MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanomassiliicoccus sp. Mx1-Issoire

Total Repeats: 575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021353	ACGGGA	2	12	1706549	1706560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	511060484
502	NC_021353	TTCTCA	2	12	1706747	1706758	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	511060484
503	NC_021353	CAACTA	2	12	1710977	1710988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	511060489
504	NC_021353	TATCAT	2	12	1711725	1711736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	511060490
505	NC_021353	TACATC	2	12	1711873	1711884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060490
506	NC_021353	CTTGTC	2	12	1720698	1720709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	511060497
507	NC_021353	GTTCCG	2	12	1722852	1722863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511060500
508	NC_021353	CCGCCA	2	12	1723116	1723127	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	511060500
509	NC_021353	GCCTTC	2	12	1724065	1724076	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	511060501
510	NC_021353	TCCGGT	2	12	1724149	1724160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511060501
511	NC_021353	GGAATT	2	12	1726450	1726461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511060503
512	NC_021353	TGGAGA	2	12	1738225	1738236	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	511060519
513	NC_021353	TTCCTT	2	12	1740802	1740813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511060521
514	NC_021353	AGGAAT	2	12	1746657	1746668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	511060526
515	NC_021353	ATCCTG	2	12	1749957	1749968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511060528
516	NC_021353	GCTGCA	2	12	1751195	1751206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	511060529
517	NC_021353	TTACAT	2	12	1757256	1757267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	511060535
518	NC_021353	TACCAA	2	12	1764581	1764592	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	511060542
519	NC_021353	AATGAA	2	12	1764872	1764883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	511060543
520	NC_021353	CTTTTT	2	12	1771637	1771648	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	511060551
521	NC_021353	CATTCA	2	12	1771663	1771674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060551
522	NC_021353	GTATCG	2	12	1778066	1778077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	511060559
523	NC_021353	CCTATG	2	12	1778251	1778262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511060559
524	NC_021353	CGATTT	2	12	1779426	1779437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	511060560
525	NC_021353	TACTTT	2	12	1782040	1782051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	511060562
526	NC_021353	CTTCGC	2	12	1782117	1782128	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	511060562
527	NC_021353	CCCATG	2	12	1782651	1782662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	511060563
528	NC_021353	TCCATA	2	12	1787899	1787910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060568
529	NC_021353	CGCTGC	2	12	1789766	1789777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	511060570
530	NC_021353	TACAGC	2	12	1793794	1793805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	511060574
531	NC_021353	GCAATG	2	12	1795475	1795486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511060575
532	NC_021353	ATAAAA	2	12	1804754	1804765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	511060588
533	NC_021353	GCTGCA	2	12	1805018	1805029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	511060589
534	NC_021353	CAATTC	2	12	1807468	1807479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060592
535	NC_021353	ATATCA	2	12	1811629	1811640	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	511060595
536	NC_021353	AAATGT	2	12	1813621	1813632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	511060599
537	NC_021353	TACCGG	2	12	1813853	1813864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	511060599
538	NC_021353	TCGGTC	2	12	1817960	1817971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511060602
539	NC_021353	TGCTTT	2	12	1819541	1819552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	511060605
540	NC_021353	AGAGTG	2	12	1819650	1819661	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	511060605
541	NC_021353	TGTGAC	2	12	1821308	1821319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	511060606
542	NC_021353	ATCAGC	2	12	1826271	1826282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	511060612
543	NC_021353	GAATTC	2	12	1829842	1829853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	511060614
544	NC_021353	ATGTTC	2	12	1834789	1834800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	511060620
545	NC_021353	CATTCC	2	12	1836831	1836842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	511060622
546	NC_021353	TTCAAC	2	12	1836903	1836914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060622
547	NC_021353	TGCCAT	2	12	1837034	1837045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511060623
548	NC_021353	AAGTGA	2	12	1837245	1837256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	511060623
549	NC_021353	CTGGGA	2	12	1839979	1839990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	511060627
550	NC_021353	TGTGTA	2	12	1844281	1844292	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	511060629
551	NC_021353	CATCGG	2	12	1845689	1845700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	511060630
552	NC_021353	ACCGAC	2	12	1845750	1845761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	511060630
553	NC_021353	ATCGGG	2	12	1846668	1846679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	511060630
554	NC_021353	TTGAAG	2	12	1853899	1853910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511060638
555	NC_021353	GACTGA	2	12	1854476	1854487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511060638
556	NC_021353	AATGCA	2	12	1855254	1855265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	511060638
557	NC_021353	ACGGAG	2	12	1855951	1855962	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	511060638
558	NC_021353	GAAGCT	2	12	1863475	1863486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511060645
559	NC_021353	ACCGAG	2	12	1863511	1863522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511060645
560	NC_021353	TTTCAA	2	12	1864851	1864862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	511060647
561	NC_021353	TGGCAT	2	12	1880094	1880105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	511060665
562	NC_021353	CTGTAT	2	12	1881583	1881594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	511060666
563	NC_021353	GTCTGC	2	12	1886413	1886424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511060673
564	NC_021353	CCTGGC	2	12	1886602	1886613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	511060673
565	NC_021353	ATAGGC	2	12	1891219	1891230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511060675
566	NC_021353	GTCAAA	2	12	1892016	1892027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	511060676
567	NC_021353	ATCGTC	2	12	1892772	1892783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511060676
568	NC_021353	TGTTGC	2	12	1908684	1908695	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	511060692
569	NC_021353	GATGCA	2	12	1910897	1910908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511060695
570	NC_021353	CAGGGT	2	12	1912552	1912563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	511060695
571	NC_021353	AAAGAA	2	12	1918040	1918051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	511060697
572	NC_021353	TACTTC	2	12	1921006	1921017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	511060701
573	NC_021353	TCACTT	2	12	1923884	1923895	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	511060702
574	NC_021353	TCCTCT	2	12	1924750	1924761	0 %	50 %	0 %	50 %	511060702
575	NC_021353	TCCTAA	2	12	1929639	1929650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511060707

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.