MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI05

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021497	TTTA	2	8	260	267	25 %	75 %	0 %	0 %	512595025
2	NC_021497	AAGC	2	8	715	722	50 %	0 %	25 %	25 %	512595025
3	NC_021497	CAAA	2	8	952	959	75 %	0 %	0 %	25 %	512595026
4	NC_021497	TTGG	2	8	1584	1591	0 %	50 %	50 %	0 %	512595026
5	NC_021497	GGCT	2	8	1751	1758	0 %	25 %	50 %	25 %	512595026
6	NC_021497	TCAT	2	8	2058	2065	25 %	50 %	0 %	25 %	512595026
7	NC_021497	CCAA	2	8	2624	2631	50 %	0 %	0 %	50 %	512595027
8	NC_021497	ATTG	2	8	3117	3124	25 %	50 %	25 %	0 %	512595027
9	NC_021497	GATA	2	8	3883	3890	50 %	25 %	25 %	0 %	512595028
10	NC_021497	AAGA	2	8	4441	4448	75 %	0 %	25 %	0 %	512595028
11	NC_021497	GTAG	2	8	5096	5103	25 %	25 %	50 %	0 %	512595029
12	NC_021497	CCTT	2	8	7224	7231	0 %	50 %	0 %	50 %	512595031
13	NC_021497	TAGT	2	8	7515	7522	25 %	50 %	25 %	0 %	512595031
14	NC_021497	CTTG	2	8	8104	8111	0 %	50 %	25 %	25 %	512595031
15	NC_021497	TTCA	2	8	8346	8353	25 %	50 %	0 %	25 %	512595032
16	NC_021497	TTGT	2	8	8851	8858	0 %	75 %	25 %	0 %	512595033
17	NC_021497	TCTT	2	8	9112	9119	0 %	75 %	0 %	25 %	512595033
18	NC_021497	GTTC	2	8	9215	9222	0 %	50 %	25 %	25 %	512595034
19	NC_021497	CTTG	2	8	9289	9296	0 %	50 %	25 %	25 %	512595034
20	NC_021497	TACA	2	8	10377	10384	50 %	25 %	0 %	25 %	512595035
21	NC_021497	TCCT	2	8	10867	10874	0 %	50 %	0 %	50 %	512595035
22	NC_021497	ATTG	2	8	12336	12343	25 %	50 %	25 %	0 %	512595036
23	NC_021497	GGTT	2	8	12547	12554	0 %	50 %	50 %	0 %	512595036
24	NC_021497	CCTT	2	8	12592	12599	0 %	50 %	0 %	50 %	512595036
25	NC_021497	AGCA	2	8	13266	13273	50 %	0 %	25 %	25 %	512595036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.