MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 4503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
2	NC_021490	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
3	NC_021490	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
4	NC_021490	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
5	NC_021490	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021490	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512556092
7	NC_021490	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512556092
8	NC_021490	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512556093
9	NC_021490	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512556093
10	NC_021490	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512556093
11	NC_021490	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512556093
12	NC_021490	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512556094
13	NC_021490	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512556094
14	NC_021490	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021490	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512556095
16	NC_021490	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512556095
17	NC_021490	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512556095
18	NC_021490	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	512556095
19	NC_021490	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	512556095
20	NC_021490	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	512556097
21	NC_021490	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	512556097
22	NC_021490	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	512556097
23	NC_021490	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021490	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021490	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021490	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021490	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021490	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021490	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021490	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	512556098
31	NC_021490	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	512556098
32	NC_021490	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
33	NC_021490	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
34	NC_021490	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	512556098
35	NC_021490	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	512556098
36	NC_021490	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
37	NC_021490	GA	3	6	12511	12516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021490	GT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021490	GC	3	6	12613	12618	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
40	NC_021490	GC	3	6	13060	13065	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
41	NC_021490	GT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	512556099
42	NC_021490	CA	4	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	512556099
43	NC_021490	GA	3	6	13319	13324	50 %	0 %	50 %	0 %	512556099
44	NC_021490	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
45	NC_021490	CT	4	8	13579	13586	0 %	50 %	0 %	50 %	512556099
46	NC_021490	GC	3	6	14266	14271	0 %	0 %	50 %	50 %	512556100
47	NC_021490	CG	3	6	14300	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	512556100
48	NC_021490	AT	3	6	14543	14548	50 %	50 %	0 %	0 %	512556100
49	NC_021490	TG	3	6	15953	15958	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
50	NC_021490	CG	3	6	16388	16393	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
51	NC_021490	CG	3	6	16495	16500	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
52	NC_021490	GT	4	8	16826	16833	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
53	NC_021490	CA	3	6	16835	16840	50 %	0 %	0 %	50 %	512556101
54	NC_021490	GT	3	6	17216	17221	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
55	NC_021490	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
56	NC_021490	AG	3	6	17368	17373	50 %	0 %	50 %	0 %	512556101
57	NC_021490	GT	3	6	17513	17518	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
58	NC_021490	CG	4	8	17522	17529	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
59	NC_021490	GT	3	6	18262	18267	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
60	NC_021490	AT	3	6	18649	18654	50 %	50 %	0 %	0 %	512556102
61	NC_021490	GT	3	6	18705	18710	0 %	50 %	50 %	0 %	512556102
62	NC_021490	GC	3	6	18755	18760	0 %	0 %	50 %	50 %	512556102
63	NC_021490	CG	3	6	19428	19433	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
64	NC_021490	CG	3	6	19910	19915	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
65	NC_021490	GT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	50 %	0 %	512556103
66	NC_021490	CG	3	6	20762	20767	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
67	NC_021490	CT	4	8	21105	21112	0 %	50 %	0 %	50 %	512556103
68	NC_021490	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
69	NC_021490	GA	3	6	21664	21669	50 %	0 %	50 %	0 %	512556103
70	NC_021490	CA	3	6	21858	21863	50 %	0 %	0 %	50 %	512556103
71	NC_021490	CG	3	6	22423	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	512556104
72	NC_021490	AC	3	6	22430	22435	50 %	0 %	0 %	50 %	512556104
73	NC_021490	GT	3	6	22593	22598	0 %	50 %	50 %	0 %	512556104
74	NC_021490	CG	3	6	23213	23218	0 %	0 %	50 %	50 %	512556104
75	NC_021490	GA	3	6	23681	23686	50 %	0 %	50 %	0 %	512556104
76	NC_021490	GA	4	8	24346	24353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021490	CA	3	6	24384	24389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021490	TC	3	6	24425	24430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021490	GA	4	8	24490	24497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021490	TC	3	6	24570	24575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021490	AG	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
82	NC_021490	TG	3	6	26027	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
83	NC_021490	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
84	NC_021490	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
85	NC_021490	CG	3	6	26740	26745	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
86	NC_021490	GA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
87	NC_021490	GT	4	8	27413	27420	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
88	NC_021490	GC	4	8	27455	27462	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
89	NC_021490	GT	4	8	27807	27814	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
90	NC_021490	GT	3	6	28048	28053	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
91	NC_021490	AT	4	8	28141	28148	50 %	50 %	0 %	0 %	512556107
92	NC_021490	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
93	NC_021490	TG	3	6	28509	28514	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
94	NC_021490	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021490	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	512556108
96	NC_021490	TC	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	512556108
97	NC_021490	AG	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	512556109
98	NC_021490	TC	3	6	30394	30399	0 %	50 %	0 %	50 %	512556109
99	NC_021490	TG	3	6	30634	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
100	NC_021490	CA	3	6	30960	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	512556109
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102	NC_021490	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	512556109
103	NC_021490	GA	3	6	31732	31737	50 %	0 %	50 %	0 %	512556109
104	NC_021490	GT	3	6	32401	32406	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
105	NC_021490	AC	3	6	32442	32447	50 %	0 %	0 %	50 %	512556109
106	NC_021490	GC	3	6	32986	32991	0 %	0 %	50 %	50 %	512556110
107	NC_021490	AG	3	6	33098	33103	50 %	0 %	50 %	0 %	512556110
108	NC_021490	AG	3	6	33107	33112	50 %	0 %	50 %	0 %	512556110
109	NC_021490	CG	3	6	33308	33313	0 %	0 %	50 %	50 %	512556110
110	NC_021490	AC	3	6	33733	33738	50 %	0 %	0 %	50 %	512556110
111	NC_021490	CG	3	6	33999	34004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021490	GT	3	6	34191	34196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021490	CG	4	8	34815	34822	0 %	0 %	50 %	50 %	512556111
114	NC_021490	GC	3	6	34998	35003	0 %	0 %	50 %	50 %	512556111
115	NC_021490	GC	3	6	35053	35058	0 %	0 %	50 %	50 %	512556111
116	NC_021490	AT	3	6	35127	35132	50 %	50 %	0 %	0 %	512556111
117	NC_021490	TA	3	6	35216	35221	50 %	50 %	0 %	0 %	512556111
118	NC_021490	TG	3	6	35372	35377	0 %	50 %	50 %	0 %	512556111
119	NC_021490	GC	3	6	35442	35447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021490	TG	3	6	35492	35497	0 %	50 %	50 %	0 %	512556112
121	NC_021490	CT	3	6	35670	35675	0 %	50 %	0 %	50 %	512556112
122	NC_021490	GT	4	8	35870	35877	0 %	50 %	50 %	0 %	512556112
123	NC_021490	GC	3	6	36017	36022	0 %	0 %	50 %	50 %	512556112
124	NC_021490	CA	4	8	36066	36073	50 %	0 %	0 %	50 %	512556112
125	NC_021490	AC	3	6	36094	36099	50 %	0 %	0 %	50 %	512556112
126	NC_021490	TG	3	6	36110	36115	0 %	50 %	50 %	0 %	512556112
127	NC_021490	CG	3	6	36637	36642	0 %	0 %	50 %	50 %	512556112
128	NC_021490	TG	3	6	36894	36899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021490	GT	3	6	36968	36973	0 %	50 %	50 %	0 %	512556113
130	NC_021490	CA	3	6	37018	37023	50 %	0 %	0 %	50 %	512556113
131	NC_021490	GC	3	6	37523	37528	0 %	0 %	50 %	50 %	512556113
132	NC_021490	TG	3	6	37977	37982	0 %	50 %	50 %	0 %	512556113
133	NC_021490	GC	3	6	38087	38092	0 %	0 %	50 %	50 %	512556113
134	NC_021490	CT	3	6	39423	39428	0 %	50 %	0 %	50 %	512556114
135	NC_021490	GT	3	6	40577	40582	0 %	50 %	50 %	0 %	512556116
136	NC_021490	GT	3	6	40602	40607	0 %	50 %	50 %	0 %	512556116
137	NC_021490	TG	3	6	41098	41103	0 %	50 %	50 %	0 %	512556117
138	NC_021490	AT	3	6	41281	41286	50 %	50 %	0 %	0 %	512556117
139	NC_021490	CA	3	6	41618	41623	50 %	0 %	0 %	50 %	512556117
140	NC_021490	CA	3	6	41650	41655	50 %	0 %	0 %	50 %	512556117
141	NC_021490	CA	3	6	41697	41702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021490	GT	3	6	42370	42375	0 %	50 %	50 %	0 %	512556118
143	NC_021490	CT	3	6	42796	42801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021490	AG	3	6	42860	42865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021490	CG	3	6	43008	43013	0 %	0 %	50 %	50 %	512556119
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