MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021314	AGGAA	2	10	2807	2816	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021314	ATGGA	2	10	9985	9994	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021314	CAGTT	2	10	23272	23281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021314	TCGTG	2	10	24844	24853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021314	GTTAA	2	10	25777	25786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021314	GGGAG	2	10	26295	26304	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021314	AGGGA	2	10	28507	28516	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021314	GCTTA	2	10	28858	28867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021314	TCATT	2	10	31565	31574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021314	TATAA	2	10	37970	37979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021314	TATAA	2	10	50805	50814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021314	AAAAG	2	10	53073	53082	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021314	AAAAT	2	10	58963	58972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021314	GGGAG	2	10	60500	60509	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021314	AAGGA	2	10	69746	69755	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021314	TTCAA	2	10	71168	71177	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021314	GTTTC	2	10	78005	78014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021314	ACTCT	2	10	81545	81554	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021314	ATAGA	2	10	81655	81664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021314	AAGGA	2	10	81686	81695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021314	CTTTT	2	10	83368	83377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021314	ACTTG	2	10	84675	84684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021314	ATTTT	2	10	86482	86491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021314	TTCAT	2	10	86538	86547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021314	CTTTT	2	10	90262	90271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021314	TTCTA	2	10	107851	107860	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021314	TGATA	2	10	126392	126401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021314	TCTAT	2	10	132020	132029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021314	TAGTG	2	10	134656	134665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021314	GAAAA	2	10	134718	134727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021314	TGATT	2	10	163072	163081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021314	AAAGA	2	10	163171	163180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021314	TAATA	2	10	169287	169296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021314	CTAAG	2	10	179828	179837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021314	AATTA	2	10	184473	184482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021314	AAAAG	2	10	209473	209482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021314	AAGGA	2	10	212487	212496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021314	AAAAG	2	10	215170	215179	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021314	TCTTA	2	10	217370	217379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021314	ATTAG	2	10	223954	223963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021314	ACAAG	2	10	224194	224203	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021314	AGAGT	2	10	224318	224327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021314	ACTCT	2	10	228992	229001	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_021314	ATTAA	2	10	257956	257965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021314	AAGTG	2	10	270740	270749	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021314	TAAAA	2	10	271715	271724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021314	ATAGA	2	10	278047	278056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021314	AAAAC	2	10	283660	283669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021314	CTATA	2	10	284337	284346	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021314	TAGAA	2	10	286850	286859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021314	ATATT	2	10	293041	293050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021314	TAAAA	2	10	294340	294349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021314	ATTAT	2	10	297534	297543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021314	TAAAA	2	10	318207	318216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021314	AGTTG	2	10	322568	322577	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021314	TTTTG	2	10	327761	327770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021314	TTGTG	2	10	328461	328470	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021314	TTAAA	2	10	328623	328632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021314	TAACA	2	10	339795	339804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021314	AGGAA	2	10	340800	340809	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021314	TTTAT	2	10	359030	359039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021314	TCGTG	2	10	360509	360518	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021314	GTTAA	2	10	361442	361451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021314	GGGAG	2	10	361960	361969	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021314	AGGGA	2	10	364172	364181	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021314	GCTTA	2	10	364523	364532	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021314	GATAG	2	10	364623	364632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021314	TTAAA	2	10	369014	369023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021314	GAAAA	2	10	384941	384950	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021314	TCATT	2	10	389040	389049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021314	TTATT	2	10	402758	402767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021314	TAAAA	2	10	402883	402892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021314	TCGTG	2	10	412472	412481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021314	GTTAA	2	10	413405	413414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021314	GGGAG	2	10	413923	413932	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021314	AGGGA	2	10	416135	416144	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021314	GCTTA	2	10	416486	416495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021314	TAAAA	2	10	418426	418435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021314	GTATA	2	10	426724	426733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021314	CATTG	2	10	426969	426978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021314	TGAGA	2	10	431319	431328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021314	AAAAT	2	10	450053	450062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021314	CTGGT	2	10	465337	465346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021314	AATTC	2	10	478253	478262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021314	TATAA	2	10	482884	482893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021314	ATGAG	2	10	487811	487820	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021314	ATATT	2	10	490486	490495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021314	GAATA	2	10	490785	490794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021314	AGAAT	2	10	493826	493835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021314	ATTTT	2	10	505797	505806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021314	AAAGA	2	10	531032	531041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021314	TATGA	2	10	548446	548455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021314	AGAGG	2	10	565840	565849	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021314	ATGAT	2	10	567986	567995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021314	GCCTA	2	10	570246	570255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021314	ATTCA	2	10	572867	572876	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021314	TAGTT	2	10	583483	583492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021314	ATAGA	2	10	612320	612329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021314	ATTTG	2	10	625149	625158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021314	TGTTA	2	10	664298	664307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021314	AATAT	2	10	664623	664632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021314	TAAAA	2	10	666202	666211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021314	ACTCT	2	10	667640	667649	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021314	AGAAA	2	10	675235	675244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021314	ACTAA	2	10	691083	691092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021314	TATAA	2	10	692798	692807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021314	GAAAA	2	10	696589	696598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021314	TTTGT	2	10	702297	702306	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021314	ATTTC	2	10	707535	707544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021314	AAGTC	2	10	730888	730897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021314	ACTCT	2	10	744238	744247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021314	AAGAT	2	10	764931	764940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021314	TAATA	2	10	765113	765122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021314	GGAAA	2	10	767309	767318	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021314	ACAAA	2	10	781594	781603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021314	ATTGT	2	10	789561	789570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021314	ATAAA	2	10	801633	801642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021314	ATTTT	2	10	807369	807378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021314	TAATG	2	10	813379	813388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021314	TCTTT	2	10	813522	813531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021314	TTCTT	2	10	850612	850621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021314	AAGAT	2	10	854444	854453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021314	TACGA	2	10	862228	862237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021314	AAATG	2	10	862307	862316	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021314	ATTGT	2	10	863757	863766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021314	ATAAA	2	10	865047	865056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021314	GAGTA	2	10	876203	876212	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021314	TAGTC	2	10	876258	876267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021314	AACAA	2	10	890438	890447	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021314	ACTAG	2	10	890873	890882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021314	ATGAT	2	10	902171	902180	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021314	GTTTT	2	10	910509	910518	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021314	CATTA	2	10	910568	910577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021314	TATTT	2	10	917307	917316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021314	TCTTT	2	10	926736	926745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021314	AGAAA	2	10	943176	943185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021314	CATAA	2	10	956312	956321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021314	GATAT	2	10	961199	961208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021314	GAATA	2	10	968720	968729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021314	AAAAC	2	10	970918	970927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021314	TTTAT	2	10	978113	978122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021314	CTTTT	2	10	984662	984671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021314	TATTT	2	10	988053	988062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021314	ACTCT	2	10	991856	991865	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_021314	ACTCT	2	10	1000246	1000255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021314	TCCTC	2	10	1002427	1002436	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_021314	ACAAA	2	10	1002528	1002537	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021314	AGAGT	2	10	1003031	1003040	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021314	AAGCA	2	10	1007508	1007517	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021314	TTCCT	2	10	1007523	1007532	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_021314	TCATA	2	10	1008625	1008634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021314	TTTTA	2	10	1012597	1012606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021314	TAGCA	2	10	1034336	1034345	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_021314	TCTTT	2	10	1349960	1349969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_021314	ACTCT	2	10	1426518	1426527	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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253	NC_021314	CTAGA	2	10	1851142	1851151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_021314	CTTAT	2	10	1870722	1870731	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_021314	AAAAC	2	10	2034999	2035008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_021314	CTTTT	2	10	2060119	2060128	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_021314	ATGAA	2	10	2103867	2103876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021314	AACTA	2	10	2135382	2135391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_021314	TATCA	2	10	2138099	2138108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
280	NC_021314	ACTCT	2	10	2147526	2147535	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.