MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 1322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021314	TTAGT	2	10	1086	1095	20 %	60 %	20 %	0 %	508126651
2	NC_021314	TTTTC	2	10	2294	2303	0 %	80 %	0 %	20 %	508126652
3	NC_021314	CATTT	2	10	2601	2610	20 %	60 %	0 %	20 %	508126652
4	NC_021314	ATGAT	2	10	4690	4699	40 %	40 %	20 %	0 %	508126655
5	NC_021314	GAATT	2	10	5580	5589	40 %	40 %	20 %	0 %	508126656
6	NC_021314	CAAAA	2	10	6696	6705	80 %	0 %	0 %	20 %	508126656
7	NC_021314	GTTTT	2	10	9720	9729	0 %	80 %	20 %	0 %	508126657
8	NC_021314	TGAAA	2	10	10191	10200	60 %	20 %	20 %	0 %	508126658
9	NC_021314	CTATT	2	10	11390	11399	20 %	60 %	0 %	20 %	508126661
10	NC_021314	AAATT	2	10	11538	11547	60 %	40 %	0 %	0 %	508126661
11	NC_021314	CTTTC	2	10	19551	19560	0 %	60 %	0 %	40 %	508126668
12	NC_021314	TTTAC	2	10	20186	20195	20 %	60 %	0 %	20 %	508126669
13	NC_021314	GATTT	2	10	20316	20325	20 %	60 %	20 %	0 %	508126670
14	NC_021314	CTTAT	2	10	35942	35951	20 %	60 %	0 %	20 %	508126679
15	NC_021314	CCAAA	2	10	38302	38311	60 %	0 %	0 %	40 %	508126683
16	NC_021314	GATGG	2	10	38414	38423	20 %	20 %	60 %	0 %	508126683
17	NC_021314	AATTT	2	10	42041	42050	40 %	60 %	0 %	0 %	508126687
18	NC_021314	AGAAT	2	10	43535	43544	60 %	20 %	20 %	0 %	508126687
19	NC_021314	AATCA	2	10	45070	45079	60 %	20 %	0 %	20 %	508126690
20	NC_021314	TGCCA	2	10	45642	45651	20 %	20 %	20 %	40 %	508126690
21	NC_021314	AGTTG	2	10	46686	46695	20 %	40 %	40 %	0 %	508126692
22	NC_021314	ATTTG	2	10	51064	51073	20 %	60 %	20 %	0 %	508126696
23	NC_021314	ATGGA	2	10	51617	51626	40 %	20 %	40 %	0 %	508126696
24	NC_021314	ATGGT	2	10	56785	56794	20 %	40 %	40 %	0 %	508126701
25	NC_021314	TAAAT	2	10	56957	56966	60 %	40 %	0 %	0 %	508126701
26	NC_021314	TGAAA	2	10	57239	57248	60 %	20 %	20 %	0 %	508126701
27	NC_021314	GTTAT	2	10	60185	60194	20 %	60 %	20 %	0 %	508126703
28	NC_021314	TTAGT	2	10	61019	61028	20 %	60 %	20 %	0 %	508126704
29	NC_021314	TTGAA	2	10	64922	64931	40 %	40 %	20 %	0 %	508126708
30	NC_021314	TGGCG	2	10	65119	65128	0 %	20 %	60 %	20 %	508126708
31	NC_021314	GAAAA	2	10	66806	66815	80 %	0 %	20 %	0 %	508126711
32	NC_021314	TTTGG	2	10	67220	67229	0 %	60 %	40 %	0 %	508126712
33	NC_021314	AAATC	2	10	67692	67701	60 %	20 %	0 %	20 %	508126713
34	NC_021314	TGAAA	2	10	68656	68665	60 %	20 %	20 %	0 %	508126715
35	NC_021314	AAAAT	2	10	70656	70665	80 %	20 %	0 %	0 %	508126721
36	NC_021314	TCCAA	2	10	74272	74281	40 %	20 %	0 %	40 %	508126727
37	NC_021314	CGTGA	2	10	77919	77928	20 %	20 %	40 %	20 %	508126734
38	NC_021314	ATTTG	2	10	78843	78852	20 %	60 %	20 %	0 %	508126735
39	NC_021314	CACAT	2	10	81318	81327	40 %	20 %	0 %	40 %	508126737
40	NC_021314	CAAGC	2	10	82361	82370	40 %	0 %	20 %	40 %	508126738
41	NC_021314	CTCTT	2	10	83109	83118	0 %	60 %	0 %	40 %	508126738
42	NC_021314	GAACA	2	10	83227	83236	60 %	0 %	20 %	20 %	508126738
43	NC_021314	AAAGA	2	10	83298	83307	80 %	0 %	20 %	0 %	508126738
44	NC_021314	TAAGT	2	10	86628	86637	40 %	40 %	20 %	0 %	508126743
45	NC_021314	AAAAG	2	10	87422	87431	80 %	0 %	20 %	0 %	508126744
46	NC_021314	AGTTA	2	10	89435	89444	40 %	40 %	20 %	0 %	508126746
47	NC_021314	ATGAT	2	10	90338	90347	40 %	40 %	20 %	0 %	508126749
48	NC_021314	TTTTG	2	10	98955	98964	0 %	80 %	20 %	0 %	508126760
49	NC_021314	ATGTT	2	10	100915	100924	20 %	60 %	20 %	0 %	508126762
50	NC_021314	ATTAC	2	10	103218	103227	40 %	40 %	0 %	20 %	508126763
51	NC_021314	AGTTG	2	10	104764	104773	20 %	40 %	40 %	0 %	508126764
52	NC_021314	TATTG	2	10	108438	108447	20 %	60 %	20 %	0 %	508126767
53	NC_021314	GCAAA	2	10	109574	109583	60 %	0 %	20 %	20 %	508126769
54	NC_021314	AACTA	2	10	112549	112558	60 %	20 %	0 %	20 %	508126772
55	NC_021314	CGAGT	2	10	112745	112754	20 %	20 %	40 %	20 %	508126772
56	NC_021314	GATTG	2	10	114168	114177	20 %	40 %	40 %	0 %	508126772
57	NC_021314	TAAAT	2	10	116615	116624	60 %	40 %	0 %	0 %	508126773
58	NC_021314	TAATT	2	10	123274	123283	40 %	60 %	0 %	0 %	508126776
59	NC_021314	TTGAG	2	10	124255	124264	20 %	40 %	40 %	0 %	508126777
60	NC_021314	TCCTT	2	10	125054	125063	0 %	60 %	0 %	40 %	508126779
61	NC_021314	AGAAA	2	10	125133	125142	80 %	0 %	20 %	0 %	508126779
62	NC_021314	ATAAG	2	10	125201	125210	60 %	20 %	20 %	0 %	508126779
63	NC_021314	TCTTA	2	10	125386	125395	20 %	60 %	0 %	20 %	508126780
64	NC_021314	TTATT	2	10	126696	126705	20 %	80 %	0 %	0 %	508126783
65	NC_021314	AACAA	2	10	128294	128303	80 %	0 %	0 %	20 %	508126784
66	NC_021314	ATTAT	2	10	128962	128971	40 %	60 %	0 %	0 %	508126786
67	NC_021314	GTTTT	2	10	130893	130902	0 %	80 %	20 %	0 %	508126789
68	NC_021314	GCCTT	2	10	131640	131649	0 %	40 %	20 %	40 %	508126789
69	NC_021314	TAAAA	2	10	133397	133406	80 %	20 %	0 %	0 %	508126793
70	NC_021314	AAACT	2	10	135919	135928	60 %	20 %	0 %	20 %	508126797
71	NC_021314	GCAAA	2	10	138286	138295	60 %	0 %	20 %	20 %	508126799
72	NC_021314	AACCA	2	10	139952	139961	60 %	0 %	0 %	40 %	508126801
73	NC_021314	ATGAC	2	10	140716	140725	40 %	20 %	20 %	20 %	508126802
74	NC_021314	GTCTC	2	10	147696	147705	0 %	40 %	20 %	40 %	508126805
75	NC_021314	AGGAA	2	10	150080	150089	60 %	0 %	40 %	0 %	508126807
76	NC_021314	AAAGT	2	10	150840	150849	60 %	20 %	20 %	0 %	508126808
77	NC_021314	AAACT	2	10	151605	151614	60 %	20 %	0 %	20 %	508126808
78	NC_021314	GGTTT	2	10	153062	153071	0 %	60 %	40 %	0 %	508126810
79	NC_021314	GTTTG	2	10	153352	153361	0 %	60 %	40 %	0 %	508126810
80	NC_021314	ACCGC	2	10	153822	153831	20 %	0 %	20 %	60 %	508126811
81	NC_021314	CCATA	2	10	154981	154990	40 %	20 %	0 %	40 %	508126813
82	NC_021314	ACAGC	2	10	155189	155198	40 %	0 %	20 %	40 %	508126813
83	NC_021314	AAAGC	2	10	156196	156205	60 %	0 %	20 %	20 %	508126814
84	NC_021314	AGCAG	2	10	157559	157568	40 %	0 %	40 %	20 %	508126816
85	NC_021314	CAAAC	2	10	157650	157659	60 %	0 %	0 %	40 %	508126816
86	NC_021314	TGGAA	2	10	158692	158701	40 %	20 %	40 %	0 %	508126818
87	NC_021314	CAAGG	2	10	160220	160229	40 %	0 %	40 %	20 %	508126818
88	NC_021314	AGAAC	2	10	160625	160634	60 %	0 %	20 %	20 %	508126818
89	NC_021314	TGCCA	2	10	161250	161259	20 %	20 %	20 %	40 %	508126819
90	NC_021314	TGATA	2	10	162920	162929	40 %	40 %	20 %	0 %	508126823
91	NC_021314	TAGAT	2	10	162995	163004	40 %	40 %	20 %	0 %	508126823
92	NC_021314	AGAGT	2	10	163664	163673	40 %	20 %	40 %	0 %	508126824
93	NC_021314	TAGAG	2	10	164900	164909	40 %	20 %	40 %	0 %	508126827
94	NC_021314	TCAAA	2	10	165521	165530	60 %	20 %	0 %	20 %	508126828
95	NC_021314	ACACA	2	10	165541	165550	60 %	0 %	0 %	40 %	508126828
96	NC_021314	GTTAT	2	10	166871	166880	20 %	60 %	20 %	0 %	508126829
97	NC_021314	TATTT	2	10	171898	171907	20 %	80 %	0 %	0 %	508126833
98	NC_021314	TGTCT	2	10	172060	172069	0 %	60 %	20 %	20 %	508126833
99	NC_021314	TTTTA	2	10	173352	173361	20 %	80 %	0 %	0 %	508126835
100	NC_021314	TCACA	2	10	173393	173402	40 %	20 %	0 %	40 %	508126835
101	NC_021314	GATTG	2	10	176150	176159	20 %	40 %	40 %	0 %	508126839
102	NC_021314	TACAA	2	10	177169	177178	60 %	20 %	0 %	20 %	508126840
103	NC_021314	GTAAT	2	10	183578	183587	40 %	40 %	20 %	0 %	508126843
104	NC_021314	TGGTG	2	10	184074	184083	0 %	40 %	60 %	0 %	508126843
105	NC_021314	ACACC	2	10	185321	185330	40 %	0 %	0 %	60 %	508126844
106	NC_021314	TATTC	2	10	185668	185677	20 %	60 %	0 %	20 %	508126845
107	NC_021314	ATTTC	2	10	186680	186689	20 %	60 %	0 %	20 %	508126846
108	NC_021314	AAGAA	2	10	186783	186792	80 %	0 %	20 %	0 %	508126846
109	NC_021314	TTAAC	2	10	192730	192739	40 %	40 %	0 %	20 %	508126855
110	NC_021314	ACTTA	2	10	193723	193732	40 %	40 %	0 %	20 %	508126855
111	NC_021314	CGTCA	2	10	193752	193761	20 %	20 %	20 %	40 %	508126855
112	NC_021314	CCAAG	2	10	195386	195395	40 %	0 %	20 %	40 %	508126856
113	NC_021314	CATTG	2	10	196140	196149	20 %	40 %	20 %	20 %	508126857
114	NC_021314	TTTGT	2	10	196282	196291	0 %	80 %	20 %	0 %	508126857
115	NC_021314	GAAAA	2	10	196456	196465	80 %	0 %	20 %	0 %	508126858
116	NC_021314	CCTTT	2	10	198097	198106	0 %	60 %	0 %	40 %	508126860
117	NC_021314	AAGAT	2	10	200603	200612	60 %	20 %	20 %	0 %	508126864
118	NC_021314	GATGT	2	10	200959	200968	20 %	40 %	40 %	0 %	508126865
119	NC_021314	TTTAT	2	10	203201	203210	20 %	80 %	0 %	0 %	508126867
120	NC_021314	ATGTC	2	10	204971	204980	20 %	40 %	20 %	20 %	508126870
121	NC_021314	CGATA	2	10	206535	206544	40 %	20 %	20 %	20 %	508126870
122	NC_021314	ATGGT	2	10	206567	206576	20 %	40 %	40 %	0 %	508126870
123	NC_021314	GAATG	2	10	206641	206650	40 %	20 %	40 %	0 %	508126870
124	NC_021314	CTTAT	2	10	208599	208608	20 %	60 %	0 %	20 %	508126871
125	NC_021314	ATGCC	2	10	209614	209623	20 %	20 %	20 %	40 %	508126872
126	NC_021314	CAAAG	2	10	211003	211012	60 %	0 %	20 %	20 %	508126873
127	NC_021314	ACTTA	2	10	211013	211022	40 %	40 %	0 %	20 %	508126873
128	NC_021314	GTGAT	2	10	211310	211319	20 %	40 %	40 %	0 %	508126873
129	NC_021314	CAAAT	2	10	214573	214582	60 %	20 %	0 %	20 %	508126877
130	NC_021314	TGGCT	2	10	216026	216035	0 %	40 %	40 %	20 %	508126878
131	NC_021314	CTTAC	2	10	217039	217048	20 %	40 %	0 %	40 %	508126879
132	NC_021314	GGATT	2	10	217557	217566	20 %	40 %	40 %	0 %	508126880
133	NC_021314	CAAGT	2	10	218916	218925	40 %	20 %	20 %	20 %	508126881
134	NC_021314	CAAGT	2	10	219720	219729	40 %	20 %	20 %	20 %	508126882
135	NC_021314	TGGTT	2	10	220738	220747	0 %	60 %	40 %	0 %	508126883
136	NC_021314	TTGTT	2	10	221564	221573	0 %	80 %	20 %	0 %	508126883
137	NC_021314	ATGTG	2	10	224545	224554	20 %	40 %	40 %	0 %	508126887
138	NC_021314	AAATC	2	10	226525	226534	60 %	20 %	0 %	20 %	508126890
139	NC_021314	CACAT	2	10	228765	228774	40 %	20 %	0 %	40 %	508126891
140	NC_021314	CATTA	2	10	230725	230734	40 %	40 %	0 %	20 %	508126893
141	NC_021314	AAGAC	2	10	232841	232850	60 %	0 %	20 %	20 %	508126895
142	NC_021314	TTCCC	2	10	233042	233051	0 %	40 %	0 %	60 %	508126895
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144	NC_021314	AAGAT	2	10	233926	233935	60 %	20 %	20 %	0 %	508126897
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153	NC_021314	TGCTT	2	10	245636	245645	0 %	60 %	20 %	20 %	508126905
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156	NC_021314	TACAA	2	10	254835	254844	60 %	20 %	0 %	20 %	508126913
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166	NC_021314	ATTTT	2	10	272402	272411	20 %	80 %	0 %	0 %	508126925
167	NC_021314	TGATT	2	10	276330	276339	20 %	60 %	20 %	0 %	508126928
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177	NC_021314	TTTGG	2	10	293067	293076	0 %	60 %	40 %	0 %	508126945
178	NC_021314	TTGAT	2	10	295621	295630	20 %	60 %	20 %	0 %	508126946
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243	NC_021314	CTCTA	2	10	399054	399063	20 %	40 %	0 %	40 %	508127045
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248	NC_021314	ATTTT	2	10	402419	402428	20 %	80 %	0 %	0 %	508127048
249	NC_021314	TTTAA	2	10	403885	403894	40 %	60 %	0 %	0 %	508127049
250	NC_021314	GGAAT	2	10	405000	405009	40 %	20 %	40 %	0 %	508127050
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252	NC_021314	GTTAC	2	10	407082	407091	20 %	40 %	20 %	20 %	508127051
253	NC_021314	ATCCA	2	10	407764	407773	40 %	20 %	0 %	40 %	508127052
254	NC_021314	TCGGA	2	10	409153	409162	20 %	20 %	40 %	20 %	508127053
255	NC_021314	AATCC	2	10	409222	409231	40 %	20 %	0 %	40 %	508127053
256	NC_021314	ATAAA	2	10	419035	419044	80 %	20 %	0 %	0 %	508127057
257	NC_021314	GAAGC	2	10	419482	419491	40 %	0 %	40 %	20 %	508127058
258	NC_021314	GATTG	2	10	421067	421076	20 %	40 %	40 %	0 %	508127059
259	NC_021314	AGCTA	2	10	424372	424381	40 %	20 %	20 %	20 %	508127061
260	NC_021314	ACAAT	2	10	424870	424879	60 %	20 %	0 %	20 %	508127062
261	NC_021314	ATGGT	2	10	425281	425290	20 %	40 %	40 %	0 %	508127062
262	NC_021314	TATTT	2	10	425657	425666	20 %	80 %	0 %	0 %	508127063
263	NC_021314	GTAAT	2	10	432276	432285	40 %	40 %	20 %	0 %	508127067
264	NC_021314	CAAAA	2	10	440188	440197	80 %	0 %	0 %	20 %	508127073
265	NC_021314	TTGAA	2	10	441157	441166	40 %	40 %	20 %	0 %	508127073
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