MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Thunder Bay

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021350	AATGCA	2	12	4257	4268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021350	TCGAAT	2	12	11109	11120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021350	TCCGTG	2	12	30448	30459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021350	GTTTAT	2	12	31706	31717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021350	CTTATT	2	12	89495	89506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021350	TTAATA	2	12	135740	135751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021350	TCAACA	2	12	187887	187898	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021350	AAATGC	2	12	193979	193990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021350	TTATTT	2	12	210955	210966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021350	TAAAAT	2	12	292876	292887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021350	TAGCTT	2	12	304504	304515	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021350	GCCTTG	2	12	310408	310419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021350	TGTCCA	2	12	314221	314232	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021350	AAAATC	2	12	316082	316093	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021350	CATTTG	3	18	316723	316740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021350	AATTTA	2	12	363126	363137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021350	ATTTTA	2	12	407729	407740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021350	TTATTT	2	12	472505	472516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021350	CTTGGT	2	12	507100	507111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021350	ATTAAA	2	12	508269	508280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021350	TTAAAT	2	12	509394	509405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021350	TAAAAT	2	12	524648	524659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021350	ATCCTG	2	12	525204	525215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021350	TTTTCA	2	12	554807	554818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021350	AATCAA	2	12	585042	585053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021350	TTTAAA	2	12	591172	591183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021350	TGAAAT	2	12	604046	604057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021350	TAAAAT	2	12	612574	612585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021350	ATTTAT	2	12	615070	615081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021350	TTGTGG	2	12	862539	862550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021350	AAATGG	2	12	862715	862726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021350	TTTTTA	2	12	900085	900096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021350	TACGGT	2	12	911190	911201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021350	TTTTAT	2	12	972895	972906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021350	AAAGAG	2	12	990193	990204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021350	TTTCGT	2	12	1007073	1007084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021350	AAGTGC	2	12	1008317	1008328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021350	GAAATG	2	12	1008468	1008479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021350	TTAAAA	2	12	1061495	1061506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021350	ATTTTT	2	12	1071716	1071727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021350	CTATCC	2	12	1098954	1098965	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021350	TGATTT	2	12	1099097	1099108	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021350	CTCAAA	2	12	1146992	1147003	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021350	GACCAA	2	12	1185054	1185065	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021350	AATGCG	2	12	1195546	1195557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021350	ATTTCA	2	12	1196972	1196983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021350	AGCGCA	2	12	1211437	1211448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021350	TGTTTT	2	12	1235912	1235923	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021350	GATTTA	2	12	1240627	1240638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021350	AATTTT	2	12	1293139	1293150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021350	TTTTAT	2	12	1338914	1338925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021350	AATTTT	2	12	1367248	1367259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021350	GTTTAT	2	12	1368863	1368874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021350	AATTTT	2	12	1404553	1404564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021350	GACTTT	2	12	1405726	1405737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021350	TGCAAT	2	12	1407628	1407639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021350	GAAAAA	2	12	1424332	1424343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021350	ATCATT	2	12	1469399	1469410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021350	AAATTG	2	12	1478833	1478844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021350	AAAATA	2	12	1481351	1481362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021350	TATTTG	2	12	1506457	1506468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021350	TAAAAA	2	12	1510701	1510712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021350	TTAAAA	2	12	1514935	1514946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021350	TAAAAA	2	12	1518865	1518876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021350	TTTTTA	2	12	1522662	1522673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021350	AATCAT	2	12	1542861	1542872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021350	TTGATA	2	12	1605397	1605408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021350	TAATGC	2	12	1642986	1642997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021350	GATATT	2	12	1662353	1662364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021350	AATATT	2	12	1685598	1685609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021350	AAAATT	2	12	1701199	1701210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021350	TATTTT	2	12	1758151	1758162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021350	ATCCAT	2	12	1773939	1773950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021350	AAAAAT	2	12	1844870	1844881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021350	AGACTT	2	12	1862159	1862170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021350	ATCAAC	2	12	1877618	1877629	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021350	AAATTT	2	12	1921122	1921133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021350	AAAAAT	2	12	2037249	2037260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021350	TCAAAA	2	12	2074120	2074131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021350	CTTTTT	2	12	2079069	2079080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021350	ATTTAG	2	12	2082719	2082730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021350	ACTTTT	2	12	2103139	2103150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021350	GGACCT	2	12	2104833	2104844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021350	CAGCCC	2	12	2215039	2215050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021350	TGTAAT	2	12	2237054	2237065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021350	TTAATT	2	12	2272704	2272715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021350	AAATAA	2	12	2324173	2324184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021350	AACATT	2	12	2342004	2342015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021350	AATTAT	2	12	2405035	2405046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021350	AAGAAA	2	12	2410038	2410049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021350	TCAAAT	2	12	2414029	2414040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021350	TATTCA	2	12	2438417	2438428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021350	ATTCTG	2	12	2442897	2442908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021350	AATTTA	2	12	2450933	2450944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021350	TTTGAC	2	12	2454967	2454978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021350	TATTCT	2	12	2456912	2456923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021350	GCCTTG	2	12	2463551	2463562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021350	CAAAGT	2	12	2465622	2465633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021350	AAACAA	2	12	2508137	2508148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021350	ATTTTA	2	12	2553871	2553882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021350	CCTTGT	2	12	2581951	2581962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021350	CAAAGA	2	12	2589539	2589550	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021350	AAATGA	2	12	2615063	2615074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021350	TAAAAA	2	12	2654747	2654758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021350	CTTTTT	2	12	2688350	2688361	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021350	TCTTAT	2	12	2726103	2726114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021350	AAATTA	2	12	2735877	2735888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021350	GTTAAG	2	12	2737438	2737449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021350	TATTTC	2	12	2757443	2757454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021350	TTAGTC	2	12	2792812	2792823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021350	ACAAAT	2	12	2818406	2818417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021350	CATAAA	2	12	2850758	2850769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021350	TTTTTA	2	12	2855381	2855392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021350	TGAATT	2	12	2901419	2901430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021350	CATAGA	2	12	2913577	2913588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021350	AGAAAC	2	12	2945350	2945361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021350	ATATGG	2	12	2953596	2953607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021350	TTTATA	2	12	2953684	2953695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021350	CGTGAT	2	12	2957109	2957120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021350	GAATAA	2	12	3018349	3018360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021350	AAAATC	2	12	3102125	3102136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021350	TTCTGA	2	12	3110948	3110959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021350	ATAAAA	2	12	3118221	3118232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021350	ATTTCA	2	12	3153775	3153786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021350	CAAATG	2	12	3155645	3155656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021350	TTATTT	2	12	3196582	3196593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021350	CAAGGT	2	12	3247796	3247807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021350	CAAGGT	2	12	3318578	3318589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021350	AATTAT	2	12	3336832	3336843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021350	ATTATA	2	12	3343897	3343908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021350	TTTAAA	2	12	3353243	3353254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021350	TCAACA	2	12	3373431	3373442	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021350	TAAAAA	2	12	3377388	3377399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021350	TACTGA	2	12	3384077	3384088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021350	CTTATT	2	12	3419316	3419327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.