MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum SCgG2

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021352	GAAATT	2	12	2108	2119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021352	GGTCTT	2	12	45160	45171	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021352	CCTTCA	2	12	57251	57262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021352	TCGCTT	2	12	70192	70203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021352	AAGTCC	2	12	95050	95061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021352	TTGTGG	2	12	100565	100576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021352	CTGGGG	2	12	105354	105365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021352	GTATAC	2	12	126166	126177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021352	CAGACC	2	12	181206	181217	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021352	GAATCT	2	12	190000	190011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021352	TGTACC	2	12	207998	208009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021352	AAATAC	2	12	221026	221037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021352	CCTCAC	2	12	226682	226693	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021352	GGGGTG	2	12	267487	267498	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021352	AAATTA	2	12	356989	357000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021352	CTGATG	2	12	431404	431415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021352	AAAGGA	2	12	437665	437676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021352	AAATTC	2	12	461167	461178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021352	GATTAG	2	12	470803	470814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021352	GCTCGG	2	12	473453	473464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021352	ATCACC	2	12	480416	480427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021352	GGCGAC	2	12	570622	570633	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021352	TTCAGG	2	12	576296	576307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021352	TAGATA	2	12	598769	598780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021352	TTTTAC	2	12	601346	601357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021352	TGGGTT	2	12	638512	638523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021352	ACTTCA	2	12	662421	662432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021352	GTAAAC	2	12	684828	684839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021352	GTTTCG	2	12	733592	733603	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021352	ACACAG	2	12	762330	762341	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021352	CTGGTT	2	12	837983	837994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021352	GAAAAA	2	12	866887	866898	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021352	AGTCAA	2	12	961881	961892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021352	ATTTTC	2	12	965968	965979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021352	CGAACA	2	12	978497	978508	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021352	CTTACG	2	12	982739	982750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021352	CTAGAC	2	12	983372	983383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021352	TTCCCG	2	12	1021595	1021606	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021352	CAAAAC	2	12	1040482	1040493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021352	TTGTGG	2	12	1062171	1062182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021352	TTCACA	2	12	1082963	1082974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021352	TAACAA	2	12	1086917	1086928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021352	CCGGGC	2	12	1174928	1174939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021352	TTAAGT	2	12	1274845	1274856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021352	TCCCAC	2	12	1343540	1343551	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021352	TTTCTT	2	12	1383977	1383988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021352	AAGGAT	2	12	1401446	1401457	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021352	CGCTGG	2	12	1448585	1448596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021352	AACTCA	2	12	1472963	1472974	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021352	CCGGAA	2	12	1506246	1506257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021352	CGGTTT	2	12	1554333	1554344	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021352	GGGGAT	2	12	1617482	1617493	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021352	TTTTCA	2	12	1617562	1617573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021352	TTGTGG	2	12	1675637	1675648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021352	GATATT	2	12	1755782	1755793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021352	GTCATG	2	12	1756384	1756395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021352	TTCAAT	2	12	1756424	1756435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021352	CTTTTA	2	12	1804351	1804362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021352	AACGAA	2	12	1855289	1855300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021352	GTGCTT	2	12	1869540	1869551	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021352	AGTGTT	2	12	1910936	1910947	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021352	ATCCTC	2	12	1934689	1934700	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021352	AGCCTT	2	12	1976232	1976243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021352	GTTATA	2	12	2005409	2005420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021352	CTTTTG	2	12	2022334	2022345	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021352	TTTTTA	2	12	2063024	2063035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021352	AAACCA	2	12	2065169	2065180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021352	CGTTTC	2	12	2126191	2126202	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021352	CCAGTA	2	12	2165068	2165079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021352	GCCGAT	2	12	2237138	2237149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021352	CCGGAT	2	12	2250166	2250177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021352	TCAGCG	2	12	2269510	2269521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021352	GGATAC	2	12	2285265	2285276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021352	TTAGCT	2	12	2310053	2310064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021352	TTTCGC	2	12	2319757	2319768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021352	CTAAAG	2	12	2365176	2365187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021352	AACTTG	2	12	2384170	2384181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021352	CCGGGC	2	12	2389834	2389845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021352	GCCTAA	2	12	2391788	2391799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021352	ATCACC	2	12	2454402	2454413	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021352	ACAGTG	2	12	2454725	2454736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021352	CAAAAA	2	12	2488542	2488553	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021352	AAAACG	2	12	2528412	2528423	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021352	GGGAAA	2	12	2557533	2557544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021352	GAGTGG	2	12	2571085	2571096	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021352	CACTAT	2	12	2601194	2601205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021352	CTGAAA	2	12	2625036	2625047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021352	CCCCAC	2	12	2693932	2693943	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_021352	ACCACA	2	12	2718456	2718467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021352	CCAACA	2	12	2721410	2721421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021352	CAGGCA	2	12	2731222	2731233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021352	ACCACA	2	12	2732033	2732044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021352	CCAACA	2	12	2734982	2734993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021352	GACCCC	2	12	2799143	2799154	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021352	AGAACA	2	12	2851209	2851220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021352	GAAACC	2	12	2882039	2882050	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021352	CCACCT	2	12	2998248	2998259	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021352	ACTGCG	2	12	3006148	3006159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021352	TTTTAT	2	12	3010747	3010758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021352	ACCCCC	2	12	3014561	3014572	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_021352	TGCTGG	2	12	3019748	3019759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021352	AGTTGC	2	12	3023656	3023667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021352	CCCCGT	2	12	3069326	3069337	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_021352	GGTAAT	2	12	3077516	3077527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021352	AACTTA	2	12	3091076	3091087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021352	ACAAGG	2	12	3091255	3091266	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021352	ACCACA	2	12	3200819	3200830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021352	CCAACA	2	12	3203771	3203782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021352	ATCTGA	2	12	3220784	3220795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021352	CAGATT	2	12	3230061	3230072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021352	GTTGAG	2	12	3297873	3297884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021352	GAGGGG	2	12	3325523	3325534	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.