MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI06

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021498	GGAG	2	8	400	407	25 %	0 %	75 %	0 %	512595904
2	NC_021498	CCTC	2	8	430	437	0 %	25 %	0 %	75 %	512595904
3	NC_021498	CTGA	2	8	452	459	25 %	25 %	25 %	25 %	512595904
4	NC_021498	TTAC	2	8	619	626	25 %	50 %	0 %	25 %	512595905
5	NC_021498	AGCA	2	8	929	936	50 %	0 %	25 %	25 %	512595905
6	NC_021498	TGAT	2	8	938	945	25 %	50 %	25 %	0 %	512595905
7	NC_021498	TGGT	2	8	1340	1347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021498	TCAT	2	8	1789	1796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021498	TTCG	2	8	2113	2120	0 %	50 %	25 %	25 %	512595906
10	NC_021498	CCGC	2	8	2539	2546	0 %	0 %	25 %	75 %	512595906
11	NC_021498	TTGT	2	8	2720	2727	0 %	75 %	25 %	0 %	512595906
12	NC_021498	TCGT	2	8	2953	2960	0 %	50 %	25 %	25 %	512595906
13	NC_021498	TCAC	2	8	3311	3318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021498	GGTT	2	8	3483	3490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021498	AAAG	2	8	3716	3723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021498	TAAA	2	8	3785	3792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021498	ATTT	2	8	3914	3921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021498	AATT	2	8	5059	5066	50 %	50 %	0 %	0 %	512595908
19	NC_021498	ATTG	2	8	6160	6167	25 %	50 %	25 %	0 %	512595908
20	NC_021498	CACC	2	8	6415	6422	25 %	0 %	0 %	75 %	512595909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.