MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021487	ATTCTC	2	12	73117	73128	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021487	TGCGCA	2	12	86982	86993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021487	CAAGGG	2	12	100802	100813	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021487	GCGGAG	2	12	125707	125718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021487	GGACTG	2	12	156073	156084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021487	GGCATG	2	12	303647	303658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021487	TTATTG	2	12	309852	309863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021487	ACTTCT	2	12	325571	325582	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021487	GGACTA	2	12	344033	344044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021487	GGGGAA	2	12	416110	416121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021487	GGTAGC	2	12	421903	421914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021487	TTCTAA	2	12	479751	479762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021487	GATAGG	2	12	502962	502973	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021487	TATTCT	2	12	539769	539780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021487	ACCTCT	2	12	553416	553427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021487	CTTTGC	2	12	565307	565318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021487	GCTAGA	2	12	566725	566736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021487	GAGATA	2	12	580796	580807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021487	GCCTTC	2	12	590241	590252	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021487	GCTGCA	2	12	613307	613318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021487	TGTTCT	2	12	613798	613809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021487	GAACGC	2	12	638512	638523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021487	GTAGTG	2	12	670991	671002	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021487	GACTAT	2	12	739464	739475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021487	GGTATT	2	12	803126	803137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021487	AGGTAC	2	12	902200	902211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021487	TTTTTA	2	12	908444	908455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021487	GCGAGG	2	12	1001771	1001782	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021487	CTTTGC	2	12	1075839	1075850	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021487	CCGATA	2	12	1116480	1116491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021487	GGCGCA	2	12	1123250	1123261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021487	CCCTCT	2	12	1123859	1123870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021487	CTTTGG	2	12	1296319	1296330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021487	GCATTT	2	12	1298847	1298858	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021487	GCCAAA	2	12	1311236	1311247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021487	GAATGC	2	12	1311923	1311934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021487	ATATAA	2	12	1441350	1441361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021487	AAGGAA	2	12	1466110	1466121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021487	AAGTTA	2	12	1487861	1487872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021487	TTTCCT	2	12	1535176	1535187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021487	GCCATC	2	12	1568126	1568137	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021487	GCCATC	2	12	1568597	1568608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021487	CCATCG	2	12	1568747	1568758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021487	TCCATT	2	12	1641273	1641284	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021487	CTTTCT	2	12	1667891	1667902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021487	ATCTCT	2	12	1680257	1680268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021487	CCAGCA	2	12	1689560	1689571	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021487	GGCACG	2	12	1697245	1697256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021487	CCTTCG	2	12	1727955	1727966	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021487	GAAGGC	2	12	1734098	1734109	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021487	GGAGGG	2	12	1788457	1788468	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021487	ACCAAA	2	12	1819208	1819219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021487	AAAGGA	2	12	1846457	1846468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021487	GGAGGG	2	12	1860417	1860428	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021487	AAGGCA	2	12	1875962	1875973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021487	TCTCCT	2	12	1881944	1881955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021487	ATCTGG	2	12	1889469	1889480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021487	GAGAAA	2	12	2017703	2017714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021487	CTTGCA	2	12	2075298	2075309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021487	TCTGGT	2	12	2166244	2166255	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021487	TGAAGT	2	12	2290011	2290022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021487	TCCTTT	2	12	2348147	2348158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021487	ACCCAA	2	12	2390581	2390592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021487	TAAAAA	2	12	2514766	2514777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021487	GAGTCG	2	12	2521238	2521249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021487	TTCGGC	2	12	2567997	2568008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021487	AATGAG	2	12	2581691	2581702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021487	GAAGGA	2	12	2593363	2593374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021487	TGCTTG	2	12	2710538	2710549	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021487	CTGAAA	2	12	2713505	2713516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021487	GTCAGG	2	12	2776042	2776053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021487	GCTTTC	2	12	2781373	2781384	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021487	AAAAAG	2	12	2798593	2798604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021487	CGCCTC	2	12	2807313	2807324	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021487	GCCGTT	2	12	2814410	2814421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021487	TCGAAG	2	12	2845065	2845076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021487	GGACTG	2	12	2845494	2845505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021487	AAGCGC	2	12	2846806	2846817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021487	AAAGGG	2	12	2847059	2847070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021487	ATAGGC	2	12	2857487	2857498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021487	AAAAGA	2	12	2922835	2922846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021487	TAAAAA	2	12	2958895	2958906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021487	ATTTGG	2	12	2959653	2959664	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021487	GAATGG	2	12	3023359	3023370	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021487	GATATA	2	12	3075388	3075399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021487	GAAAAG	2	12	3141138	3141149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021487	TGGGTT	2	12	3187727	3187738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021487	GCATTT	2	12	3188701	3188712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021487	AGGGTG	2	12	3264457	3264468	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021487	CTCTTC	2	12	3267217	3267228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021487	ACCAAG	2	12	3271739	3271750	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021487	AAAGCG	2	12	3290910	3290921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021487	GCTTTG	2	12	3349797	3349808	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021487	TTTGCC	2	12	3423212	3423223	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.