MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021314	TAAGGA	2	12	25318	25329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021314	AAGTGT	2	12	28619	28630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021314	ACTAAT	2	12	28648	28659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021314	CTTTTG	2	12	49436	49447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021314	CTTAAT	2	12	72992	73003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021314	GAAAGT	2	12	76736	76747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021314	AAAATT	2	12	81598	81609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021314	TAACAA	2	12	93120	93131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021314	TAATGT	2	12	98561	98572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021314	GCCTCT	2	12	154630	154641	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021314	AACAAG	2	12	244867	244878	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021314	TGCTTT	2	12	250066	250077	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021314	AGAAAA	2	12	277121	277132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021314	AATGAA	2	12	284435	284446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021314	TATAAT	2	12	293424	293435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021314	ACAAAG	2	12	305740	305751	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021314	TTTCCT	2	12	359007	359018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021314	TAAGGA	2	12	360983	360994	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021314	AAGTGT	2	12	364284	364295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021314	ACTAAT	2	12	364313	364324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021314	TTCTTT	2	12	364801	364812	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021314	TATTTT	2	12	373150	373161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021314	GTGTTT	2	12	411040	411051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021314	TAAGGA	2	12	412946	412957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021314	AAGTGT	2	12	416247	416258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021314	ACTAAT	2	12	416276	416287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021314	TTTTGG	2	12	431248	431259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021314	TAAAGT	2	12	464444	464455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021314	AAAGAA	2	12	480172	480183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021314	ATTTGA	2	12	485608	485619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021314	TATAAT	2	12	579101	579112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021314	AATGAA	2	12	580929	580940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021314	TAGACT	2	12	582569	582580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021314	ATTAAA	2	12	612344	612355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021314	TTTAAT	2	12	612365	612376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021314	TATTTA	2	12	615194	615205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021314	ATTTTC	2	12	674313	674324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021314	TAAAGA	2	12	674335	674346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021314	AAATGC	2	12	801567	801578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021314	AGTAAC	2	12	812432	812443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021314	ACATTA	2	12	824963	824974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021314	TTCGGG	2	12	846534	846545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021314	GAAAAC	2	12	854390	854401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021314	GAGAAA	2	12	862524	862535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021314	AAAGAA	2	12	862941	862952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021314	AGATAA	2	12	902085	902096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021314	TTTAGG	2	12	975736	975747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021314	TTTGCT	2	12	988358	988369	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021314	AAATGT	2	12	1002920	1002931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021314	TTGAAA	2	12	1008685	1008696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021314	TAACAA	2	12	1053286	1053297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021314	CAAAAA	2	12	1116522	1116533	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021314	TAAAGA	2	12	1122245	1122256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021314	TATAAT	2	12	1235335	1235346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021314	TAATTA	2	12	1240047	1240058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021314	TACCAC	2	12	1248429	1248440	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021314	ATGTTA	2	12	1250560	1250571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021314	AGCTGT	2	12	1340402	1340413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021314	ATAAAA	2	12	1383573	1383584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021314	TAAAAA	2	12	1401555	1401566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021314	TAATGT	2	12	1407139	1407150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021314	TTTATT	2	12	1410280	1410291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021314	GTTATT	2	12	1410436	1410447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021314	TATAAT	2	12	1477266	1477277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021314	AAAGAA	2	12	1568921	1568932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021314	TATTAG	2	12	1569407	1569418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021314	TACACT	2	12	1569436	1569447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021314	TCCTTA	2	12	1572738	1572749	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021314	CTATTT	2	12	1579141	1579152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021314	TCCAAG	2	12	1593716	1593727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021314	TCTTTT	2	12	1603072	1603083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021314	GCAAAA	2	12	1656875	1656886	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021314	TTTTCA	2	12	1711014	1711025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021314	CAATAA	2	12	1764219	1764230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021314	TATAAT	2	12	1779272	1779283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021314	GTTTTT	2	12	1789573	1789584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021314	AAGATA	2	12	1826521	1826532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021314	TATTAC	2	12	1834675	1834686	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021314	TCTTTT	2	12	1893074	1893085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021314	TTTAGC	2	12	1941863	1941874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021314	CAAATG	2	12	1942957	1942968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021314	GTTACC	2	12	1943536	1943547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021314	TATAAG	2	12	1945292	1945303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021314	GTTACT	2	12	1945381	1945392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021314	GTTACT	2	12	1946287	1946298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021314	CCATTT	2	12	1948148	1948159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021314	ATCTTT	2	12	1949940	1949951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021314	TTATAA	2	12	1951032	1951043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021314	TACATA	2	12	1951241	1951252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021314	AAAGAG	2	12	1988688	1988699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021314	GTTCAA	2	12	2034578	2034589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021314	TCCTTT	2	12	2071520	2071531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021314	AAGAAT	2	12	2079691	2079702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021314	TTTTAA	2	12	2095201	2095212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021314	CTGTTT	2	12	2113225	2113236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.