MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021490	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021490	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021490	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021490	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021490	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021490	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021490	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021490	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021490	GA	3	6	12511	12516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021490	GT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021490	GA	4	8	24346	24353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021490	CA	3	6	24384	24389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021490	TC	3	6	24425	24430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021490	GA	4	8	24490	24497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021490	TC	3	6	24570	24575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021490	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021490	CG	3	6	33999	34004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021490	GT	3	6	34191	34196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021490	GC	3	6	35442	35447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021490	TG	3	6	36894	36899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021490	CA	3	6	41697	41702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021490	CT	3	6	42796	42801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021490	AG	3	6	42860	42865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021490	GA	3	6	46728	46733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021490	CA	3	6	47034	47039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021490	TC	4	8	47123	47130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021490	CG	3	6	47553	47558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021490	CG	3	6	47565	47570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021490	GT	3	6	55627	55632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021490	AC	3	6	55727	55732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021490	CA	3	6	55782	55787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021490	GT	3	6	55794	55799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021490	GA	3	6	58193	58198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021490	TG	3	6	62906	62911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021490	CG	3	6	71068	71073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021490	TG	3	6	71099	71104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021490	AG	3	6	72830	72835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021490	CG	3	6	72915	72920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021490	TG	3	6	73948	73953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021490	GT	3	6	79041	79046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021490	GC	3	6	80800	80805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021490	AG	3	6	82374	82379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021490	TG	3	6	90813	90818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021490	GC	3	6	91997	92002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021490	CT	3	6	92483	92488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021490	GA	3	6	92520	92525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021490	CG	3	6	92562	92567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021490	GT	3	6	93078	93083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021490	GC	3	6	93104	93109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021490	CA	3	6	94418	94423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021490	TG	3	6	97424	97429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021490	CG	3	6	102786	102791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021490	GC	3	6	105854	105859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021490	CT	3	6	106676	106681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021490	GA	3	6	106687	106692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021490	TG	3	6	108192	108197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021490	TA	3	6	113762	113767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021490	GA	3	6	121987	121992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021490	CA	3	6	122253	122258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021490	GC	3	6	124688	124693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021490	TG	3	6	124754	124759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021490	TG	4	8	124950	124957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021490	GT	3	6	125176	125181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021490	TG	3	6	129819	129824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021490	GT	3	6	129883	129888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021490	AG	3	6	132792	132797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021490	GT	3	6	139648	139653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021490	CG	3	6	140980	140985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021490	CT	3	6	141025	141030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021490	GC	3	6	142959	142964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021490	CG	3	6	147606	147611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021490	CG	3	6	154314	154319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021490	GC	3	6	157647	157652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021490	GC	3	6	157702	157707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021490	CG	4	8	157716	157723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021490	GT	3	6	157908	157913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021490	GA	4	8	163046	163053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021490	TC	3	6	169239	169244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021490	GC	3	6	169520	169525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021490	TG	3	6	170069	170074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021490	GC	3	6	170132	170137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021490	GC	3	6	170389	170394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021490	GA	3	6	176446	176451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021490	TG	3	6	176477	176482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021490	CT	3	6	177032	177037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021490	TG	3	6	177059	177064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021490	CG	3	6	184445	184450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021490	GC	3	6	186782	186787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021490	AC	3	6	196157	196162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021490	CA	4	8	196365	196372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021490	GC	3	6	196537	196542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021490	GT	3	6	205736	205741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021490	GT	4	8	206103	206110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021490	TG	3	6	216325	216330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021490	TC	3	6	219062	219067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021490	GC	3	6	219849	219854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021490	TG	3	6	221848	221853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021490	GT	3	6	223238	223243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021490	TG	3	6	228625	228630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021490	CT	3	6	228711	228716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021490	GC	3	6	228721	228726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021490	GC	3	6	228788	228793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021490	TG	3	6	230258	230263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021490	TG	4	8	231134	231141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021490	GC	3	6	231157	231162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021490	AC	3	6	231570	231575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021490	CA	3	6	232066	232071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021490	AC	3	6	232484	232489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021490	AC	3	6	232653	232658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021490	TC	3	6	232892	232897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021490	AG	3	6	233327	233332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021490	CG	3	6	233399	233404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021490	AG	3	6	233467	233472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021490	AG	3	6	234403	234408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021490	GA	3	6	234816	234821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021490	AC	3	6	234848	234853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021490	AC	3	6	237767	237772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021490	GA	3	6	241458	241463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021490	GT	3	6	242148	242153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021490	GT	3	6	242216	242221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021490	TG	3	6	242977	242982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021490	TG	3	6	246514	246519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021490	TG	3	6	246664	246669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021490	TG	3	6	254587	254592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021490	GT	3	6	262090	262095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021490	CT	3	6	262100	262105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021490	TG	3	6	262205	262210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021490	TA	3	6	262360	262365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021490	GT	3	6	262474	262479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021490	CG	3	6	262495	262500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021490	GT	3	6	264070	264075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021490	GT	3	6	266661	266666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021490	GT	3	6	268248	268253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021490	GT	3	6	271220	271225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021490	GC	3	6	271890	271895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021490	CA	3	6	271943	271948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021490	GC	3	6	273402	273407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021490	GC	3	6	275984	275989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021490	CG	3	6	276100	276105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021490	GC	3	6	277990	277995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021490	TG	4	8	279569	279576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021490	GC	3	6	279592	279597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021490	AC	3	6	280005	280010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021490	CA	3	6	280501	280506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021490	AC	3	6	280919	280924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021490	AC	3	6	281088	281093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021490	TC	3	6	281327	281332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021490	AG	3	6	281772	281777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021490	CG	3	6	281844	281849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021490	AG	3	6	281912	281917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021490	AG	3	6	282848	282853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021490	GA	3	6	283261	283266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021490	AC	3	6	283293	283298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021490	GA	3	6	291354	291359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021490	GC	3	6	295312	295317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.