MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI02

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021495	ATG	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593097
2	NC_021495	ATC	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593097
3	NC_021495	ATG	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593097
4	NC_021495	CTG	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512593098
5	NC_021495	CCA	2	6	726	731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512593098
6	NC_021495	GCG	2	6	832	837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512593098
7	NC_021495	TGT	2	6	935	940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593098
8	NC_021495	TAC	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593098
9	NC_021495	CTT	3	9	1125	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593098
10	NC_021495	CGT	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512593098
11	NC_021495	TCA	3	9	1306	1314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021495	GTA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021495	TGA	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593099
14	NC_021495	TTG	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593099
15	NC_021495	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593099
16	NC_021495	CGA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512593099
17	NC_021495	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593099
18	NC_021495	TTC	2	6	1739	1744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593099
19	NC_021495	AGT	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593099
20	NC_021495	AAT	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593099
21	NC_021495	CCT	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512593099
22	NC_021495	AGT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021495	TAT	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021495	CTT	2	6	2484	2489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021495	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021495	TAT	2	6	2615	2620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021495	TTA	2	6	2681	2686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593100
28	NC_021495	CAA	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512593100
29	NC_021495	TGA	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593100
30	NC_021495	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593100
31	NC_021495	TAA	2	6	2835	2840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593100
32	NC_021495	GTT	2	6	2863	2868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593100
33	NC_021495	CAA	2	6	2979	2984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512593100
34	NC_021495	CAA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512593100
35	NC_021495	TAT	2	6	3290	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021495	CAA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021495	GGT	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593101
38	NC_021495	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593101
39	NC_021495	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021495	TGG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021495	ATA	2	6	4262	4267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021495	GGA	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021495	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
44	NC_021495	TTA	2	6	4363	4368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
45	NC_021495	ATT	2	6	4512	4517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
46	NC_021495	AAT	2	6	4530	4535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593102
47	NC_021495	AAT	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593102
48	NC_021495	ATT	2	6	4686	4691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
49	NC_021495	TTA	2	6	4703	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
50	NC_021495	TTA	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
51	NC_021495	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593102
52	NC_021495	TGG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593102
53	NC_021495	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593102
54	NC_021495	GTA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593103
55	NC_021495	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593103
56	NC_021495	ATG	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593103
57	NC_021495	TAC	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593103
58	NC_021495	GAT	3	9	5252	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593103
59	NC_021495	AAG	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021495	CTA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021495	TCA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593104
62	NC_021495	GGA	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512593104
63	NC_021495	AAT	2	6	5591	5596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593104
64	NC_021495	TAA	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593104
65	NC_021495	CAT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593105
66	NC_021495	GAA	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593105
67	NC_021495	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593105
68	NC_021495	CTA	2	6	6403	6408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593105
69	NC_021495	CGG	2	6	6412	6417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512593105
70	NC_021495	ATT	2	6	6425	6430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593105
71	NC_021495	ATG	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593105
72	NC_021495	AAT	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593105
73	NC_021495	TTC	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593105
74	NC_021495	CTT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593105
75	NC_021495	TCC	2	6	6843	6848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021495	TAA	2	6	6960	6965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593106
77	NC_021495	AAT	2	6	6993	6998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593106
78	NC_021495	CTT	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593106
79	NC_021495	CTC	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512593106
80	NC_021495	CGT	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021495	GAA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021495	GAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593107
83	NC_021495	GAA	2	6	7561	7566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593107
84	NC_021495	GAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512593107
85	NC_021495	CAG	2	6	7703	7708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512593107
86	NC_021495	AAC	2	6	7725	7730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512593107
87	NC_021495	GAT	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593107
88	NC_021495	GCC	2	6	7790	7795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512593107
89	NC_021495	ATC	2	6	7894	7899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593107
90	NC_021495	GTG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593107
91	NC_021495	GTT	2	6	8000	8005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593108
92	NC_021495	GTT	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593108
93	NC_021495	CGT	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512593108
94	NC_021495	CAT	2	6	8183	8188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593108
95	NC_021495	TTC	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593108
96	NC_021495	AGT	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593108
97	NC_021495	CTT	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593108
98	NC_021495	CAA	2	6	8414	8419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512593108
99	NC_021495	TCA	2	6	8444	8449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593108
100	NC_021495	GTT	2	6	8665	8670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593108
101	NC_021495	AAT	2	6	8714	8719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593108
102	NC_021495	TTC	2	6	8783	8788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021495	TAA	3	9	8998	9006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021495	GTT	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
105	NC_021495	GTT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
106	NC_021495	TAG	2	6	9156	9161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593109
107	NC_021495	GGT	2	6	9222	9227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593109
108	NC_021495	TGT	2	6	9278	9283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
109	NC_021495	TAA	2	6	9342	9347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593109
110	NC_021495	GTT	2	6	9426	9431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
111	NC_021495	ATG	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593109
112	NC_021495	GTT	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
113	NC_021495	GTT	2	6	9723	9728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
114	NC_021495	ATT	2	6	9796	9801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593109
115	NC_021495	TTG	2	6	9832	9837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
116	NC_021495	TGC	2	6	9917	9922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512593109
117	NC_021495	GTT	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
118	NC_021495	GTT	3	9	9936	9944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
119	NC_021495	TTG	2	6	9946	9951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
120	NC_021495	CTG	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512593109
121	NC_021495	TTC	2	6	9982	9987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593109
122	NC_021495	TTG	2	6	10012	10017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
123	NC_021495	AGC	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512593109
124	NC_021495	ATT	2	6	10177	10182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512593109
125	NC_021495	TGG	2	6	10232	10237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593109
126	NC_021495	TAG	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593109
127	NC_021495	AGC	2	6	10507	10512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512593109
128	NC_021495	TCA	2	6	10580	10585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593109
129	NC_021495	TGG	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512593109
130	NC_021495	AGT	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593109
131	NC_021495	GTA	2	6	10781	10786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512593109
132	NC_021495	TTC	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593109
133	NC_021495	TTG	2	6	10831	10836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
134	NC_021495	TCT	2	6	10890	10895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593109
135	NC_021495	TTC	2	6	10969	10974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512593109
136	NC_021495	TCA	2	6	11036	11041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593109
137	NC_021495	TCA	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512593109
138	NC_021495	TGT	2	6	11161	11166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512593109
139	NC_021495	ATA	2	6	11186	11191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512593109
140	NC_021495	TCA	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021495	TAA	2	6	11344	11349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021495	CAT	2	6	11468	11473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021495	CAA	2	6	11474	11479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_021495	AGG	2	6	15566	15571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.