MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI02

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021495	CCTT	2	8	989	996	0 %	50 %	0 %	50 %	512593098
2	NC_021495	GTCA	2	8	1029	1036	25 %	25 %	25 %	25 %	512593098
3	NC_021495	CCAT	2	8	1643	1650	25 %	25 %	0 %	50 %	512593099
4	NC_021495	ACTT	2	8	2927	2934	25 %	50 %	0 %	25 %	512593100
5	NC_021495	TAAG	2	8	3164	3171	50 %	25 %	25 %	0 %	512593100
6	NC_021495	GTGA	2	8	3208	3215	25 %	25 %	50 %	0 %	512593100
7	NC_021495	TATG	2	8	3270	3277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021495	ATAA	2	8	3351	3358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021495	AGTA	2	8	3924	3931	50 %	25 %	25 %	0 %	512593101
10	NC_021495	CTTT	2	8	3992	3999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021495	TATT	2	8	4206	4213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021495	TTAG	2	8	4462	4469	25 %	50 %	25 %	0 %	512593102
13	NC_021495	CTAA	2	8	5410	5417	50 %	25 %	0 %	25 %	512593104
14	NC_021495	TAAT	2	8	5798	5805	50 %	50 %	0 %	0 %	512593104
15	NC_021495	ATAA	2	8	6263	6270	75 %	25 %	0 %	0 %	512593105
16	NC_021495	AGCT	2	8	6437	6444	25 %	25 %	25 %	25 %	512593105
17	NC_021495	AGTT	2	8	6590	6597	25 %	50 %	25 %	0 %	512593105
18	NC_021495	AAGG	2	8	6732	6739	50 %	0 %	50 %	0 %	512593105
19	NC_021495	AAAT	2	8	6742	6749	75 %	25 %	0 %	0 %	512593105
20	NC_021495	ATAG	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021495	CTAT	2	8	6860	6867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021495	AAGC	2	8	7316	7323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021495	ATCA	2	8	8577	8584	50 %	25 %	0 %	25 %	512593108
24	NC_021495	ATGT	2	8	8593	8600	25 %	50 %	25 %	0 %	512593108
25	NC_021495	TAAG	2	8	8729	8736	50 %	25 %	25 %	0 %	512593108
26	NC_021495	TCAT	2	8	9197	9204	25 %	50 %	0 %	25 %	512593109
27	NC_021495	TGGT	2	8	9614	9621	0 %	50 %	50 %	0 %	512593109
28	NC_021495	TTTG	2	8	9696	9703	0 %	75 %	25 %	0 %	512593109
29	NC_021495	GACT	2	8	10470	10477	25 %	25 %	25 %	25 %	512593109
30	NC_021495	AATG	2	8	10557	10564	50 %	25 %	25 %	0 %	512593109
31	NC_021495	ACTT	2	8	10842	10849	25 %	50 %	0 %	25 %	512593109
32	NC_021495	TAGT	2	8	10869	10876	25 %	50 %	25 %	0 %	512593109
33	NC_021495	CTTG	2	8	12117	12124	0 %	50 %	25 %	25 %	512593111
34	NC_021495	TCAC	2	8	13146	13153	25 %	25 %	0 %	50 %	512593113
35	NC_021495	ATTT	2	8	13349	13356	25 %	75 %	0 %	0 %	512593114
36	NC_021495	TACT	2	8	13718	13725	25 %	50 %	0 %	25 %	512593114
37	NC_021495	TTTA	2	8	13783	13790	25 %	75 %	0 %	0 %	512593114
38	NC_021495	AATA	2	8	13983	13990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021495	CGTT	2	8	14060	14067	0 %	50 %	25 %	25 %	512593115
40	NC_021495	CATT	2	8	14081	14088	25 %	50 %	0 %	25 %	512593115
41	NC_021495	TTCC	2	8	15029	15036	0 %	50 %	0 %	50 %	512593115
42	NC_021495	CTTG	2	8	15066	15073	0 %	50 %	25 %	25 %	512593115
43	NC_021495	CCCA	2	8	15248	15255	25 %	0 %	0 %	75 %	512593115
44	NC_021495	ATTA	2	8	15448	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.