	NC_021501	GA	3	6	32456	32461	50 %	0 %	50 %	0 %	512442385
38	NC_021501	CG	3	6	33784	33789	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
39	NC_021501	GC	3	6	33849	33854	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
40	NC_021501	GC	3	6	33887	33892	0 %	0 %	50 %	50 %	512442386
41	NC_021501	CG	3	6	34424	34429	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
42	NC_021501	CG	3	6	34576	34581	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
43	NC_021501	GC	3	6	34727	34732	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
44	NC_021501	GC	3	6	35548	35553	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
45	NC_021501	GC	3	6	35623	35628	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
46	NC_021501	GC	3	6	35723	35728	0 %	0 %	50 %	50 %	512442387
47	NC_021501	CG	3	6	35937	35942	0 %	0 %	50 %	50 %	512442388
48	NC_021501	GC	3	6	37112	37117	0 %	0 %	50 %	50 %	512442390
49	NC_021501	TC	3	6	37271	37276	0 %	50 %	0 %	50 %	512442390
50	NC_021501	GC	3	6	37736	37741	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
51	NC_021501	GC	3	6	37782	37787	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
52	NC_021501	GC	3	6	37901	37906	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
53	NC_021501	CG	4	8	38023	38030	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
54	NC_021501	GC	3	6	38164	38169	0 %	0 %	50 %	50 %	512442391
55	NC_021501	CG	3	6	38649	38654	0 %	0 %	50 %	50 %	512442392
56	NC_021501	CG	4	8	38797	38804	0 %	0 %	50 %	50 %	512442393
57	NC_021501	TC	3	6	40180	40185	0 %	50 %	0 %	50 %	512442394
58	NC_021501	TA	3	6	40286	40291	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
59	NC_021501	AT	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
60	NC_021501	AT	3	6	40903	40908	50 %	50 %	0 %	0 %	512442394
61	NC_021501	GC	5	10	41218	41227	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
62	NC_021501	GC	3	6	41254	41259	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
63	NC_021501	GC	3	6	41508	41513	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
64	NC_021501	GC	3	6	41559	41564	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
65	NC_021501	AC	3	6	42005	42010	50 %	0 %	0 %	50 %	512442395
66	NC_021501	CG	3	6	42405	42410	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
67	NC_021501	CT	3	6	42459	42464	0 %	50 %	0 %	50 %	512442395
68	NC_021501	GC	3	6	42647	42652	0 %	0 %	50 %	50 %	512442395
69	NC_021501	CG	3	6	45717	45722	0 %	0 %	50 %	50 %	512442398
70	NC_021501	CT	3	6	45939	45944	0 %	50 %	0 %	50 %	512442399
71	NC_021501	CG	3	6	46610	46615	0 %	0 %	50 %	50 %	512442399
72	NC_021501	GT	4	8	52855	52862	0 %	50 %	50 %	0 %	512442405
73	NC_021501	GA	3	6	53244	53249	50 %	0 %	50 %	0 %	512442406
74	NC_021501	GA	3	6	54549	54554	50 %	0 %	50 %	0 %	512442407
75	NC_021501	TA	3	6	55044	55049	50 %	50 %	0 %	0 %	512442408
76	NC_021501	GC	3	6	56306	56311	0 %	0 %	50 %	50 %	512442409
77	NC_021501	GC	3	6	56373	56378	0 %	0 %	50 %	50 %	512442409
78	NC_021501	AG	4	8	57019	57026	50 %	0 %	50 %	0 %	512442410
79	NC_021501	GT	3	6	62576	62581	0 %	50 %	50 %	0 %	512442415
80	NC_021501	CG	3	6	64050	64055	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
81	NC_021501	GC	3	6	64472	64477	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
82	NC_021501	CA	3	6	64655	64660	50 %	0 %	0 %	50 %	512442417
83	NC_021501	GC	3	6	64721	64726	0 %	0 %	50 %	50 %	512442417
84	NC_021501	AT	3	6	65436	65441	50 %	50 %	0 %	0 %	512442418
85	NC_021501	CG	3	6	66692	66697	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
86	NC_021501	CG	3	6	66919	66924	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
87	NC_021501	CG	3	6	68161	68166	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
88	NC_021501	CG	3	6	68605	68610	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
89	NC_021501	CG	3	6	68928	68933	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
90	NC_021501	CG	3	6	69644	69649	0 %	0 %	50 %	50 %	512442418
91	NC_021501	TG	3	6	69652	69657	0 %	50 %	50 %	0 %	512442418
92	NC_021501	GA	3	6	70586	70591	50 %	0 %	50 %	0 %	512442419
93	NC_021501	GC	3	6	71485	71490	0 %	0 %	50 %	50 %	512442419
94	NC_021501	AT	3	6	71915	71920	50 %	50 %	0 %	0 %	512442419
95	NC_021501	TC	4	8	73764	73771	0 %	50 %	0 %	50 %	512442420
96	NC_021501	CT	3	6	74750	74755	0 %	50 %	0 %	50 %	512442420
97	NC_021501	GA	3	6	75191	75196	50 %	0 %	50 %	0 %	512442420
98	NC_021501	GC	3	6	76377	76382	0 %	0 %	50 %	50 %	512442421
99	NC_021501	CG	3	6	77554	77559	0 %	0 %	50 %	50 %	512442421
100	NC_021501	CG	3	6	77991	77996	0 %	0 %	50 %	50 %	512442422
101	NC_021501	CT	3	6	78099	78104	0 %	50 %	0 %	50 %	512442422
102	NC_021501	GC	3	6	79511	79516	0 %	0 %	50 %	50 %	512442425
103	NC_021501	AG	3	6	83427	83432	50 %	0 %	50 %	0 %	512442429
104	NC_021501	CG	3	6	83860	83865	0 %	0 %	50 %	50 %	512442430
105	NC_021501	GC	3	6	83911	83916	0 %	0 %	50 %	50 %	512442430
106	NC_021501	GC	3	6	84086	84091	0 %	0 %	50 %	50 %	512442430
107	NC_021501	CG	3	6	84818	84823	0 %	0 %	50 %	50 %	512442432
108	NC_021501	GC	3	6	85286	85291	0 %	0 %	50 %	50 %	512442432
109	NC_021501	CA	3	6	85612	85617	50 %	0 %	0 %	50 %	512442432
110	NC_021501	GC	3	6	85767	85772	0 %	0 %	50 %	50 %	512442432
111	NC_021501	CG	3	6	86274	86279	0 %	0 %	50 %	50 %	512442432
112	NC_021501	GC	3	6	90123	90128	0 %	0 %	50 %	50 %	512442437
113	NC_021501	GC	3	6	90830	90835	0 %	0 %	50 %	50 %	512442438
114	NC_021501	GA	3	6	92075	92080	50 %	0 %	50 %	0 %	512442440
115	NC_021501	AT	3	6	92091	92096	50 %	50 %	0 %	0 %	512442440
116	NC_021501	TC	3	6	94144	94149	0 %	50 %	0 %	50 %	512442443
117	NC_021501	AT	3	6	95440	95445	50 %	50 %	0 %	0 %	512442445
118	NC_021501	TG	3	6	95709	95714	0 %	50 %	50 %	0 %	512442445
119	NC_021501	TC	3	6	97131	97136	0 %	50 %	0 %	50 %	512442446
120	NC_021501	GC	3	6	97296	97301	0 %	0 %	50 %	50 %	512442447
121	NC_021501	CG	3	6	97662	97667	0 %	0 %	50 %	50 %	512442448
122	NC_021501	CG	3	6	97841	97846	0 %	0 %	50 %	50 %	512442448
123	NC_021501	CG	3	6	98537	98542	0 %	0 %	50 %	50 %	512442449
124	NC_021501	TG	3	6	98661	98666	0 %	50 %	50 %	0 %	512442449
125	NC_021501	GC	3	6	102841	102846	0 %	0 %	50 %	50 %	512442454
126	NC_021501	CG	3	6	103393	103398	0 %	0 %	50 %	50 %	512442455
127	NC_021501	GC	3	6	104572	104577	0 %	0 %	50 %	50 %	512442457
128	NC_021501	CG	3	6	106450	106455	0 %	0 %	50 %	50 %	512442460
129	NC_021501	GC	3	6	106478	106483	0 %	0 %	50 %	50 %	512442460
130	NC_021501	CG	3	6	106849	106854	0 %	0 %	50 %	50 %	512442460
131	NC_021501	CA	3	6	107539	107544	50 %	0 %	0 %	50 %	512442462
132	NC_021501	GC	3	6	107648	107653	0 %	0 %	50 %	50 %	512442463
133	NC_021501	TG	3	6	107795	107800	0 %	50 %	50 %	0 %	512442463
134	NC_021501	TC	3	6	109599	109604	0 %	50 %	0 %	50 %	512442467
135	NC_021501	TC	3	6	109862	109867	0 %	50 %	0 %	50 %	512442467
136	NC_021501	AG	3	6	110102	110107	50 %	0 %	50 %	0 %	512442467
137	NC_021501	TA	3	6	110187	110192	50 %	50 %	0 %	0 %	512442467

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.