MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter sp. AbM4

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021355	CTTTAT	2	12	38281	38292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021355	AATTTT	2	12	53960	53971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021355	TTTAAT	2	12	56004	56015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021355	TTTTTA	2	12	61511	61522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021355	TAGTTT	2	12	61873	61884	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021355	AAATTG	2	12	61907	61918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021355	TAAAAA	2	12	64261	64272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021355	TAAGAT	2	12	64275	64286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021355	ATCTTA	2	12	67001	67012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021355	TAGTAT	2	12	73256	73267	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021355	TCTTTA	2	12	75557	75568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021355	TCTTTT	2	12	81977	81988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021355	TTAAAT	2	12	85509	85520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021355	ATATTA	2	12	103543	103554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021355	TTGTTT	2	12	107147	107158	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021355	GGAAAT	2	12	107528	107539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021355	CTATTT	2	12	117662	117673	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021355	CCATTT	2	12	123452	123463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021355	TTTTAT	2	12	130978	130989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021355	ATTTTA	2	12	134010	134021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021355	ATTTTA	2	12	135981	135992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021355	ATTTTA	2	12	136644	136655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021355	CTTTAA	2	12	136788	136799	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021355	TTTCAA	2	12	138932	138943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021355	CAATAA	2	12	140418	140429	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021355	ACCACT	2	12	141083	141094	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021355	TTCAAT	2	12	141173	141184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021355	ATTTTA	2	12	142455	142466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021355	TAAATT	2	12	142625	142636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021355	ATTTTA	2	12	143649	143660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021355	ATTTTA	2	12	145172	145183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021355	ATCTGT	2	12	145977	145988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021355	ATTTAA	2	12	154924	154935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021355	AGTTTA	2	12	155589	155600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021355	AATTTA	2	12	155618	155629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021355	TTAAAA	2	12	183946	183957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021355	TAAAAA	2	12	184088	184099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021355	TTGATT	2	12	190766	190777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021355	GGAATT	2	12	194830	194841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021355	AATATA	2	12	210704	210715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021355	TTTTAA	2	12	213877	213888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021355	ATTAAG	2	12	213898	213909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021355	TAATGT	2	12	224258	224269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021355	AGAAAA	2	12	231694	231705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021355	ATTTTA	2	12	232894	232905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021355	TCTTTT	2	12	240027	240038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021355	TATTTT	2	12	240072	240083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021355	TTCTTT	2	12	243046	243057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021355	CTTTTT	2	12	245950	245961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021355	TTTCAT	2	12	246047	246058	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021355	ATTTAT	2	12	246375	246386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021355	TAAATT	2	12	248229	248240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021355	TAGTTT	2	12	251864	251875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021355	TATTCT	2	12	275382	275393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021355	TAATAT	2	12	276600	276611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021355	GTTTAA	2	12	276688	276699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021355	AAATTT	2	12	277116	277127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021355	AGCTTA	2	12	281414	281425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021355	ATTTTT	2	12	281438	281449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021355	TATTTT	2	12	284414	284425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021355	TTAAAT	2	12	284701	284712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021355	TTTAAA	2	12	286028	286039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021355	TAATTT	2	12	289400	289411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021355	ATATTT	2	12	305137	305148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021355	ATTTTT	2	12	306379	306390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021355	AATAAA	2	12	308768	308779	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021355	TTGATT	2	12	326236	326247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021355	TTTATA	2	12	332373	332384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021355	TATTAC	2	12	343121	343132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021355	ATTTGT	2	12	343148	343159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021355	CAAAAA	2	12	343242	343253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021355	TAATTT	2	12	345143	345154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021355	TATTTT	2	12	357930	357941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021355	TTTTAT	2	12	361012	361023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021355	TTATAT	2	12	361240	361251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021355	TTAAAA	2	12	366216	366227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021355	TTAAAA	2	12	368766	368777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021355	CTTTTT	2	12	402059	402070	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021355	ATATTT	2	12	403951	403962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021355	ATTAAA	2	12	407878	407889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021355	ATTGAT	2	12	413326	413337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021355	TATTTA	2	12	422764	422775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021355	TTTTAT	2	12	447843	447854	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021355	TATTTT	2	12	451140	451151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021355	GTTATT	2	12	451216	451227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021355	TTAAAA	2	12	458963	458974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021355	ATTTTT	2	12	463544	463555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021355	TAACAA	2	12	465441	465452	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021355	TTTTAA	2	12	465869	465880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021355	TTATTG	2	12	468391	468402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021355	ATAAAT	2	12	471678	471689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021355	TTTTAT	2	12	486823	486834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021355	TTTATT	2	12	489858	489869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021355	AAATTA	2	12	492448	492459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021355	TCTATT	2	12	493565	493576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021355	TCTATT	2	12	493620	493631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021355	GGAATT	2	12	494879	494890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021355	GGAATT	2	12	494924	494935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021355	AATTAA	2	12	498498	498509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021355	ATTTTT	2	12	499379	499390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021355	TAATTT	2	12	503514	503525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021355	TTTTGT	2	12	508224	508235	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021355	TTTAAA	2	12	513336	513347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021355	TAATCT	2	12	513491	513502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021355	ATATTA	2	12	513689	513700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021355	GATATT	2	12	517061	517072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021355	ATTACT	2	12	533405	533416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021355	TAAAAA	2	12	533986	533997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021355	AATATA	2	12	539037	539048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021355	TTTTTA	2	12	540758	540769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021355	ATTTTA	2	12	543088	543099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021355	AAATAA	2	12	563510	563521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021355	TTATTT	2	12	563553	563564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021355	ATTCTA	2	12	565514	565525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021355	TCTAAT	2	12	566424	566435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021355	ATTTTT	2	12	567815	567826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021355	AAAAAT	2	12	567999	568010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021355	ATAATT	2	12	570590	570601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021355	TTTTTA	2	12	580276	580287	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021355	ATTTTT	2	12	582499	582510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021355	TAAATT	2	12	583710	583721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021355	TAAAAA	2	12	583827	583838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021355	AATTAA	2	12	584025	584036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021355	ATAATT	2	12	588862	588873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021355	TTTAAA	2	12	589112	589123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021355	TTGATT	2	12	589407	589418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021355	AATTAA	2	12	593945	593956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021355	TTTAAT	2	12	596970	596981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021355	GATTTT	2	12	597101	597112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021355	TTAGTT	2	12	597495	597506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021355	TGATTT	2	12	601164	601175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021355	AATTTT	2	12	613146	613157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021355	TTCAAT	2	12	618519	618530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021355	TAAAAT	2	12	618544	618555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021355	AAATTT	2	12	618854	618865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021355	TATTTT	2	12	626959	626970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021355	TTAAAA	2	12	627156	627167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_021355	AAATTA	2	12	1238513	1238524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_021355	TAAAAA	2	12	1970085	1970096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_021355	AAATAA	2	12	1972111	1972122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_021355	ATTAAA	2	12	1974082	1974093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_021355	TAAAAA	2	12	1982624	1982635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_021355	ATAATT	2	12	1983284	1983295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_021355	TAAATA	2	12	1988363	1988374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_021355	ATTAAA	2	12	1989795	1989806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_021355	AATAAG	2	12	1995150	1995161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_021355	ATTTTA	2	12	1998082	1998093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.