MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum SCgG1

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021351	GAAATT	2	12	2108	2119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021351	GGTCTT	2	12	45160	45171	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021351	CCTTCA	2	12	57251	57262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021351	TCGCTT	2	12	70192	70203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021351	AAGTCC	2	12	95050	95061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021351	TTGTGG	2	12	100565	100576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021351	CTGGGG	2	12	105354	105365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021351	GTATAC	2	12	126166	126177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021351	CAGACC	2	12	181206	181217	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021351	GAATCT	2	12	190000	190011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021351	TGTACC	2	12	207998	208009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021351	AAATAC	2	12	221026	221037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021351	CCTCAC	2	12	226682	226693	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021351	GGGGTG	2	12	267486	267497	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021351	AAATTA	2	12	356988	356999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021351	AAAGGA	2	12	437664	437675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021351	AAATTC	2	12	461166	461177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021351	GATTAG	2	12	470802	470813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021351	GCTCGG	2	12	473452	473463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021351	ATCACC	2	12	480415	480426	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021351	GGCGAC	2	12	570621	570632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021351	TTCAGG	2	12	576295	576306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021351	TAGATA	2	12	598768	598779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021351	TTTTAC	2	12	601345	601356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021351	TGGGTT	2	12	638511	638522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021351	ACTTCA	2	12	662420	662431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021351	GTAAAC	2	12	684827	684838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021351	GTTTCG	2	12	733591	733602	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021351	ACACAG	2	12	762329	762340	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021351	CTGGTT	2	12	837982	837993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021351	GAAAAA	2	12	866886	866897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021351	AGTCAA	2	12	961880	961891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021351	ATTTTC	2	12	965967	965978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021351	CGAACA	2	12	978496	978507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021351	CTTACG	2	12	982738	982749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021351	CTAGAC	2	12	983371	983382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021351	TTCCCG	2	12	1021594	1021605	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021351	CAAAAC	2	12	1040481	1040492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021351	TTGTGG	2	12	1062172	1062183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021351	TTCACA	2	12	1082964	1082975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021351	TAACAA	2	12	1086918	1086929	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021351	CCGGGC	2	12	1174929	1174940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021351	TTAAGT	2	12	1274846	1274857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021351	TCCCAC	2	12	1343541	1343552	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021351	TTTCTT	2	12	1383978	1383989	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021351	AAGGAT	2	12	1401447	1401458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021351	CGCTGG	2	12	1448586	1448597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021351	AACTCA	2	12	1472964	1472975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021351	CCGGAA	2	12	1506247	1506258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021351	CGGTTT	2	12	1554334	1554345	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021351	GGGGAT	2	12	1617483	1617494	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021351	TTTTCA	2	12	1617563	1617574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021351	TTGTGG	2	12	1675638	1675649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021351	GATATT	2	12	1755783	1755794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021351	GTCATG	2	12	1756385	1756396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021351	TTCAAT	2	12	1756425	1756436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021351	CTTTTA	2	12	1804352	1804363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021351	AACGAA	2	12	1855290	1855301	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021351	GTGCTT	2	12	1869541	1869552	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021351	AGTGTT	2	12	1910937	1910948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021351	ATCCTC	2	12	1934690	1934701	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021351	AGCCTT	2	12	1976233	1976244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021351	GTTATA	2	12	2005410	2005421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021351	CTTTTG	2	12	2022335	2022346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021351	TTTTTA	2	12	2063025	2063036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021351	AAACCA	2	12	2065170	2065181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021351	CGTTTC	2	12	2126192	2126203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021351	CCAGTA	2	12	2165069	2165080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021351	GCCGAT	2	12	2237139	2237150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021351	CCGGAT	2	12	2250167	2250178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021351	TCAGCG	2	12	2269511	2269522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021351	GGATAC	2	12	2285266	2285277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021351	TTAGCT	2	12	2310054	2310065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021351	TTTCGC	2	12	2319758	2319769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021351	CTAAAG	2	12	2365177	2365188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021351	AACTTG	2	12	2384171	2384182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021351	CCGGGC	2	12	2389835	2389846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021351	GCCTAA	2	12	2391789	2391800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021351	ATCACC	2	12	2454403	2454414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021351	ACAGTG	2	12	2454726	2454737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021351	CAAAAA	2	12	2488543	2488554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021351	AAAACG	2	12	2528413	2528424	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021351	GGGAAA	2	12	2557534	2557545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021351	GAGTGG	2	12	2571086	2571097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021351	CACTAT	2	12	2601195	2601206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021351	CTGAAA	2	12	2625037	2625048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021351	CCCCAC	2	12	2693933	2693944	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_021351	ACCACA	2	12	2718457	2718468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021351	CCAACA	2	12	2721411	2721422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021351	CAGGCA	2	12	2731223	2731234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021351	ACCACA	2	12	2732034	2732045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021351	CCAACA	2	12	2734983	2734994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021351	GACCCC	2	12	2799144	2799155	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021351	AGAACA	2	12	2851210	2851221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021351	GAAACC	2	12	2882040	2882051	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021351	CCACCT	2	12	2998249	2998260	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021351	ACTGCG	2	12	3006149	3006160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021351	TTTTAT	2	12	3010748	3010759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021351	ACCCCC	2	12	3014562	3014573	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_021351	TGCTGG	2	12	3019749	3019760	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021351	AGTTGC	2	12	3023657	3023668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021351	CCCCGT	2	12	3069327	3069338	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021351	GGTAAT	2	12	3077517	3077528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021351	AACTTA	2	12	3091077	3091088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021351	ACAAGG	2	12	3091256	3091267	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021351	ACCACA	2	12	3200820	3200831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021351	CCAACA	2	12	3203772	3203783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021351	ATCTGA	2	12	3220785	3220796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021351	CAGATT	2	12	3230062	3230073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021351	GTTGAG	2	12	3297874	3297885	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021351	GAGGGG	2	12	3325524	3325535	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.