MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512556093
2	NC_021490	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556095
3	NC_021490	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556095
4	NC_021490	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556095
5	NC_021490	TTAAAT	2	12	7965	7976	50 %	50 %	0 %	0 %	512556097
6	NC_021490	ATTGAA	2	12	8548	8559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021490	TTGAGA	2	12	27321	27332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556106
8	NC_021490	GAACAG	2	12	31305	31316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556109
9	NC_021490	GTCTGG	2	12	31540	31551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556109
10	NC_021490	TTTCCG	2	12	34170	34181	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021490	TTGACG	2	12	38833	38844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556114
12	NC_021490	TGCATG	2	12	42335	42346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556118
13	NC_021490	CCTCCC	2	12	49438	49449	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_021490	CGTGCG	2	12	49793	49804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556125
15	NC_021490	GTCTGG	2	12	50263	50274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556125
16	NC_021490	GCACGA	2	12	59448	59459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021490	TGTAAC	2	12	62401	62412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556136
18	NC_021490	AGGGGC	2	12	65736	65747	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512556139
19	NC_021490	GCCATT	2	12	66856	66867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556140
20	NC_021490	TCTTGC	2	12	67085	67096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556140
21	NC_021490	TGAGCA	2	12	80022	80033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556155
22	NC_021490	CACTTT	2	12	84082	84093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556158
23	NC_021490	GGAGTA	2	12	85484	85495	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556159
24	NC_021490	CGTGAA	2	12	85703	85714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556159
25	NC_021490	ATTTGT	2	12	86824	86835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512556160
26	NC_021490	ACGCTT	2	12	87012	87023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556160
27	NC_021490	CGCTTG	2	12	92931	92942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021490	AGGGGA	2	12	97324	97335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556170
29	NC_021490	CGCACG	2	12	104088	104099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556177
30	NC_021490	GTCGGT	2	12	107690	107701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556181
31	NC_021490	ATCTGC	2	12	117196	117207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556187
32	NC_021490	TCTCAA	2	12	125131	125142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021490	TTTTAA	2	12	127473	127484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556193
34	NC_021490	TTGTCG	2	12	131513	131524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512556196
35	NC_021490	TCTTGA	2	12	133368	133379	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556198
36	NC_021490	GCAGAC	2	12	134719	134730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556198
37	NC_021490	CCGGAG	2	12	136215	136226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556199
38	NC_021490	CAGCTG	2	12	136439	136450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556199
39	NC_021490	CCGTGC	2	12	147409	147420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556207
40	NC_021490	CGGCTG	2	12	148599	148610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556209
41	NC_021490	GGCTGG	4	24	150541	150564	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021490	CGGCTC	2	12	151238	151249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556214
43	NC_021490	CTGCGG	4	24	151754	151777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021490	CGGCTC	2	12	152259	152270	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021490	CCGGAG	2	12	153617	153628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556216
46	NC_021490	CAGCTG	2	12	153841	153852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556216
47	NC_021490	TAAAAA	2	12	154172	154183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021490	GCAAGC	2	12	155964	155975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556218
49	NC_021490	CGGTGG	2	12	158728	158739	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512556220
50	NC_021490	GGGGGT	2	12	158756	158767	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	512556220
51	NC_021490	GTGTGC	2	12	174192	174203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556233
52	NC_021490	ACTGTT	2	12	178348	178359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556237
53	NC_021490	TGCGTA	2	12	179373	179384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556237
54	NC_021490	TTGGGT	2	12	187928	187939	0 %	50 %	50 %	0 %	512556246
55	NC_021490	GGAAGA	2	12	193134	193145	50 %	0 %	50 %	0 %	512556252
56	NC_021490	GACACT	2	12	193295	193306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556252
57	NC_021490	GGTGAG	2	12	193458	193469	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556252
58	NC_021490	GAGAAA	2	12	197651	197662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
59	NC_021490	CGGTGA	2	12	206213	206224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556266
60	NC_021490	AAAAGG	2	12	206478	206489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556266
61	NC_021490	TAAGGG	2	12	213265	213276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556281
62	NC_021490	TTTGGT	2	12	213873	213884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556283
63	NC_021490	GTGTTT	2	12	222823	222834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556294
64	NC_021490	TGCGCT	2	12	223571	223582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556295
65	NC_021490	TCTTGT	2	12	225397	225408	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512556296
66	NC_021490	GTGTTT	2	12	225426	225437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556296
67	NC_021490	TATGCT	2	12	229428	229439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556300
68	NC_021490	GTGCGA	2	12	234679	234690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021490	TCCTTC	2	12	236060	236071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021490	AGGAGA	2	12	236822	236833	50 %	0 %	50 %	0 %	512556302
71	NC_021490	GCAGAC	2	12	238907	238918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556305
72	NC_021490	GCGGGT	2	12	241548	241559	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512556307
73	NC_021490	GGAAAC	2	12	248099	248110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556316
74	NC_021490	TTTCTG	2	12	248635	248646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512556316
75	NC_021490	GGAATG	2	12	250457	250468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556317
76	NC_021490	ACCTTG	2	12	250831	250842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556317
77	NC_021490	GTTTGT	2	12	259109	259120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021490	AACGCA	2	12	262978	262989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512556323
79	NC_021490	CATGCG	2	12	265901	265912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556327
80	NC_021490	TTTTTC	2	12	268896	268907	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512556331
81	NC_021490	TACAAT	2	12	270092	270103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512556332
82	NC_021490	CCCTGC	2	12	272261	272272	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556335
83	NC_021490	GTGCGA	2	12	283124	283135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021490	TCCTTC	2	12	284505	284516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021490	TCATTT	2	12	286667	286678	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512556343
86	NC_021490	GGGTGA	2	12	294647	294658	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556351
87	NC_021490	CTGCCG	2	12	302892	302903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556357
88	NC_021490	ATGCGT	2	12	303030	303041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556357
89	NC_021490	GCTGCA	2	12	303740	303751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556357
90	NC_021490	TGATGT	2	12	304962	304973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556358
91	NC_021490	GCAGTT	2	12	305143	305154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556358
92	NC_021490	TGCGCT	2	12	306797	306808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556360
93	NC_021490	GGCTGC	2	12	310912	310923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556364
94	NC_021490	CTCCGT	2	12	315046	315057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556367
95	NC_021490	GAAATC	2	12	317428	317439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556370
96	NC_021490	GTATGG	2	12	317670	317681	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	512556370
97	NC_021490	GTGAAA	2	12	318233	318244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512556370
98	NC_021490	ACGGTC	2	12	321152	321163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556371
99	NC_021490	TGAGCG	2	12	323173	323184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556372
100	NC_021490	CGGCAC	2	12	323625	323636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556372
101	NC_021490	TGCAGG	2	12	325484	325495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556374
102	NC_021490	GCACCG	2	12	331626	331637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021490	CCGGAG	2	12	333000	333011	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021490	CAGCTG	2	12	333224	333235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021490	TGGCAT	2	12	337519	337530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556384
106	NC_021490	GCTGTG	2	12	341044	341055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556387
107	NC_021490	GTGCTC	2	12	341095	341106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
108	NC_021490	TGTTCG	2	12	341265	341276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512556387
109	NC_021490	TTCATG	2	12	341381	341392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556387
110	NC_021490	ACCGTC	2	12	341417	341428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556387
111	NC_021490	TTTGGA	2	12	345078	345089	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556387
112	NC_021490	GAGCGC	2	12	346539	346550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556388
113	NC_021490	CTTTGA	2	12	346982	346993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556388
114	NC_021490	AATATA	2	12	355129	355140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021490	GTGTTG	2	12	372023	372034	0 %	50 %	50 %	0 %	512556406
116	NC_021490	TTTCCG	2	12	372392	372403	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021490	CAGGAG	2	12	374404	374415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556408
118	NC_021490	TGGGAG	2	12	374576	374587	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556408
119	NC_021490	CTTTTG	2	12	377680	377691	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512556411
120	NC_021490	CGTGGT	2	12	380884	380895	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556417
121	NC_021490	TCGCGT	2	12	390822	390833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556427
122	NC_021490	CTGAGC	2	12	394446	394457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556429
123	NC_021490	GTCATC	2	12	395607	395618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556430
124	NC_021490	GTGCGC	2	12	396189	396200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556431
125	NC_021490	TGCGAA	2	12	397238	397249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556432
126	NC_021490	CCGCGT	2	12	398062	398073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556433
127	NC_021490	TGCAGA	2	12	399441	399452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556434
128	NC_021490	GCAGGA	2	12	399645	399656	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556434
129	NC_021490	CAGGGG	2	12	403604	403615	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512556437
130	NC_021490	GTACTG	2	12	406922	406933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556438
131	NC_021490	GGGGCG	2	12	409947	409958	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512556441
132	NC_021490	TGTAGG	2	12	414711	414722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	512556446
133	NC_021490	AAGGGG	2	12	414910	414921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556446
134	NC_021490	ATTAAA	2	12	415390	415401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556446
135	NC_021490	GGGAGA	2	12	416613	416624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556447
136	NC_021490	TATTGA	2	12	419935	419946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512556451
137	NC_021490	GAAGAT	2	12	426843	426854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512556457
138	NC_021490	ACGCGC	2	12	429871	429882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556460
139	NC_021490	TGCTCG	2	12	431739	431750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556463
140	NC_021490	TTTTTG	2	12	436335	436346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	512556466
141	NC_021490	TGACCG	2	12	437271	437282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556468
142	NC_021490	ACGCTT	2	12	438001	438012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556468
143	NC_021490	TCCGAC	2	12	441597	441608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556471
144	NC_021490	GCGATT	2	12	442293	442304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556472
145	NC_021490	GGCCCT	2	12	445690	445701	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556475
146	NC_021490	GTTGCC	2	12	448818	448829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556477
147	NC_021490	GCGTGT	2	12	451373	451384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556479
148	NC_021490	TGTGCA	2	12	457950	457961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556486
149	NC_021490	CGTGCG	2	12	470358	470369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556498
150	NC_021490	CGTGCC	2	12	472446	472457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556500
151	NC_021490	ACGTGT	2	12	472744	472755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556500
152	NC_021490	CGCGTA	2	12	477513	477524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556505
153	NC_021490	ACAGGA	2	12	478084	478095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556506
154	NC_021490	ACTGCA	2	12	480090	480101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556507
155	NC_021490	GTGCGC	2	12	488139	488150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556514
156	NC_021490	ACGTGC	2	12	488808	488819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556514
157	NC_021490	GGCAGC	2	12	489298	489309	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556514
158	NC_021490	GGTGCG	2	12	489781	489792	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512556514
159	NC_021490	GGGGAA	2	12	492309	492320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556518
160	NC_021490	GTGTGC	2	12	494864	494875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556521
161	NC_021490	GAGGGC	2	12	499438	499449	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512556525
162	NC_021490	TTTGAG	2	12	516953	516964	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556538
163	NC_021490	GTGACG	2	12	519057	519068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556540
164	NC_021490	GCACCG	2	12	521747	521758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_021490	CGTGCG	2	12	525395	525406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021490	TGGAGA	2	12	525637	525648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556543
167	NC_021490	CGATGG	2	12	529713	529724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556547
168	NC_021490	CTGACG	2	12	531041	531052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556547
169	NC_021490	CTGTAT	2	12	533178	533189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556549
170	NC_021490	GAATGG	2	12	537615	537626	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556553
171	NC_021490	ATATTG	2	12	539545	539556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512556555
172	NC_021490	TCACCG	2	12	541519	541530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556557
173	NC_021490	CGTGTA	2	12	541960	541971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556557
174	NC_021490	AGCAGG	2	12	543804	543815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556558
175	NC_021490	GAAATG	2	12	553918	553929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512556566
176	NC_021490	TTTCCA	2	12	555135	555146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556567
177	NC_021490	ATGTGC	2	12	556011	556022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556567
178	NC_021490	AAAGGT	2	12	556613	556624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512556567
179	NC_021490	TCAGTA	2	12	560510	560521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556570
180	NC_021490	TAACCC	2	12	562302	562313	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_021490	ATACTG	2	12	562396	562407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_021490	CGCGTG	2	12	563965	563976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556572
183	NC_021490	TCTTTT	2	12	568022	568033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512556575
184	NC_021490	TCAGTA	2	12	569229	569240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556576
185	NC_021490	ATACCC	2	12	573392	573403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556579
186	NC_021490	AGCACC	2	12	580170	580181	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556586
187	NC_021490	AGCAGA	2	12	585354	585365	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556592
188	NC_021490	GCGCTC	2	12	587153	587164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556593
189	NC_021490	AGACAT	2	12	597613	597624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556600
190	NC_021490	ACTACC	2	12	597641	597652	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556600
191	NC_021490	ATATCG	2	12	598055	598066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556600
192	NC_021490	GCGCGA	2	12	607198	607209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556609
193	NC_021490	GCCCCT	2	12	607499	607510	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556609
194	NC_021490	CACACG	2	12	608232	608243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556610
195	NC_021490	ACGGCC	2	12	615376	615387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556615
196	NC_021490	AAAGAA	2	12	615847	615858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512556616
197	NC_021490	AAATAC	2	12	616352	616363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512556616
198	NC_021490	TCCTTT	2	12	617643	617654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556617
199	NC_021490	CGGTTG	2	12	622669	622680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556622
200	NC_021490	TCCGCG	2	12	624039	624050	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556623
201	NC_021490	TTTCAC	2	12	625151	625162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556623
202	NC_021490	AGCGCG	2	12	628907	628918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556626
203	NC_021490	ACGCGC	2	12	631690	631701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556628
204	NC_021490	GTTATT	2	12	634839	634850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512556631
205	NC_021490	GCACAC	2	12	640960	640971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556634
206	NC_021490	AGCCAT	2	12	642404	642415	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556636
207	NC_021490	TCAGAT	2	12	652329	652340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556643
208	NC_021490	CTCGCT	2	12	652583	652594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556644
209	NC_021490	CACGCC	2	12	658562	658573	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512556650
210	NC_021490	CTCATC	2	12	658836	658847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512556651
211	NC_021490	CAAAAG	2	12	660739	660750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512556652
212	NC_021490	CTGCTC	2	12	663734	663745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556654
213	NC_021490	ACCTAC	2	12	666024	666035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556656
214	NC_021490	GGCGCA	2	12	670049	670060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556659
215	NC_021490	GCACCG	2	12	671196	671207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556661
216	NC_021490	GCACCG	2	12	671984	671995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556663
217	NC_021490	CAAAAT	2	12	673135	673146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512556664
218	NC_021490	CCGGAG	2	12	673992	674003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556664
219	NC_021490	CAGCTG	2	12	674216	674227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556664
220	NC_021490	TGCACG	2	12	680676	680687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556668
221	NC_021490	CGGTGT	2	12	681474	681485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556668
222	NC_021490	TGAGCG	2	12	685428	685439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556671
223	NC_021490	TGCAAT	2	12	687623	687634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556672
224	NC_021490	TGTTTT	2	12	688858	688869	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	512556673
225	NC_021490	CGGCCG	2	12	694556	694567	0 %	0 %	50 %	50 %	512556678
226	NC_021490	ATTGAG	2	12	695346	695357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556678
227	NC_021490	GCTTCT	2	12	696226	696237	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556678
228	NC_021490	ATACCC	2	12	697056	697067	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556679
229	NC_021490	GAAAGA	2	12	697202	697213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556679
230	NC_021490	TTCTCC	2	12	699191	699202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
231	NC_021490	CAGGAT	2	12	712145	712156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556691
232	NC_021490	CCTCCG	2	12	716760	716771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_021490	CCTGTA	2	12	720285	720296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556697
234	NC_021490	TGCATT	2	12	722841	722852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556700
235	NC_021490	CCCATC	2	12	724095	724106	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	512556701
236	NC_021490	CTCATC	2	12	724446	724457	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512556701
237	NC_021490	GTGTGG	2	12	727531	727542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556704
238	NC_021490	CCGGGC	2	12	728623	728634	0 %	0 %	50 %	50 %	512556706
239	NC_021490	CAGCAA	2	12	731896	731907	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512556709
240	NC_021490	CAGCAT	2	12	731908	731919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556709
241	NC_021490	AAGCGC	2	12	735597	735608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
242	NC_021490	TGCATA	2	12	736564	736575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556711
243	NC_021490	GCCAAT	2	12	737091	737102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556712
244	NC_021490	ACCGTA	2	12	738224	738235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556713
245	NC_021490	AACCGC	2	12	740029	740040	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556714
246	NC_021490	ATACAT	2	12	754939	754950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512556728
247	NC_021490	TCTTGC	2	12	756243	756254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556728
248	NC_021490	ATCTAG	2	12	760034	760045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556732
249	NC_021490	CCACAC	2	12	763102	763113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556734
250	NC_021490	GCCCCT	2	12	763440	763451	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556735
251	NC_021490	TTTCCG	2	12	764294	764305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556736
252	NC_021490	ACGCGC	2	12	766695	766706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_021490	GACACC	2	12	768258	768269	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556739
254	NC_021490	GGCACA	2	12	772533	772544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556743
255	NC_021490	TTAAAG	2	12	778229	778240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512556747
256	NC_021490	ATTCCC	2	12	780881	780892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512556750
257	NC_021490	AGTCCA	2	12	785001	785012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556752
258	NC_021490	CCTGCG	2	12	789392	789403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556758
259	NC_021490	ACGTGC	2	12	790850	790861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556759
260	NC_021490	CTGCGC	2	12	796145	796156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556766
261	NC_021490	GGGCAG	2	12	796531	796542	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512556766
262	NC_021490	TGTGAC	2	12	799315	799326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556769
263	NC_021490	AACGGC	2	12	800239	800250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556770
264	NC_021490	CGGGGG	2	12	800259	800270	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512556770
265	NC_021490	TTTCCA	2	12	800846	800857	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556771
266	NC_021490	GCATAC	2	12	802832	802843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556772
267	NC_021490	TTGGAA	2	12	804286	804297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556774
268	NC_021490	TAACGT	2	12	807187	807198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556777
269	NC_021490	GCACTT	2	12	808215	808226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556778
270	NC_021490	GAGCAA	2	12	809688	809699	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556780
271	NC_021490	ACGCAG	2	12	810601	810612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_021490	GCGAGC	2	12	811758	811769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556783
273	NC_021490	CATCTT	2	12	815721	815732	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556785
274	NC_021490	AGAGCG	2	12	819196	819207	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556789
275	NC_021490	ACACGC	2	12	819436	819447	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
276	NC_021490	AACTCA	2	12	825769	825780	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	512556796
277	NC_021490	GCACAC	2	12	827766	827777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556798
278	NC_021490	GCAGGG	2	12	827888	827899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_021490	CCAGTC	2	12	833636	833647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556803
280	NC_021490	GCAAGC	2	12	849914	849925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556816
281	NC_021490	ACCCCT	2	12	851247	851258	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	512556818
282	NC_021490	CAGAGA	2	12	853633	853644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_021490	GCATCT	2	12	863849	863860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556831
284	NC_021490	GTGCAC	2	12	869914	869925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_021490	GGTATC	2	12	873738	873749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556838
286	NC_021490	CACGCG	2	12	877235	877246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556840
287	NC_021490	AAAGAC	2	12	882473	882484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
288	NC_021490	TGCTCC	2	12	883610	883621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556846
289	NC_021490	AAAACT	2	12	885206	885217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512556847
290	NC_021490	CAAACA	2	12	885690	885701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556848
291	NC_021490	CCATCC	2	12	890422	890433	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_021490	CACCTT	2	12	892565	892576	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512556856
293	NC_021490	CAGGTG	2	12	896769	896780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556860
294	NC_021490	AAAGAC	2	12	899477	899488	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512556864
295	NC_021490	TATCAG	2	12	901912	901923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556866
296	NC_021490	CTGCGC	2	12	905555	905566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556868
297	NC_021490	GGCGCA	2	12	907718	907729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_021490	GCGATA	2	12	911091	911102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556871
299	NC_021490	TTTTCA	2	12	924239	924250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512556885
300	NC_021490	CTTCTG	3	18	925567	925584	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556886
301	NC_021490	CAAGCT	2	12	928534	928545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556887
302	NC_021490	ACAGGC	2	12	930441	930452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556887
303	NC_021490	GAGTGG	2	12	937080	937091	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556891
304	NC_021490	CTTGCG	2	12	938279	938290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556892
305	NC_021490	TCGTAT	2	12	938516	938527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556892
306	NC_021490	GCGCAA	2	12	940191	940202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556893
307	NC_021490	GCTCCT	2	12	941639	941650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556894
308	NC_021490	GCGCTC	2	12	942761	942772	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556895
309	NC_021490	AAATGC	2	12	943348	943359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556896
310	NC_021490	GCAGGA	2	12	945359	945370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556897
311	NC_021490	AAGCTC	2	12	948063	948074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556898
312	NC_021490	CTGCGC	2	12	951633	951644	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556904
313	NC_021490	CAACAT	2	12	956624	956635	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	512556910
314	NC_021490	CAAAAA	2	12	961959	961970	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512556915
315	NC_021490	TTCTCC	2	12	967073	967084	0 %	50 %	0 %	50 %	512556919
316	NC_021490	ACTCGA	2	12	967091	967102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556920
317	NC_021490	AGATCA	2	12	968479	968490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556921
318	NC_021490	CTGATA	2	12	971241	971252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556923
319	NC_021490	CCGGAG	2	12	977986	977997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556930
320	NC_021490	GCAGGA	2	12	978333	978344	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556930
321	NC_021490	CAGCTC	2	12	978668	978679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556930
322	NC_021490	CCGGCT	2	12	980881	980892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556930
323	NC_021490	ACCTGC	2	12	981059	981070	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556930
324	NC_021490	TCTTCA	2	12	982454	982465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556931
325	NC_021490	TCTGCG	2	12	988863	988874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556937
326	NC_021490	GGACGT	2	12	989446	989457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556938
327	NC_021490	ACAAAC	2	12	989630	989641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556939
328	NC_021490	CCACGG	2	12	992960	992971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556943
329	NC_021490	GAGCAG	2	12	995525	995536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
330	NC_021490	CTTGCA	2	12	999495	999506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556950
331	NC_021490	CAGCGC	2	12	1000200	1000211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556950
332	NC_021490	GCTAAC	2	12	1003769	1003780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556953
333	NC_021490	TACCGT	2	12	1003886	1003897	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556953
334	NC_021490	TGGCGG	2	12	1010279	1010290	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512556958
335	NC_021490	ACGCTG	2	12	1010603	1010614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556958
336	NC_021490	ACTGAC	2	12	1017511	1017522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556962
337	NC_021490	GCGCGT	2	12	1020158	1020169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556964
338	NC_021490	AAAAGA	3	18	1031625	1031642	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512556976
339	NC_021490	TGCCTC	2	12	1037583	1037594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556982
340	NC_021490	CGGTTA	2	12	1045200	1045211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556990
341	NC_021490	CTCGCC	2	12	1045960	1045971	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556990
342	NC_021490	CATGTT	2	12	1050824	1050835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556995
343	NC_021490	TTCGCC	2	12	1050896	1050907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556995
344	NC_021490	CCCGCT	2	12	1051590	1051601	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556995
345	NC_021490	TCTTGC	2	12	1052686	1052697	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512556996
346	NC_021490	GCCACC	2	12	1060153	1060164	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512557002
347	NC_021490	GGAGCC	2	12	1064994	1065005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512557007
348	NC_021490	GGTGCG	2	12	1067210	1067221	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512557009
349	NC_021490	AGAGGA	2	12	1067997	1068008	50 %	0 %	50 %	0 %	512557010
350	NC_021490	GAGGTG	2	12	1070644	1070655	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512557012
351	NC_021490	TCTTTT	2	12	1072725	1072736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512557013
352	NC_021490	ACGCAG	2	12	1075985	1075996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557017
353	NC_021490	TATGAG	2	12	1081119	1081130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557022
354	NC_021490	TGACGA	2	12	1089838	1089849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512557026
355	NC_021490	ATCTGC	2	12	1095984	1095995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557032
356	NC_021490	AACTCC	2	12	1098186	1098197	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512557033
357	NC_021490	AAAGCG	2	12	1098947	1098958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512557034
358	NC_021490	ACTGCA	2	12	1100992	1101003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512557035
359	NC_021490	TAATTC	2	12	1104329	1104340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512557038
360	NC_021490	CATGCA	2	12	1105444	1105455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512557039
361	NC_021490	TTGCCA	2	12	1112570	1112581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557045
362	NC_021490	GCCCTC	2	12	1114249	1114260	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512557047
363	NC_021490	CTGTGC	2	12	1115173	1115184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557048
364	NC_021490	CGCCTT	2	12	1116667	1116678	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512557049
365	NC_021490	TCTGCA	2	12	1118256	1118267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557050
366	NC_021490	ATGCGT	2	12	1120072	1120083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512557053
367	NC_021490	GCTGAC	2	12	1126503	1126514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512557058
368	NC_021490	TGCACG	2	12	1126901	1126912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512557058
369	NC_021490	AATTTC	2	12	1127756	1127767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512557059
370	NC_021490	AGCCCC	2	12	1128629	1128640	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512557060
371	NC_021490	TCCTCG	2	12	1129644	1129655	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512557061

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.