MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida H8234

Total Repeats: 2329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021491	GCGT	2	8	36	43	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021491	TTGC	2	8	7257	7264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021491	AATG	2	8	11358	11365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021491	AGGC	2	8	18698	18705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021491	TGTA	2	8	21156	21163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021491	CGTG	2	8	22582	22589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021491	AAAG	2	8	23559	23566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021491	ATTT	2	8	37388	37395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021491	TTTA	2	8	59483	59490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021491	GCAC	2	8	59607	59614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021491	TGAT	2	8	60565	60572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021491	TTAA	2	8	60584	60591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021491	CGAT	2	8	60965	60972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021491	AAAG	2	8	60980	60987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021491	GGGC	2	8	63815	63822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021491	GCGA	2	8	71342	71349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021491	CTCA	2	8	73102	73109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021491	ATTT	2	8	73157	73164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021491	ATGA	2	8	73178	73185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021491	CGAA	2	8	73266	73273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021491	CAGC	2	8	75677	75684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021491	AGGT	2	8	75709	75716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021491	CGGG	2	8	84812	84819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021491	AGCC	2	8	87400	87407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021491	AGGA	2	8	89899	89906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021491	CAGC	2	8	91142	91149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021491	GCGA	2	8	91260	91267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021491	TGAC	2	8	91440	91447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021491	ACTG	2	8	91720	91727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021491	CGTC	2	8	91963	91970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021491	AAAG	2	8	92086	92093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021491	GTTG	2	8	92453	92460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021491	ATGA	2	8	98494	98501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021491	TGCA	2	8	106133	106140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021491	GATC	2	8	106200	106207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021491	TGAA	2	8	106663	106670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021491	GCGG	2	8	107229	107236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021491	CCGG	2	8	107556	107563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021491	CCTT	2	8	109282	109289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021491	ATCA	2	8	111286	111293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021491	GGCG	2	8	111351	111358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021491	GACA	2	8	111507	111514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021491	AGGC	2	8	112682	112689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021491	CGAG	2	8	113354	113361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021491	CGAG	2	8	114014	114021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021491	CGGC	2	8	115628	115635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021491	TGAC	2	8	116432	116439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021491	GTCG	2	8	117687	117694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021491	CCGG	2	8	117937	117944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021491	CGGC	2	8	118262	118269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021491	GCCA	2	8	118322	118329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021491	GTCG	2	8	118350	118357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021491	GTCG	2	8	119013	119020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021491	CGGC	2	8	119264	119271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021491	CGGC	2	8	119591	119598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021491	CGGC	2	8	120242	120249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021491	TGGT	2	8	122420	122427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021491	ACCT	2	8	122595	122602	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021491	AGCC	2	8	122916	122923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021491	GGCT	2	8	136778	136785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021491	GGCT	2	8	136826	136833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021491	GCTG	2	8	142658	142665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021491	GGAT	2	8	145580	145587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021491	CGAG	2	8	154444	154451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021491	GGCC	2	8	159388	159395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021491	CGCA	2	8	161376	161383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021491	GCAC	2	8	184670	184677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021491	AACT	2	8	194625	194632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021491	AGGC	2	8	197180	197187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021491	TAAA	2	8	204229	204236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021491	TAAA	2	8	206219	206226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021491	TTAT	2	8	206230	206237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021491	ACTC	2	8	211622	211629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021491	CAGC	2	8	217189	217196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021491	TGGC	2	8	226267	226274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021491	TTAC	2	8	238294	238301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021491	TGCT	2	8	240794	240801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021491	GCAG	2	8	244250	244257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021491	GGGA	2	8	244288	244295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021491	CGGT	2	8	251678	251685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021491	CACC	2	8	252077	252084	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_021491	ATCA	2	8	253290	253297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021491	ATCT	2	8	253908	253915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021491	CAAG	2	8	256543	256550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021491	GTCA	2	8	258299	258306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021491	GGTA	2	8	260295	260302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021491	GTTG	2	8	263144	263151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021491	CCTT	2	8	286109	286116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021491	GCGA	2	8	292649	292656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021491	ATCC	2	8	292742	292749	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021491	TTCT	2	8	292955	292962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021491	CGAC	2	8	293048	293055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021491	TAAA	2	8	293083	293090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021491	GGAT	2	8	295031	295038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021491	AAAG	2	8	295167	295174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021491	GCTG	2	8	303347	303354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021491	GCTG	2	8	303478	303485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021491	AATT	2	8	305925	305932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021491	CAGG	2	8	309662	309669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021491	GTAT	2	8	309684	309691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021491	CACC	2	8	309893	309900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_021491	TTGC	2	8	311705	311712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021491	ACAG	2	8	313304	313311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021491	ATTG	2	8	314843	314850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021491	GGCA	2	8	317018	317025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021491	CACG	2	8	320101	320108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021491	GCCC	2	8	321466	321473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_021491	ATGA	2	8	321593	321600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021491	CTCA	2	8	322053	322060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021491	GCTC	2	8	322076	322083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021491	TGCG	2	8	335640	335647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021491	TGAT	2	8	335739	335746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021491	TTCA	2	8	335979	335986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021491	CGGC	2	8	338244	338251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021491	GGCT	2	8	345289	345296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021491	GGGC	2	8	346505	346512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021491	TGCC	2	8	354357	354364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021491	CAGT	2	8	354391	354398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021491	CAAC	2	8	354470	354477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021491	ATAA	2	8	354483	354490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021491	CAGC	2	8	356367	356374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021491	GATC	2	8	358900	358907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021491	TGGC	2	8	364380	364387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021491	TTGC	2	8	373388	373395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021491	TGTT	2	8	373524	373531	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021491	TGCT	2	8	390445	390452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021491	CGAG	2	8	390463	390470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021491	TAAC	2	8	392068	392075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021491	GTGC	2	8	397950	397957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021491	GGCA	2	8	398005	398012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021491	TTGG	2	8	414635	414642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021491	GGCT	2	8	421355	421362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021491	TTTG	2	8	424983	424990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021491	AAGT	2	8	427632	427639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021491	CGCT	2	8	427868	427875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021491	GAAG	2	8	428084	428091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021491	CAGG	2	8	437472	437479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021491	AGCT	2	8	437521	437528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021491	AAGA	2	8	444730	444737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021491	CTCG	2	8	446753	446760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021491	TCAG	2	8	446782	446789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021491	TCGG	2	8	466333	466340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021491	CCGT	2	8	467936	467943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021491	TCCC	2	8	471450	471457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_021491	GCCC	2	8	471632	471639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_021491	TGCC	2	8	474271	474278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021491	CATT	2	8	475790	475797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021491	GGAG	2	8	480808	480815	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021491	CTGG	2	8	482371	482378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021491	AGGA	2	8	487854	487861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021491	CAGC	2	8	489097	489104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021491	GCGA	2	8	489215	489222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021491	TGAC	2	8	489395	489402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_021491	ACTG	2	8	489676	489683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_021491	CCTG	2	8	498546	498553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_021491	CGGT	2	8	499725	499732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021491	GTGG	2	8	499769	499776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021491	TCGA	2	8	508224	508231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_021491	GAAT	2	8	526190	526197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021491	TCTG	2	8	526591	526598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_021491	CTCG	2	8	531739	531746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_021491	GTAT	2	8	543485	543492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021491	TAAT	2	8	544331	544338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021491	TTGA	2	8	550146	550153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021491	TGTA	2	8	567881	567888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_021491	CCCG	2	8	568046	568053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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183	NC_021491	GCCC	2	8	585397	585404	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
184	NC_021491	GTGA	2	8	593373	593380	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021491	CCTG	2	8	593435	593442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_021491	CTGG	2	8	593605	593612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_021491	GCAT	2	8	593639	593646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
188	NC_021491	TTCG	2	8	601581	601588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_021491	ATCG	2	8	716079	716086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
234	NC_021491	ACGA	2	8	716577	716584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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236	NC_021491	AGCG	2	8	721970	721977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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296	NC_021491	CGCC	2	8	927134	927141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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455	NC_021491	AGCC	2	8	1515834	1515841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
456	NC_021491	ACCA	2	8	1515954	1515961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_021491	TCAG	2	8	1529970	1529977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_021491	TTGC	2	8	1547784	1547791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
470	NC_021491	ACTG	2	8	1547906	1547913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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472	NC_021491	CAGC	2	8	1556099	1556106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_021491	GTCA	2	8	1556216	1556223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_021491	GCAA	2	8	1556230	1556237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
475	NC_021491	ACTT	2	8	1559995	1560002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_021491	GGAG	2	8	1570404	1570411	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_021491	GGCT	2	8	1578135	1578142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_021491	GACA	2	8	1589875	1589882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_021491	CCAG	2	8	1594157	1594164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_021491	GCCA	2	8	1594393	1594400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_021491	CCCG	2	8	1601354	1601361	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
488	NC_021491	ATCC	2	8	1619438	1619445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_021491	TGGC	2	8	1619521	1619528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_021491	GCAG	2	8	1627941	1627948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_021491	CCTG	2	8	1628393	1628400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_021491	GATT	2	8	1629378	1629385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_021491	GTCT	2	8	1640609	1640616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_021491	TGCG	2	8	1640676	1640683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_021491	GGCA	2	8	1645869	1645876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_021491	GGGC	2	8	1646082	1646089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_021491	GACG	2	8	1650127	1650134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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