MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021494	TAAAAT	2	12	21038	21049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021494	TTCGAA	2	12	102422	102433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021494	TAAATA	2	12	150928	150939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021494	CATCTT	2	12	164917	164928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021494	GTTTTT	2	12	170245	170256	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021494	TATAAT	2	12	196149	196160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021494	CTTAAA	2	12	201207	201218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021494	ATTAAC	2	12	219464	219475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021494	AATTTT	2	12	281146	281157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021494	ATGAAA	2	12	338137	338148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021494	ATTAAA	2	12	370877	370888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021494	AGTAAA	2	12	379249	379260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021494	TTGTGT	2	12	383932	383943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021494	TAAGGA	2	12	387808	387819	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021494	TTTCTA	2	12	416909	416920	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021494	CAAAAT	2	12	418773	418784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021494	AAAAGG	2	12	444250	444261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021494	AAGATA	2	12	460065	460076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021494	ATTAAG	2	12	473919	473930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021494	TTTGAA	2	12	489195	489206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021494	AGAATA	2	12	512049	512060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021494	TTGGTT	2	12	555900	555911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021494	AATACA	2	12	576971	576982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021494	TTGAAT	2	12	585677	585688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021494	TAAAAA	2	12	588862	588873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021494	TTATTT	2	12	598454	598465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021494	GCCGAG	2	12	661208	661219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021494	TGAAAT	2	12	661843	661854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021494	TGGAAG	2	12	662671	662682	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021494	GCTGAG	2	12	709475	709486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021494	ATTTAA	2	12	732420	732431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021494	AGGAGA	2	12	761514	761525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021494	TGCTTA	2	12	777422	777433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021494	AAATTA	2	12	783668	783679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021494	TGAAAG	2	12	788742	788753	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021494	TTTTTA	2	12	790950	790961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021494	TTCCAC	2	12	809537	809548	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021494	TTTTAA	2	12	840686	840697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021494	ACTAGT	2	12	868887	868898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021494	TGCCAG	2	12	868997	869008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021494	TCTAGC	2	12	899996	900007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021494	AAATTA	2	12	926653	926664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021494	TAAAAA	2	12	944177	944188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021494	GCCGAG	2	12	950291	950302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021494	TGAAAT	2	12	950926	950937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021494	TGGAAG	2	12	951754	951765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021494	TAAATA	2	12	964251	964262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021494	ATCATT	2	12	994933	994944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021494	AAGGTA	2	12	1006990	1007001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021494	CTGATC	2	12	1009825	1009836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021494	TGCAAT	2	12	1010421	1010432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021494	TATTTT	2	12	1011475	1011486	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021494	GAGGAC	2	12	1038051	1038062	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021494	AAAAAG	2	12	1043423	1043434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021494	TCTTAT	2	12	1139169	1139180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021494	TTTATC	2	12	1139950	1139961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021494	GCAACT	2	12	1201226	1201237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021494	TAATGA	2	12	1253659	1253670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021494	TATAAA	2	12	1286937	1286948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021494	ATTAAA	2	12	1298909	1298920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021494	CCTTTA	2	12	1300141	1300152	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021494	AAACTA	2	12	1347158	1347169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021494	AGCTAG	2	12	1355234	1355245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021494	CACTTC	2	12	1355673	1355684	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021494	ATTTCA	2	12	1356503	1356514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021494	CTCGGC	2	12	1357138	1357149	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021494	AGGATT	2	12	1363533	1363544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021494	CACTTC	2	12	1374870	1374881	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021494	ATTTCA	2	12	1375700	1375711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021494	CTCGGC	2	12	1376335	1376346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021494	AATTAA	2	12	1467105	1467116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021494	GTATTG	2	12	1472715	1472726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021494	CATGAA	2	12	1473535	1473546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021494	ATTTTT	2	12	1473704	1473715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021494	ACTACA	2	12	1509170	1509181	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021494	TTAATT	2	12	1515734	1515745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021494	TATTTT	2	12	1530797	1530808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021494	TGAAAT	2	12	1536536	1536547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021494	AAAAGT	2	12	1565550	1565561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021494	TTGATT	2	12	1591626	1591637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021494	CTTCTA	2	12	1597142	1597153	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021494	ATTTTT	2	12	1662487	1662498	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021494	CACTTC	2	12	1709817	1709828	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021494	ATTTCA	2	12	1710647	1710658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021494	CTCGGC	2	12	1711282	1711293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021494	AGTTTA	2	12	1757305	1757316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021494	TAATGA	2	12	1775718	1775729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021494	TAAAAA	2	12	1788857	1788868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021494	TTATTT	2	12	1853354	1853365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021494	CACTTC	2	12	1857524	1857535	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021494	ATTTCA	2	12	1858354	1858365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021494	CTCGGC	2	12	1858989	1859000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021494	GAAAAA	2	12	1897679	1897690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.