MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas resinovorans NBRC 106553 DNA

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021499	GGATC	2	10	6657	6666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021499	TTTTC	2	10	6698	6707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021499	ACGCC	2	10	8752	8761	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_021499	CGGGA	2	10	11147	11156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021499	GCCGG	2	10	14267	14276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021499	CGCTC	2	10	33244	33253	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021499	GCTCG	2	10	47203	47212	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021499	GAAGA	2	10	48339	48348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021499	CTTGC	2	10	48355	48364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021499	AGCGA	2	10	65673	65682	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021499	GTTTC	2	10	74073	74082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021499	GAGCG	2	10	81862	81871	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021499	AGCGA	2	10	90872	90881	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021499	CGCTC	2	10	91358	91367	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_021499	TCTGG	2	10	91387	91396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021499	GGGAT	2	10	109940	109949	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021499	GCTTC	2	10	113050	113059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021499	ACTGT	2	10	116312	116321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021499	ACAGT	2	10	116915	116924	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021499	ACAAA	2	10	118621	118630	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021499	GCAGG	2	10	118663	118672	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021499	GGCGA	2	10	121618	121627	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021499	GGCCC	2	10	123258	123267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_021499	TCGTG	2	10	127395	127404	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021499	ACCGA	2	10	129066	129075	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021499	AGTCG	2	10	129441	129450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021499	ATCCC	2	10	131409	131418	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_021499	TATGC	2	10	148227	148236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021499	AGCGA	2	10	158987	158996	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021499	CGTGG	2	10	160378	160387	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021499	GAGCG	2	10	163876	163885	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021499	CCCGG	2	10	198319	198328	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_021499	TCGGG	2	10	208523	208532	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021499	AGCCG	2	10	211077	211086	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021499	GGCGG	2	10	214493	214502	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021499	GCAGC	2	10	214606	214615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021499	AATAA	2	10	216961	216970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021499	GAAGC	2	10	223385	223394	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021499	CGCTT	2	10	225355	225364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021499	GAGCG	2	10	228322	228331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021499	CCTGC	2	10	243706	243715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_021499	AGCGA	2	10	259242	259251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021499	AGCGC	2	10	268928	268937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_021499	CGGCC	2	10	271157	271166	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_021499	GGCGG	2	10	273157	273166	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021499	CAGGC	2	10	274541	274550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021499	CAGAT	2	10	274701	274710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021499	CGCTT	2	10	296364	296373	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021499	CACCT	2	10	299599	299608	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_021499	AGCGA	2	10	341698	341707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021499	GCCCG	2	10	341717	341726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_021499	AGCGA	2	10	376926	376935	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021499	GAGCG	2	10	391819	391828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021499	GGCCC	2	10	412439	412448	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_021499	GGCGT	2	10	416096	416105	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021499	GGCTG	2	10	420851	420860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021499	CGCTC	2	10	424764	424773	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_021499	GCTCC	2	10	440416	440425	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_021499	ATTCG	2	10	448919	448928	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021499	GTTCC	2	10	459000	459009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021499	GGCGA	2	10	461442	461451	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021499	ACTCA	2	10	468499	468508	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_021499	CTTCG	2	10	473540	473549	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021499	TGCGC	2	10	477081	477090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021499	CGCTC	2	10	477754	477763	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_021499	GCTGC	2	10	480777	480786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021499	TTTAA	2	10	483873	483882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021499	GGGCC	2	10	484059	484068	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_021499	TGCAA	2	10	485509	485518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021499	AGCGA	2	10	499120	499129	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021499	TCGCT	2	10	499161	499170	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_021499	TCGCT	2	10	500795	500804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021499	GCCCC	2	10	509404	509413	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_021499	GTCGC	2	10	518238	518247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021499	GCTTC	2	10	519510	519519	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021499	CAACC	2	10	519523	519532	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_021499	AGCGC	2	10	536397	536406	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_021499	TCGCT	2	10	541382	541391	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021499	CGCTC	2	10	541474	541483	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_021499	GGCTT	2	10	551301	551310	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021499	AGCGA	2	10	558067	558076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021499	GAGCG	2	10	563406	563415	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021499	CGCTC	2	10	568930	568939	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_021499	GTGCA	2	10	578012	578021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021499	GCGGA	2	10	590999	591008	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021499	GAAGT	2	10	597842	597851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021499	GAGCG	2	10	606609	606618	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021499	GGGGA	2	10	615898	615907	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021499	GGCCC	2	10	623047	623056	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_021499	CCCGG	2	10	624756	624765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_021499	GTGTG	2	10	635592	635601	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021499	GATCG	2	10	637216	637225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021499	TCGTG	2	10	638560	638569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021499	ACCGA	2	10	640231	640240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_021499	AGTCG	2	10	640606	640615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021499	ATCCC	2	10	642574	642583	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_021499	CTCAA	2	10	692672	692681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021499	GCTGC	2	10	706778	706787	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021499	AGCGA	2	10	725572	725581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021499	CGTTA	2	10	735573	735582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021499	AGCGA	2	10	748325	748334	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021499	CGCTC	2	10	750445	750454	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_021499	AGCGC	2	10	757177	757186	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021499	CACGC	2	10	803413	803422	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_021499	ACCCA	2	10	808484	808493	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_021499	ACCCA	2	10	808504	808513	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_021499	CGGGG	2	10	819879	819888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021499	GTGCC	2	10	828215	828224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021499	CATTG	2	10	828345	828354	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021499	GCACT	2	10	828425	828434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_021499	TCGCT	2	10	830468	830477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021499	GCCGG	2	10	841033	841042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_021499	TCAGC	2	10	841134	841143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_021499	TCGCT	2	10	859265	859274	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021499	CGAGG	2	10	860497	860506	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021499	TCGGC	2	10	878445	878454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021499	GGCCT	2	10	878588	878597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021499	GAGCG	2	10	884125	884134	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021499	GGCGG	2	10	886391	886400	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021499	ACCCG	2	10	887140	887149	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_021499	GGAGG	2	10	896329	896338	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021499	GCCTA	2	10	899013	899022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_021499	TGGGT	2	10	899093	899102	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021499	ATAGA	2	10	899781	899790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021499	AGCGA	2	10	902165	902174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021499	ACGGA	2	10	905359	905368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021499	CAGAG	2	10	918344	918353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021499	GCTGC	2	10	941493	941502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_021499	CCGCA	2	10	947969	947978	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_021499	GCGGG	2	10	959712	959721	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021499	GAGCG	2	10	960832	960841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021499	GGTTC	2	10	979991	980000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021499	ATGAG	2	10	982749	982758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021499	GCGAA	2	10	1018794	1018803	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021499	TTGTC	2	10	1028953	1028962	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021499	GAGCG	2	10	1034381	1034390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021499	AGCAG	2	10	1041517	1041526	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021499	CGCTC	2	10	1071462	1071471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_021499	TTGTC	2	10	1074672	1074681	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021499	AAAAC	2	10	1074736	1074745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021499	TTTGT	2	10	1076393	1076402	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021499	CGCTC	2	10	1080593	1080602	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_021499	CCGGC	2	10	1096498	1096507	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_021499	CGGCG	2	10	1096533	1096542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_021499	AGCGC	2	10	1120350	1120359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021499	GCTTT	2	10	1123977	1123986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021499	CTGAC	2	10	1131072	1131081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_021499	CGCAC	2	10	1140556	1140565	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_021499	TCGCT	2	10	1165679	1165688	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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152	NC_021499	GGCCG	2	10	1190664	1190673	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_021499	TGGAG	2	10	1203556	1203565	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021499	GAGCG	2	10	1328945	1328954	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
163	NC_021499	AGCGA	2	10	1328998	1329007	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_021499	TCGCT	2	10	1339960	1339969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_021499	CCACG	2	10	1339987	1339996	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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174	NC_021499	GAGCG	2	10	1390091	1390100	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_021499	TCGCT	2	10	1432474	1432483	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_021499	GGGGT	2	10	1435441	1435450	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021499	AGGGG	2	10	1456988	1456997	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_021499	CGCTC	2	10	1472090	1472099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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267	NC_021499	TCGCT	2	10	1776138	1776147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_021499	TCGCT	2	10	1881878	1881887	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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406	NC_021499	AGAGC	2	10	2598244	2598253	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_021499	CGGCG	2	10	2621673	2621682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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443	NC_021499	AGGCC	2	10	2827864	2827873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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452	NC_021499	GAGCG	2	10	2870367	2870376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
453	NC_021499	GCTTC	2	10	2906267	2906276	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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456	NC_021499	CGCTC	2	10	2918224	2918233	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
457	NC_021499	CGCTC	2	10	2920249	2920258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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460	NC_021499	CAGTC	2	10	2930998	2931007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
461	NC_021499	GCGTC	2	10	2931822	2931831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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470	NC_021499	GAGGG	2	10	2992012	2992021	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
471	NC_021499	GCGGG	2	10	3006783	3006792	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_021499	AGCGA	2	10	3273468	3273477	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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