MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021490	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021490	G	6	6	8819	8824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021490	T	6	6	9669	9674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021490	A	7	7	10331	10337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021490	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021490	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021490	G	10	10	12477	12486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021490	T	7	7	13932	13938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021490	G	6	6	24746	24751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021490	A	6	6	24826	24831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021490	G	6	6	24873	24878	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021490	A	6	6	25011	25016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021490	G	6	6	29058	29063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021490	C	9	9	34077	34085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_021490	T	9	9	38245	38253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021490	T	6	6	42894	42899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021490	A	6	6	55536	55541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021490	A	6	6	57926	57931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021490	T	6	6	59480	59485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021490	T	10	10	64081	64090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021490	G	7	7	71776	71782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021490	T	6	6	72339	72344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021490	G	9	9	72680	72688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021490	T	6	6	73398	73403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021490	C	6	6	73842	73847	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_021490	T	6	6	78577	78582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021490	T	6	6	78598	78603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021490	T	6	6	90650	90655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021490	T	6	6	91102	91107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021490	G	6	6	91158	91163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021490	A	6	6	93056	93061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021490	C	9	9	94722	94730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021490	A	6	6	111764	111769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021490	T	6	6	113747	113752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021490	G	6	6	121980	121985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021490	A	6	6	122150	122155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021490	A	6	6	122210	122215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021490	C	10	10	122230	122239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_021490	T	6	6	132834	132839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021490	C	10	10	136738	136747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_021490	C	9	9	140952	140960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_021490	A	6	6	142976	142981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021490	C	9	9	154140	154148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_021490	A	6	6	169687	169692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021490	T	8	8	170110	170117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021490	T	6	6	170256	170261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021490	T	7	7	182479	182485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021490	T	6	6	191180	191185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021490	G	6	6	192091	192096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021490	T	6	6	195532	195537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021490	A	6	6	196416	196421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021490	G	8	8	208585	208592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021490	A	6	6	219104	219109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021490	T	6	6	230207	230212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021490	A	6	6	233904	233909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021490	T	6	6	244292	244297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021490	T	8	8	246486	246493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021490	G	6	6	246730	246735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021490	T	7	7	254617	254623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021490	T	8	8	259025	259032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021490	G	7	7	275754	275760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021490	G	6	6	275765	275770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021490	T	6	6	275815	275820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021490	T	7	7	276845	276851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021490	C	6	6	278027	278032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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68	NC_021490	A	7	7	287222	287228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021490	T	6	6	299099	299104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021490	T	6	6	304929	304934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021490	T	6	6	305816	305821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021490	G	6	6	312276	312281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021490	T	6	6	323877	323882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021490	T	6	6	326719	326724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021490	T	7	7	326734	326740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021490	G	7	7	326757	326763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021490	T	6	6	328002	328007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021490	G	11	11	329124	329134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021490	C	9	9	333523	333531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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81	NC_021490	G	6	6	335966	335971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021490	T	6	6	341024	341029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_021490	G	13	13	373208	373220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021490	G	9	9	373946	373954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021490	T	6	6	383761	383766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_021490	T	7	7	402467	402473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_021490	C	12	12	409105	409116	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_021490	T	6	6	422917	422922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021490	T	6	6	422930	422935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021490	T	8	8	422959	422966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021490	T	6	6	448923	448928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_021490	G	6	6	491330	491335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_021490	G	6	6	492454	492459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021490	G	6	6	492516	492521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_021490	A	7	7	550499	550505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_021490	T	6	6	562898	562903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021490	T	6	6	563295	563300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021490	A	6	6	568943	568948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021490	T	6	6	569683	569688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021490	A	6	6	576762	576767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021490	A	7	7	580589	580595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021490	T	6	6	583189	583194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021490	A	7	7	600449	600455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021490	T	7	7	635358	635364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021490	T	6	6	642598	642603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021490	A	6	6	644173	644178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021490	T	8	8	644211	644218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_021490	C	8	8	674515	674522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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148	NC_021490	A	7	7	832143	832149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021490	A	6	6	862274	862279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021490	A	8	8	864796	864803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021490	C	6	6	872423	872428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
154	NC_021490	T	6	6	882092	882097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.