MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae SY1027

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021354	GGAAAT	2	12	23955	23966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021354	TCTTTT	2	12	36919	36930	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021354	ATTTAA	2	12	102020	102031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021354	TATCAA	2	12	172432	172443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021354	ATTGTG	2	12	187930	187941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021354	GTTTTT	2	12	219084	219095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021354	TTTAAG	2	12	231983	231994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021354	ATTTAA	2	12	244256	244267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021354	TTTCAA	2	12	255886	255897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021354	TTATGT	2	12	256636	256647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021354	TCTAAA	2	12	261843	261854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021354	AATGAA	2	12	298302	298313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021354	AAAAGA	2	12	326698	326709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021354	AATGTA	2	12	353532	353543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021354	GATTAA	2	12	358505	358516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021354	TTTAAA	2	12	363695	363706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021354	ACTTTA	2	12	383208	383219	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021354	ACCAAA	2	12	386897	386908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021354	AGTAAA	2	12	394494	394505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021354	TTCAGG	2	12	398885	398896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021354	GTAGGT	2	12	416095	416106	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021354	TTAATA	2	12	480416	480427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021354	TTTATT	2	12	514704	514715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021354	TTCTTT	2	12	547425	547436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021354	ACTTTA	2	12	568118	568129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021354	TTGTAT	2	12	573724	573735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021354	ATCGTA	2	12	579391	579402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021354	ATAAAA	2	12	611262	611273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021354	TCTATT	2	12	612751	612762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021354	AAATAA	2	12	613370	613381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021354	TCGCTT	2	12	625811	625822	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021354	TCTTTT	2	12	626669	626680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021354	TTCTTT	2	12	648418	648429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021354	GGCCTT	2	12	651470	651481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021354	TAAAAA	2	12	695906	695917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021354	TTGAAG	2	12	705363	705374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021354	AAACAC	2	12	765244	765255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021354	GTTTTT	2	12	822932	822943	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021354	AAAAAG	2	12	850214	850225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021354	ATAAAG	2	12	857505	857516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021354	ATACTA	2	12	879591	879602	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021354	TTTGTT	2	12	911482	911493	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021354	ACAAAT	2	12	918739	918750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021354	CTTTTT	2	12	1014631	1014642	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021354	ATCTTA	2	12	1019392	1019403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021354	ATCGTT	2	12	1038601	1038612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021354	TAAACT	2	12	1057493	1057504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021354	TTTATT	2	12	1065431	1065442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021354	TTCATC	2	12	1068114	1068125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021354	TTTGAG	2	12	1090177	1090188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021354	TTTAAT	2	12	1099822	1099833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021354	TAAAAA	2	12	1104795	1104806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021354	TTCTAA	2	12	1115185	1115196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021354	TCATTT	2	12	1117131	1117142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021354	ATCACA	2	12	1134915	1134926	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021354	TTTTAT	2	12	1154473	1154484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021354	TATTTT	2	12	1216873	1216884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021354	TTGATG	2	12	1218897	1218908	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021354	AAGATT	2	12	1223631	1223642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021354	CTATCT	2	12	1238340	1238351	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021354	TTGATA	2	12	1246112	1246123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021354	CATTAA	2	12	1248085	1248096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021354	AAAGGA	2	12	1327981	1327992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021354	ATCAGC	2	12	1366668	1366679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021354	ATTCCC	2	12	1366801	1366812	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021354	TAAGCG	2	12	1367108	1367119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021354	AACTAA	2	12	1377618	1377629	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021354	ATCATT	2	12	1384213	1384224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021354	AAGCGA	2	12	1389401	1389412	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021354	TTCGAA	2	12	1403850	1403861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021354	ATCTTT	2	12	1438024	1438035	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021354	ATAAAA	2	12	1455881	1455892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021354	TTTTAA	2	12	1455931	1455942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021354	AAGCAG	2	12	1473766	1473777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021354	GGTTGC	2	12	1475303	1475314	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021354	TGCTTT	2	12	1529765	1529776	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021354	TTGCGA	2	12	1552779	1552790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021354	TTTTAT	2	12	1561552	1561563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021354	TATGAT	2	12	1568043	1568054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021354	CACAAA	2	12	1640278	1640289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021354	AAGAAA	2	12	1652670	1652681	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021354	ATAAAT	2	12	1662736	1662747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021354	ATTGAA	2	12	1680768	1680779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021354	CGTAAA	2	12	1691423	1691434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021354	ATGTTG	2	12	1704217	1704228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021354	AATGCG	2	12	1742840	1742851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021354	AATTCT	2	12	1742876	1742887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021354	AAGCGA	2	12	1750448	1750459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.