MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterobacter sp. R4-368 plasmid pENT01

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021492	TTACT	2	10	1411	1420	20 %	60 %	0 %	20 %	512583418
2	NC_021492	TGCAA	2	10	2502	2511	40 %	20 %	20 %	20 %	512583420
3	NC_021492	CCAGG	2	10	2785	2794	20 %	0 %	40 %	40 %	512583420
4	NC_021492	GAAGC	2	10	6054	6063	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021492	ACACG	2	10	7159	7168	40 %	0 %	20 %	40 %	512583425
6	NC_021492	CAGAA	2	10	7277	7286	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021492	ATGCG	2	10	8194	8203	20 %	20 %	40 %	20 %	512583426
8	NC_021492	GAAAA	2	10	8394	8403	80 %	0 %	20 %	0 %	512583426
9	NC_021492	ACAAA	2	10	10015	10024	80 %	0 %	0 %	20 %	512583428
10	NC_021492	AACGA	2	10	10733	10742	60 %	0 %	20 %	20 %	512583429
11	NC_021492	AAACA	2	10	11815	11824	80 %	0 %	0 %	20 %	512583430
12	NC_021492	AGACC	2	10	12639	12648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021492	GAATA	2	10	13653	13662	60 %	20 %	20 %	0 %	512583432
14	NC_021492	TAAAT	2	10	13785	13794	60 %	40 %	0 %	0 %	512583433
15	NC_021492	CTTTT	2	10	14017	14026	0 %	80 %	0 %	20 %	512583433
16	NC_021492	GCAAA	2	10	14482	14491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021492	GCCGC	2	10	14717	14726	0 %	0 %	40 %	60 %	512583434
18	NC_021492	GCGCA	2	10	15345	15354	20 %	0 %	40 %	40 %	512583434
19	NC_021492	GTGAT	2	10	18092	18101	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021492	CAGAA	2	10	18149	18158	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021492	CAACT	2	10	18200	18209	40 %	20 %	0 %	40 %	512583438
22	NC_021492	TTTCT	2	10	20702	20711	0 %	80 %	0 %	20 %	512583440
23	NC_021492	CACCG	2	10	22161	22170	20 %	0 %	20 %	60 %	512583443
24	NC_021492	GCATC	2	10	22601	22610	20 %	20 %	20 %	40 %	512583443
25	NC_021492	GATAT	2	10	23846	23855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021492	ACGGA	2	10	24141	24150	40 %	0 %	40 %	20 %	512583445
27	NC_021492	CCCCG	2	10	26181	26190	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28	NC_021492	CCCCG	2	10	26221	26230	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_021492	CCGGG	2	10	26627	26636	0 %	0 %	60 %	40 %	512583449
30	NC_021492	ACCCC	2	10	27236	27245	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_021492	ATTTT	2	10	27437	27446	20 %	80 %	0 %	0 %	512583450
32	NC_021492	TGGCA	2	10	28460	28469	20 %	20 %	40 %	20 %	512583451
33	NC_021492	CAGGC	2	10	28811	28820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021492	TCCAT	2	10	29195	29204	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021492	TTGAT	2	10	29517	29526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021492	TTCCG	2	10	30983	30992	0 %	40 %	20 %	40 %	512583453
37	NC_021492	CCGAA	2	10	31750	31759	40 %	0 %	20 %	40 %	512583453
38	NC_021492	CTGGC	2	10	32548	32557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021492	GATGC	2	10	32869	32878	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021492	CTGGC	2	10	33472	33481	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021492	GACAG	2	10	36088	36097	40 %	0 %	40 %	20 %	512583414
42	NC_021492	CGAAA	2	10	38609	38618	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021492	GTGCC	2	10	38832	38841	0 %	20 %	40 %	40 %	512583465
44	NC_021492	TGCTC	2	10	39393	39402	0 %	40 %	20 %	40 %	512583466
45	NC_021492	AGGCC	2	10	39582	39591	20 %	0 %	40 %	40 %	512583466
46	NC_021492	CATCG	2	10	39737	39746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021492	CATTA	2	10	39963	39972	40 %	40 %	0 %	20 %	512583467
48	NC_021492	AGCGA	2	10	40416	40425	40 %	0 %	40 %	20 %	512583467
49	NC_021492	CGAAT	2	10	40518	40527	40 %	20 %	20 %	20 %	512583467
50	NC_021492	GCGGA	2	10	41915	41924	20 %	0 %	60 %	20 %	512583468
51	NC_021492	GAGCG	2	10	42272	42281	20 %	0 %	60 %	20 %	512583469
52	NC_021492	AAGGC	2	10	44121	44130	40 %	0 %	40 %	20 %	512583471
53	NC_021492	TGGCT	2	10	47030	47039	0 %	40 %	40 %	20 %	512583473
54	NC_021492	CGGCG	2	10	47104	47113	0 %	0 %	60 %	40 %	512583473
55	NC_021492	AGCGC	2	10	49848	49857	20 %	0 %	40 %	40 %	512583477
56	NC_021492	TGCTC	2	10	51151	51160	0 %	40 %	20 %	40 %	512583478
57	NC_021492	AGGCC	2	10	51340	51349	20 %	0 %	40 %	40 %	512583478
58	NC_021492	CGCTG	2	10	52635	52644	0 %	20 %	40 %	40 %	512583480
59	NC_021492	TACGC	2	10	52759	52768	20 %	20 %	20 %	40 %	512583480
60	NC_021492	GGTCA	2	10	54019	54028	20 %	20 %	40 %	20 %	512583480
61	NC_021492	CTGGG	2	10	54802	54811	0 %	20 %	60 %	20 %	512583480
62	NC_021492	TTTCT	2	10	55734	55743	0 %	80 %	0 %	20 %	512583415
63	NC_021492	TGACG	2	10	63406	63415	20 %	20 %	40 %	20 %	512583488
64	NC_021492	TTTTA	2	10	65110	65119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021492	GCCCC	2	10	65713	65722	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
66	NC_021492	GTTCG	2	10	66051	66060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021492	GTGCT	2	10	66215	66224	0 %	40 %	40 %	20 %	512583489
68	NC_021492	CGCCC	2	10	69010	69019	0 %	0 %	20 %	80 %	512583490
69	NC_021492	TTCAG	2	10	71157	71166	20 %	40 %	20 %	20 %	512583490
70	NC_021492	TCCCG	2	10	71434	71443	0 %	20 %	20 %	60 %	512583490
71	NC_021492	CGTGT	3	15	72189	72203	0 %	40 %	40 %	20 %	512583490
72	NC_021492	AGGTC	2	10	72388	72397	20 %	20 %	40 %	20 %	512583490
73	NC_021492	TTTCC	2	10	72430	72439	0 %	60 %	0 %	40 %	512583490
74	NC_021492	CGGCG	2	10	72949	72958	0 %	0 %	60 %	40 %	512583491
75	NC_021492	GGTTC	2	10	73083	73092	0 %	40 %	40 %	20 %	512583491
76	NC_021492	CTGCT	2	10	73189	73198	0 %	40 %	20 %	40 %	512583491
77	NC_021492	GGTCT	2	10	73307	73316	0 %	40 %	40 %	20 %	512583491
78	NC_021492	ACGGA	2	10	74150	74159	40 %	0 %	40 %	20 %	512583491
79	NC_021492	CGGAT	2	10	74350	74359	20 %	20 %	40 %	20 %	512583491
80	NC_021492	GCAGC	2	10	75832	75841	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021492	ACAAA	2	10	77152	77161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021492	CCCGC	2	10	81022	81031	0 %	0 %	20 %	80 %	512583495
83	NC_021492	ACGGC	2	10	83371	83380	20 %	0 %	40 %	40 %	512583499
84	NC_021492	TGTCC	2	10	84621	84630	0 %	40 %	20 %	40 %	512583501
85	NC_021492	CACAC	2	10	84848	84857	40 %	0 %	0 %	60 %	512583501
86	NC_021492	CTGTT	2	10	85694	85703	0 %	60 %	20 %	20 %	512583501
87	NC_021492	TGTGA	2	10	86199	86208	20 %	40 %	40 %	0 %	512583502
88	NC_021492	TTCCA	2	10	89180	89189	20 %	40 %	0 %	40 %	512583506
89	NC_021492	CCGCA	2	10	90250	90259	20 %	0 %	20 %	60 %	512583509
90	NC_021492	TGAAC	2	10	90780	90789	40 %	20 %	20 %	20 %	512583510
91	NC_021492	ACGCC	2	10	91143	91152	20 %	0 %	20 %	60 %	512583510
92	NC_021492	AAGCG	2	10	94944	94953	40 %	0 %	40 %	20 %	512583516
93	NC_021492	CGATT	2	10	101032	101041	20 %	40 %	20 %	20 %	512583524
94	NC_021492	TGCGG	2	10	101298	101307	0 %	20 %	60 %	20 %	512583525
95	NC_021492	TTCCG	2	10	101470	101479	0 %	40 %	20 %	40 %	512583525
96	NC_021492	GCAGG	2	10	104041	104050	20 %	0 %	60 %	20 %	512583528
97	NC_021492	GTGCG	2	10	104692	104701	0 %	20 %	60 %	20 %	512583529
98	NC_021492	CCCCT	2	10	105818	105827	0 %	20 %	0 %	80 %	512583531
99	NC_021492	CACAC	2	10	107076	107085	40 %	0 %	0 %	60 %	512583531
100	NC_021492	AACAG	2	10	108633	108642	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021492	CGGAA	2	10	108921	108930	40 %	0 %	40 %	20 %	512583534
102	NC_021492	TCTGT	2	10	110806	110815	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021492	CCGGG	2	10	111035	111044	0 %	0 %	60 %	40 %	512583539
104	NC_021492	GGCAC	2	10	111724	111733	20 %	0 %	40 %	40 %	512583540
105	NC_021492	GTCTT	2	10	113402	113411	0 %	60 %	20 %	20 %	512583542
106	NC_021492	AATTA	2	10	113872	113881	60 %	40 %	0 %	0 %	512583542

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.