MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 4082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
2	NC_021490	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
3	NC_021490	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
4	NC_021490	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
5	NC_021490	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512556092
6	NC_021490	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512556092
7	NC_021490	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512556093
8	NC_021490	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512556093
9	NC_021490	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512556093
10	NC_021490	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512556093
11	NC_021490	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512556094
12	NC_021490	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512556094
13	NC_021490	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512556095
14	NC_021490	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512556095
15	NC_021490	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512556095
16	NC_021490	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	512556095
17	NC_021490	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	512556095
18	NC_021490	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	512556097
19	NC_021490	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	512556097
20	NC_021490	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	512556097
21	NC_021490	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	512556098
22	NC_021490	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	512556098
23	NC_021490	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
24	NC_021490	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
25	NC_021490	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	512556098
26	NC_021490	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	512556098
27	NC_021490	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	512556098
28	NC_021490	GC	3	6	12613	12618	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
29	NC_021490	GC	3	6	13060	13065	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
30	NC_021490	GT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	512556099
31	NC_021490	CA	4	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	512556099
32	NC_021490	GA	3	6	13319	13324	50 %	0 %	50 %	0 %	512556099
33	NC_021490	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
34	NC_021490	CT	4	8	13579	13586	0 %	50 %	0 %	50 %	512556099
35	NC_021490	GC	3	6	14266	14271	0 %	0 %	50 %	50 %	512556100
36	NC_021490	CG	3	6	14300	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	512556100
37	NC_021490	AT	3	6	14543	14548	50 %	50 %	0 %	0 %	512556100
38	NC_021490	TG	3	6	15953	15958	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
39	NC_021490	CG	3	6	16388	16393	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
40	NC_021490	CG	3	6	16495	16500	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
41	NC_021490	GT	4	8	16826	16833	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
42	NC_021490	CA	3	6	16835	16840	50 %	0 %	0 %	50 %	512556101
43	NC_021490	GT	3	6	17216	17221	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
44	NC_021490	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
45	NC_021490	AG	3	6	17368	17373	50 %	0 %	50 %	0 %	512556101
46	NC_021490	GT	3	6	17513	17518	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
47	NC_021490	CG	4	8	17522	17529	0 %	0 %	50 %	50 %	512556101
48	NC_021490	GT	3	6	18262	18267	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
49	NC_021490	AT	3	6	18649	18654	50 %	50 %	0 %	0 %	512556102
50	NC_021490	GT	3	6	18705	18710	0 %	50 %	50 %	0 %	512556102
51	NC_021490	GC	3	6	18755	18760	0 %	0 %	50 %	50 %	512556102
52	NC_021490	CG	3	6	19428	19433	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
53	NC_021490	CG	3	6	19910	19915	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
54	NC_021490	GT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	50 %	0 %	512556103
55	NC_021490	CG	3	6	20762	20767	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
56	NC_021490	CT	4	8	21105	21112	0 %	50 %	0 %	50 %	512556103
57	NC_021490	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
58	NC_021490	GA	3	6	21664	21669	50 %	0 %	50 %	0 %	512556103
59	NC_021490	CA	3	6	21858	21863	50 %	0 %	0 %	50 %	512556103
60	NC_021490	CG	3	6	22423	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	512556104
61	NC_021490	AC	3	6	22430	22435	50 %	0 %	0 %	50 %	512556104
62	NC_021490	GT	3	6	22593	22598	0 %	50 %	50 %	0 %	512556104
63	NC_021490	CG	3	6	23213	23218	0 %	0 %	50 %	50 %	512556104
64	NC_021490	GA	3	6	23681	23686	50 %	0 %	50 %	0 %	512556104
65	NC_021490	AG	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
66	NC_021490	TG	3	6	26027	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
67	NC_021490	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
68	NC_021490	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
69	NC_021490	CG	3	6	26740	26745	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
70	NC_021490	GA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
71	NC_021490	GT	4	8	27413	27420	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
72	NC_021490	GC	4	8	27455	27462	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
73	NC_021490	GT	4	8	27807	27814	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
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81	NC_021490	TC	3	6	30394	30399	0 %	50 %	0 %	50 %	512556109
82	NC_021490	TG	3	6	30634	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
83	NC_021490	CA	3	6	30960	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	512556109
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91	NC_021490	AG	3	6	33107	33112	50 %	0 %	50 %	0 %	512556110
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104	NC_021490	CA	4	8	36066	36073	50 %	0 %	0 %	50 %	512556112
105	NC_021490	AC	3	6	36094	36099	50 %	0 %	0 %	50 %	512556112
106	NC_021490	TG	3	6	36110	36115	0 %	50 %	50 %	0 %	512556112
107	NC_021490	CG	3	6	36637	36642	0 %	0 %	50 %	50 %	512556112
108	NC_021490	GT	3	6	36968	36973	0 %	50 %	50 %	0 %	512556113
109	NC_021490	CA	3	6	37018	37023	50 %	0 %	0 %	50 %	512556113
110	NC_021490	GC	3	6	37523	37528	0 %	0 %	50 %	50 %	512556113
111	NC_021490	TG	3	6	37977	37982	0 %	50 %	50 %	0 %	512556113
112	NC_021490	GC	3	6	38087	38092	0 %	0 %	50 %	50 %	512556113
113	NC_021490	CT	3	6	39423	39428	0 %	50 %	0 %	50 %	512556114
114	NC_021490	GT	3	6	40577	40582	0 %	50 %	50 %	0 %	512556116
115	NC_021490	GT	3	6	40602	40607	0 %	50 %	50 %	0 %	512556116
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119	NC_021490	CA	3	6	41650	41655	50 %	0 %	0 %	50 %	512556117
120	NC_021490	GT	3	6	42370	42375	0 %	50 %	50 %	0 %	512556118
121	NC_021490	CG	3	6	43008	43013	0 %	0 %	50 %	50 %	512556119
122	NC_021490	CT	3	6	43333	43338	0 %	50 %	0 %	50 %	512556119
123	NC_021490	GC	3	6	43886	43891	0 %	0 %	50 %	50 %	512556120
124	NC_021490	CG	3	6	44132	44137	0 %	0 %	50 %	50 %	512556120
125	NC_021490	CA	3	6	44432	44437	50 %	0 %	0 %	50 %	512556120
126	NC_021490	GA	3	6	45142	45147	50 %	0 %	50 %	0 %	512556121
127	NC_021490	CG	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	512556121
128	NC_021490	TC	3	6	45685	45690	0 %	50 %	0 %	50 %	512556122
129	NC_021490	CG	3	6	45780	45785	0 %	0 %	50 %	50 %	512556122
130	NC_021490	CT	3	6	49557	49562	0 %	50 %	0 %	50 %	512556125
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132	NC_021490	TC	4	8	50470	50477	0 %	50 %	0 %	50 %	512556126
133	NC_021490	TG	3	6	50518	50523	0 %	50 %	50 %	0 %	512556126
134	NC_021490	TG	3	6	50546	50551	0 %	50 %	50 %	0 %	512556126
135	NC_021490	CG	4	8	50552	50559	0 %	0 %	50 %	50 %	512556126
136	NC_021490	GA	3	6	50591	50596	50 %	0 %	50 %	0 %	512556126
137	NC_021490	CA	3	6	50782	50787	50 %	0 %	0 %	50 %	512556126
138	NC_021490	GA	3	6	51102	51107	50 %	0 %	50 %	0 %	512556126
139	NC_021490	TC	3	6	51164	51169	0 %	50 %	0 %	50 %	512556126
140	NC_021490	CG	4	8	51626	51633	0 %	0 %	50 %	50 %	512556126
141	NC_021490	GC	3	6	51678	51683	0 %	0 %	50 %	50 %	512556126
142	NC_021490	CA	3	6	51946	51951	50 %	0 %	0 %	50 %	512556126
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