MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 4391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021487	TGG	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021487	AGA	2	6	136	141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021487	TGA	2	6	142	147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021487	GCG	2	6	165	170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021487	TAG	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021487	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021487	GCA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021487	GAC	3	9	293	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021487	GCA	2	6	331	336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021487	AAG	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021487	AAC	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021487	GTA	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021487	TCC	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021487	CGC	2	6	3715	3720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021487	AGT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021487	CGA	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021487	GAA	2	6	5061	5066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021487	GAG	2	6	9281	9286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021487	TCT	2	6	10312	10317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021487	GGC	2	6	10320	10325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021487	TTC	2	6	10327	10332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021487	TGA	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021487	CCT	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021487	CAC	2	6	12490	12495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021487	CAC	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021487	GAA	2	6	12664	12669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021487	GGC	2	6	12721	12726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021487	CGC	2	6	12783	12788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021487	CCA	2	6	12894	12899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021487	CAC	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021487	AGG	2	6	13013	13018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021487	TCT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021487	GGC	2	6	13161	13166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021487	TTC	2	6	13168	13173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021487	GCG	2	6	13275	13280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021487	ACG	2	6	13358	13363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021487	GCC	2	6	13430	13435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021487	ACT	2	6	21855	21860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021487	AGA	3	9	22022	22030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021487	CTT	2	6	22133	22138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021487	AAG	2	6	22337	22342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021487	ATT	2	6	22474	22479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021487	TGA	2	6	22495	22500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021487	AGA	2	6	22722	22727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021487	TCC	2	6	23019	23024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021487	GCC	2	6	23178	23183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021487	AGG	2	6	23188	23193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021487	CGG	2	6	23231	23236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021487	TGG	2	6	23308	23313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021487	CTG	2	6	23352	23357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021487	TTG	2	6	23358	23363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021487	TTC	2	6	23391	23396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021487	GCT	2	6	25662	25667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021487	TTA	2	6	25687	25692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021487	GAG	2	6	25723	25728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021487	TTG	2	6	25838	25843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021487	ACC	2	6	25978	25983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021487	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021487	TAT	2	6	26194	26199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021487	TGT	2	6	26201	26206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021487	CGA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021487	CGC	2	6	26265	26270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021487	TTG	2	6	28213	28218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021487	CGA	2	6	28301	28306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021487	TCT	2	6	30693	30698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021487	GGA	2	6	30710	30715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021487	CAA	2	6	32218	32223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021487	GTA	2	6	33460	33465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021487	ACA	2	6	33491	33496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021487	AGA	2	6	34617	34622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021487	AGG	2	6	34760	34765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021487	TCC	2	6	39063	39068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021487	CCG	2	6	39164	39169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021487	TGT	2	6	44217	44222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021487	AGG	2	6	44255	44260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021487	GAG	2	6	45161	45166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021487	GTA	2	6	45526	45531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021487	AGA	2	6	45532	45537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021487	TAT	2	6	45550	45555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021487	AGG	2	6	45588	45593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021487	TAG	2	6	47233	47238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021487	GAC	2	6	52979	52984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021487	CTA	2	6	53017	53022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021487	CGC	2	6	53461	53466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021487	TCC	2	6	53500	53505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021487	CAA	2	6	53545	53550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021487	TTG	2	6	53845	53850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021487	CTG	2	6	53908	53913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021487	GCG	2	6	53952	53957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021487	TAC	2	6	54107	54112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021487	CAG	2	6	54200	54205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021487	GTG	2	6	54312	54317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021487	AAG	2	6	54574	54579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021487	GGC	2	6	58911	58916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021487	GAG	2	6	65219	65224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021487	CCT	2	6	65225	65230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021487	GAG	2	6	65389	65394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021487	CTT	2	6	67711	67716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021487	GTT	2	6	67738	67743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021487	TCC	2	6	71121	71126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021487	AGC	2	6	71194	71199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021487	GTC	2	6	71249	71254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021487	CGG	2	6	71270	71275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021487	TTC	2	6	71308	71313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021487	GGA	2	6	71350	71355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021487	CCT	2	6	71440	71445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021487	ATC	2	6	71569	71574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021487	TTG	2	6	71578	71583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021487	TGA	2	6	73109	73114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021487	GGA	2	6	73135	73140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021487	CTC	2	6	73175	73180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021487	TCG	2	6	73241	73246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021487	TCG	2	6	73255	73260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021487	GTC	2	6	75524	75529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021487	ATA	2	6	75591	75596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021487	GAT	3	9	75607	75615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021487	TTG	2	6	75682	75687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021487	GTG	2	6	75696	75701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021487	CAA	2	6	75734	75739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021487	GCT	2	6	75774	75779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021487	AGG	2	6	75848	75853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021487	GGA	2	6	76600	76605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021487	GGA	2	6	76615	76620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021487	AGG	2	6	76656	76661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021487	AGG	2	6	77290	77295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021487	TGT	2	6	77639	77644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021487	GAA	2	6	83510	83515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021487	GCT	2	6	84510	84515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021487	TAA	3	9	86581	86589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021487	TGG	2	6	86614	86619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021487	TAG	2	6	86640	86645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021487	GCT	2	6	86703	86708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021487	CCT	2	6	86719	86724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021487	TGA	2	6	86851	86856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021487	TTG	2	6	86866	86871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021487	ATC	2	6	86898	86903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021487	ATT	2	6	86908	86913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021487	CGA	2	6	86943	86948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021487	GGA	2	6	87073	87078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021487	TGA	2	6	96629	96634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021487	TGT	2	6	97224	97229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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