MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI05

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021497	ACA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595025
2	NC_021497	TAT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
3	NC_021497	TTA	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
4	NC_021497	GGC	2	6	175	180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
5	NC_021497	GAT	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595025
6	NC_021497	GCG	2	6	220	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
7	NC_021497	GGC	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
8	NC_021497	GCC	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
9	NC_021497	GAA	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595025
10	NC_021497	TGC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595025
11	NC_021497	TGA	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595025
12	NC_021497	AAG	2	6	515	520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595025
13	NC_021497	TGC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595025
14	NC_021497	ATC	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595025
15	NC_021497	CAC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595025
16	NC_021497	CAT	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595025
17	NC_021497	GCC	2	6	817	822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
18	NC_021497	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
19	NC_021497	TTA	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
20	NC_021497	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595026
21	NC_021497	GTG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
22	NC_021497	AGC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595026
23	NC_021497	TGC	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
24	NC_021497	GGC	2	6	1096	1101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
25	NC_021497	GTC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
26	NC_021497	ATT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
27	NC_021497	TGA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595026
28	NC_021497	AAG	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595026
29	NC_021497	CCG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595026
30	NC_021497	GGT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
31	NC_021497	AAC	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595026
32	NC_021497	CCA	2	6	1677	1682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595026
33	NC_021497	ATT	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
34	NC_021497	ATT	2	6	1798	1803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
35	NC_021497	GGT	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
36	NC_021497	GTG	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
37	NC_021497	GGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
38	NC_021497	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
39	NC_021497	TCG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
40	NC_021497	CTG	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
41	NC_021497	CTA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595026
42	NC_021497	CTG	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
43	NC_021497	CTG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
44	NC_021497	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
45	NC_021497	TTC	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595026
46	NC_021497	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595026
47	NC_021497	TAT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
48	NC_021497	TGT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595027
49	NC_021497	TCA	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595027
50	NC_021497	ATT	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595027
51	NC_021497	ATC	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595027
52	NC_021497	ATG	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595027
53	NC_021497	TGA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595027
54	NC_021497	ACA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
55	NC_021497	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595027
56	NC_021497	AAC	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
57	NC_021497	TCG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595027
58	NC_021497	CAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
59	NC_021497	CGG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595027
60	NC_021497	CAC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595027
61	NC_021497	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595028
62	NC_021497	GAA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595028
63	NC_021497	ACT	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595028
64	NC_021497	AAT	2	6	3854	3859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595028
65	NC_021497	CAA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595028
66	NC_021497	TGG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595028
67	NC_021497	CGA	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595028
68	NC_021497	AGT	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595028
69	NC_021497	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595028
70	NC_021497	TCT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595028
71	NC_021497	TTA	2	6	4395	4400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595028
72	NC_021497	TTA	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595028
73	NC_021497	GTT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595028
74	NC_021497	CTT	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595028
75	NC_021497	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595028
76	NC_021497	GGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595029
77	NC_021497	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595029
78	NC_021497	TTC	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
79	NC_021497	CTT	2	6	5571	5576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
80	NC_021497	CTT	2	6	5579	5584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
81	NC_021497	TTG	2	6	5616	5621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595030
82	NC_021497	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595030
83	NC_021497	TCA	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
84	NC_021497	TTG	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595030
85	NC_021497	ATC	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
86	NC_021497	AAC	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595030
87	NC_021497	ATC	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
88	NC_021497	CAT	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
89	NC_021497	TAG	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595030
90	NC_021497	TCA	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
91	NC_021497	ATC	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595031
92	NC_021497	TAA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595031
93	NC_021497	TTC	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
94	NC_021497	TTG	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595031
95	NC_021497	TTC	2	6	6554	6559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
96	NC_021497	TTG	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595031
97	NC_021497	CAT	2	6	6928	6933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595031
98	NC_021497	CAT	2	6	6973	6978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595031
99	NC_021497	TTC	2	6	7037	7042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
100	NC_021497	CTT	2	6	7091	7096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
101	NC_021497	GGC	2	6	7097	7102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595031
102	NC_021497	ACA	2	6	7108	7113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595031
103	NC_021497	TAA	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595031
104	NC_021497	TCA	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595031
105	NC_021497	TGA	2	6	7374	7379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595031
106	NC_021497	TAT	2	6	7444	7449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595031
107	NC_021497	AGC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595031
108	NC_021497	TTC	2	6	7785	7790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
109	NC_021497	GTG	2	6	7825	7830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595031
110	NC_021497	GAA	2	6	7902	7907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595031
111	NC_021497	AAT	2	6	7931	7936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595031
112	NC_021497	TCT	2	6	7984	7989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
113	NC_021497	TTC	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
114	NC_021497	TGA	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595031
115	NC_021497	AAG	2	6	8076	8081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595031
116	NC_021497	CAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595032
117	NC_021497	GGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595032
118	NC_021497	CTT	2	6	8568	8573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595032
119	NC_021497	AAC	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595033
120	NC_021497	TTG	2	6	8902	8907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595033
121	NC_021497	ATC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595033
122	NC_021497	AGT	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595033
123	NC_021497	TAG	2	6	9145	9150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595034
124	NC_021497	CAT	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595034
125	NC_021497	CAT	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595034
126	NC_021497	CTT	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595034
127	NC_021497	TGG	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595034
128	NC_021497	GAT	3	9	9532	9540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595034
129	NC_021497	GAT	2	6	9644	9649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595034
130	NC_021497	TAT	2	6	9694	9699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595034
131	NC_021497	GTC	2	6	10051	10056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595035
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.