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Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 1035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021490	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021490	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021490	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021490	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021490	TGT	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021490	GAG	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021490	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021490	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021490	TCT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021490	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021490	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021490	CTG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021490	ACG	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021490	ATC	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021490	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021490	CGC	2	6	9010	9015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021490	CCT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021490	ACG	2	6	9118	9123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021490	TCT	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021490	CGA	2	6	9174	9179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021490	TGT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021490	CCT	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021490	CTT	2	6	9403	9408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021490	TCT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021490	GTG	2	6	9618	9623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021490	GCT	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021490	GAT	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021490	AGT	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021490	CAC	2	6	10160	10165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021490	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021490	GTG	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021490	AGT	2	6	10324	10329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021490	GAT	2	6	12430	12435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021490	TAT	2	6	13848	13853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021490	GTG	2	6	13907	13912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021490	GGC	2	6	24331	24336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021490	CAA	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021490	CAA	3	9	24578	24586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021490	ACC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021490	CCA	2	6	24941	24946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021490	AGC	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021490	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021490	CTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021490	AGG	2	6	29054	29059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021490	CTC	2	6	32947	32952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021490	TGC	2	6	34203	34208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021490	TAT	2	6	38198	38203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021490	TGA	2	6	38213	38218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021490	CCT	2	6	41731	41736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021490	TTC	2	6	42842	42847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021490	AGT	2	6	42909	42914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021490	CCT	2	6	45570	45575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021490	ACA	2	6	45587	45592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021490	CTG	2	6	47022	47027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021490	CCT	2	6	47054	47059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021490	AGC	2	6	47178	47183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021490	CTG	2	6	47184	47189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021490	GCA	2	6	47351	47356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021490	TGC	2	6	47571	47576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021490	TCT	2	6	52576	52581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021490	AGA	2	6	54505	54510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021490	AGG	2	6	55584	55589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021490	ACG	2	6	55638	55643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021490	CAG	2	6	55657	55662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021490	CAC	2	6	55698	55703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021490	GTG	2	6	55746	55751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021490	GAT	2	6	57624	57629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021490	TGC	2	6	57646	57651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021490	ATA	2	6	57715	57720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021490	CAC	2	6	57756	57761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021490	GGC	2	6	57996	58001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021490	CAT	2	6	58106	58111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021490	GGA	2	6	58807	58812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021490	CAT	2	6	59488	59493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021490	TTG	2	6	59536	59541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021490	CCT	3	9	62808	62816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021490	GTA	2	6	62832	62837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021490	GCG	2	6	62865	62870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021490	TGT	2	6	64037	64042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021490	TCA	2	6	64115	64120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021490	GGA	2	6	67573	67578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021490	TCC	2	6	67615	67620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021490	CCT	2	6	69662	69667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021490	AAC	2	6	69735	69740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021490	TCT	2	6	70704	70709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021490	AGG	2	6	71046	71051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021490	AAC	2	6	72870	72875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021490	GCG	2	6	72900	72905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021490	GCA	2	6	73046	73051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021490	AAG	2	6	73221	73226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021490	CAG	2	6	73773	73778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021490	GTT	2	6	73797	73802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021490	TTC	2	6	73851	73856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021490	TCC	2	6	73964	73969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021490	TCG	2	6	73973	73978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021490	GGT	2	6	73981	73986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021490	CGA	2	6	73998	74003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021490	AGT	2	6	78629	78634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021490	GTC	2	6	79060	79065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021490	TTG	2	6	80687	80692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021490	TCT	3	9	82358	82366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021490	GCA	2	6	84254	84259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021490	CTG	2	6	90697	90702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021490	TGC	2	6	90755	90760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021490	TGA	2	6	90771	90776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021490	ACC	2	6	90783	90788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021490	TTC	2	6	90797	90802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021490	AGT	2	6	90908	90913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021490	AAG	2	6	90977	90982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021490	GCA	2	6	90984	90989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021490	TCT	2	6	91137	91142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021490	AGG	2	6	91194	91199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021490	AAT	2	6	91256	91261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021490	GGA	2	6	91327	91332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021490	AAT	2	6	91458	91463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021490	CAA	2	6	91555	91560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021490	GCT	2	6	91611	91616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021490	AGT	2	6	91796	91801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021490	ATC	2	6	91874	91879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021490	GCG	2	6	91888	91893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021490	ATT	2	6	92507	92512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021490	AAG	2	6	92606	92611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021490	GAA	2	6	92617	92622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021490	CAG	2	6	92785	92790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021490	TGA	2	6	92824	92829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021490	GAA	2	6	92957	92962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021490	TTG	2	6	94401	94406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021490	ACC	2	6	94718	94723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021490	TCG	2	6	98693	98698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021490	CTT	2	6	99875	99880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021490	TTG	2	6	101580	101585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021490	GAT	2	6	101613	101618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021490	GTA	2	6	102767	102772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021490	AAT	2	6	102775	102780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021490	TTC	2	6	105860	105865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021490	CTG	2	6	106359	106364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021490	AGC	2	6	106710	106715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021490	AAG	2	6	113657	113662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021490	CGT	2	6	113774	113779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021490	GGA	2	6	113859	113864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021490	TGC	2	6	115764	115769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_021490	TCC	2	6	123676	123681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021490	TCC	2	6	124667	124672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_021490	AGA	2	6	125033	125038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021490	GAG	2	6	125086	125091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021490	GTG	2	6	126977	126982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021490	GCC	2	6	157622	157627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_021490	CTG	2	6	159487	159492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021490	AGA	2	6	159628	159633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021490	CCG	2	6	166955	166960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_021490	CCG	2	6	169175	169180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_021490	ACC	2	6	170288	170293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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195	NC_021490	GGA	2	6	177123	177128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_021490	AGG	2	6	259126	259131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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