MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 plasmid pA506

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021361	GATCC	2	10	1003	1012	20 %	20 %	20 %	40 %	510414865
2	NC_021361	CGGCA	2	10	3075	3084	20 %	0 %	40 %	40 %	510414866
3	NC_021361	CTACC	3	15	3813	3827	20 %	20 %	0 %	60 %	510414866
4	NC_021361	CGTGA	2	10	4930	4939	20 %	20 %	40 %	20 %	510414857
5	NC_021361	ACAAG	2	10	6769	6778	60 %	0 %	20 %	20 %	510414870
6	NC_021361	GGCCA	2	10	11310	11319	20 %	0 %	40 %	40 %	510414894
7	NC_021361	GCTTT	2	10	12520	12529	0 %	60 %	20 %	20 %	510414883
8	NC_021361	CAGGT	2	10	14922	14931	20 %	20 %	40 %	20 %	510414864
9	NC_021361	TGCGC	2	10	16398	16407	0 %	20 %	40 %	40 %	510414875
10	NC_021361	AGCTC	2	10	19327	19336	20 %	20 %	20 %	40 %	510414854
11	NC_021361	GCATT	2	10	20587	20596	20 %	40 %	20 %	20 %	510414892
12	NC_021361	CCAAG	2	10	20974	20983	40 %	0 %	20 %	40 %	510414834
13	NC_021361	GGAAC	2	10	22542	22551	40 %	0 %	40 %	20 %	510414836
14	NC_021361	GCATT	2	10	23991	24000	20 %	40 %	20 %	20 %	510414836
15	NC_021361	TGTGG	2	10	25940	25949	0 %	40 %	60 %	0 %	510414847
16	NC_021361	ATTGG	2	10	27314	27323	20 %	40 %	40 %	0 %	510414839
17	NC_021361	GACAA	2	10	27486	27495	60 %	0 %	20 %	20 %	510414839
18	NC_021361	TTCGC	2	10	27646	27655	0 %	40 %	20 %	40 %	510414881
19	NC_021361	TTGGA	2	10	29464	29473	20 %	40 %	40 %	0 %	510414873
20	NC_021361	ACTTC	2	10	30240	30249	20 %	40 %	0 %	40 %	510414873
21	NC_021361	GATGG	2	10	31765	31774	20 %	20 %	60 %	0 %	510414830
22	NC_021361	ATTCA	2	10	33438	33447	40 %	40 %	0 %	20 %	510414886
23	NC_021361	AACGA	2	10	34744	34753	60 %	0 %	20 %	20 %	510414876
24	NC_021361	AGCGC	2	10	37855	37864	20 %	0 %	40 %	40 %	510414840
25	NC_021361	ATTTG	2	10	38901	38910	20 %	60 %	20 %	0 %	510414878
26	NC_021361	CCGAG	2	10	39550	39559	20 %	0 %	40 %	40 %	510414843
27	NC_021361	TGAAA	2	10	41595	41604	60 %	20 %	20 %	0 %	510414831
28	NC_021361	TTGCG	2	10	43435	43444	0 %	40 %	40 %	20 %	510414845
29	NC_021361	CGAGC	2	10	44088	44097	20 %	0 %	40 %	40 %	510414845
30	NC_021361	AAATG	2	10	46273	46282	60 %	20 %	20 %	0 %	510414863
31	NC_021361	GCGCT	2	10	46505	46514	0 %	20 %	40 %	40 %	510414863
32	NC_021361	CACCG	2	10	48908	48917	20 %	0 %	20 %	60 %	510414848
33	NC_021361	TGTGG	2	10	50474	50483	0 %	40 %	60 %	0 %	510414832
34	NC_021361	CAGTA	2	10	51327	51336	40 %	20 %	20 %	20 %	510414842

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.