MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021313	TTTCGA	2	12	109194	109205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021313	GTGCCG	2	12	117403	117414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021313	AACAGA	2	12	186031	186042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021313	AGGTTG	2	12	209756	209767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021313	CGGCGA	2	12	209936	209947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021313	CGGCGC	2	12	210368	210379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021313	CGGGAA	2	12	238603	238614	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021313	ACGGAT	2	12	260870	260881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021313	ACTGAC	2	12	264037	264048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021313	GAGCCC	2	12	274582	274593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021313	CGGGCA	2	12	275255	275266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021313	AATGGA	2	12	281235	281246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021313	CTACGA	2	12	287339	287350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021313	GAAAGC	2	12	343938	343949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021313	CGCGAC	2	12	361901	361912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021313	CGTCGG	2	12	389678	389689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021313	TGCATC	2	12	397581	397592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021313	CGGCTC	2	12	398292	398303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021313	GAGTCG	2	12	424035	424046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021313	TTCGCT	2	12	441968	441979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021313	AAAACG	2	12	530206	530217	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021313	CGACCG	2	12	554601	554612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021313	CCGCCA	2	12	581242	581253	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021313	TGGGAT	2	12	588390	588401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021313	AACACA	2	12	628127	628138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021313	GTTCCA	2	12	630563	630574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021313	TTTCGA	2	12	630911	630922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021313	TTCCCT	2	12	631090	631101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021313	TCGCCC	2	12	637542	637553	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021313	GACAGC	2	12	663323	663334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021313	GTGCCA	2	12	667691	667702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021313	TCCGTC	2	12	672919	672930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021313	CTCGAC	2	12	686888	686899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021313	CTGTGG	2	12	690124	690135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021313	GTCGAG	2	12	693073	693084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021313	ACGGTC	2	12	724627	724638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021313	AATCGA	2	12	774586	774597	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021313	ACGAGG	2	12	783856	783867	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021313	TCGCCC	2	12	792219	792230	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021313	CGGCCG	2	12	858322	858333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021313	TTTCAC	2	12	868478	868489	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021313	ACGGGA	2	12	916658	916669	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021313	CCGTGA	2	12	921664	921675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021313	GCTCGC	2	12	924784	924795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021313	CGGGAA	2	12	931254	931265	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021313	CGACGG	2	12	945525	945536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021313	CGGACG	2	12	953958	953969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021313	CGACGG	2	12	955506	955517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021313	ATCGAT	2	12	957284	957295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021313	AGCGGC	2	12	988207	988218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021313	GCCCGG	2	12	1005358	1005369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021313	AGCTGC	2	12	1039770	1039781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021313	GTTCTT	2	12	1039842	1039853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021313	CGGATC	2	12	1040790	1040801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021313	GGGGCT	2	12	1069571	1069582	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021313	GCGGTT	2	12	1077448	1077459	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021313	CGGGCT	2	12	1124128	1124139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021313	TCGGAT	2	12	1139537	1139548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021313	CGGCGA	2	12	1152270	1152281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021313	ACCGAT	2	12	1197501	1197512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021313	TCGAAT	2	12	1254897	1254908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021313	CAAGAT	2	12	1272904	1272915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021313	GAACCG	2	12	1275138	1275149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021313	CTCGTT	2	12	1289465	1289476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021313	TGGCTG	2	12	1290016	1290027	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021313	TCGGTG	2	12	1338966	1338977	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021313	GACCGG	2	12	1339864	1339875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021313	CCTCTG	2	12	1357047	1357058	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021313	CGGAAG	2	12	1364869	1364880	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021313	GATCCA	2	12	1374648	1374659	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021313	GTCGAC	2	12	1424482	1424493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021313	CGAGCG	2	12	1442843	1442854	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021313	GTCGAG	2	12	1455900	1455911	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021313	GCCGGG	2	12	1460840	1460851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021313	CGCCAC	2	12	1475104	1475115	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021313	CACTTT	2	12	1526378	1526389	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021313	CTTCGG	2	12	1526651	1526662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021313	TCCAGA	2	12	1533294	1533305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021313	GCGACG	2	12	1624027	1624038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021313	GAAACG	2	12	1629911	1629922	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021313	GCGACG	2	12	1646354	1646365	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021313	CTGCCG	2	12	1646404	1646415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021313	GGGGCA	2	12	1659538	1659549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021313	AAGTGA	2	12	1727995	1728006	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021313	GACGGC	2	12	1730396	1730407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021313	CCGTCT	2	12	1738905	1738916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021313	CGCTCG	2	12	1764450	1764461	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021313	CGGACG	2	12	1788235	1788246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021313	GGATCG	2	12	1810068	1810079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021313	CGTGGA	2	12	1817105	1817116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021313	CTCGCG	2	12	1883398	1883409	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021313	GAGCGA	2	12	1902172	1902183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021313	GCTACG	2	12	1916701	1916712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021313	AACGAT	2	12	1954455	1954466	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021313	GAAACT	2	12	1962502	1962513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021313	ATCTCG	2	12	1962816	1962827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021313	AAATTA	2	12	1964237	1964248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021313	AGCGGC	2	12	1966937	1966948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021313	CGAGCG	2	12	1992999	1993010	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021313	CCGTCG	2	12	2012038	2012049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021313	CGGCGC	2	12	2020263	2020274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021313	CGGCGC	2	12	2020284	2020295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021313	GGGCTC	2	12	2058206	2058217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021313	CCGTCG	2	12	2122704	2122715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021313	TGCGGA	2	12	2128626	2128637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021313	TGGCTC	2	12	2130365	2130376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021313	TCGCCG	2	12	2146731	2146742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021313	AGGGCG	2	12	2182452	2182463	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021313	ATCGAG	2	12	2186015	2186026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021313	TTTCAC	2	12	2188368	2188379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021313	CACGCA	2	12	2220523	2220534	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021313	GTCGGC	2	12	2244318	2244329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021313	GCGTTC	2	12	2266256	2266267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021313	AGCGAC	2	12	2281111	2281122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021313	GTCGCT	2	12	2286417	2286428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021313	AGCGGG	2	12	2316521	2316532	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021313	CGACGG	2	12	2327532	2327543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021313	GACGCG	2	12	2329330	2329341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021313	TGCCGC	2	12	2347525	2347536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021313	CGCTAC	2	12	2407086	2407097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021313	TCCCCA	2	12	2450931	2450942	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021313	GCCGTC	2	12	2482365	2482376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021313	AGTGAC	2	12	2483371	2483382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021313	TTGAAT	2	12	2545695	2545706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021313	TGAGTC	2	12	2642027	2642038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021313	GGATGA	2	12	2642081	2642092	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021313	TCCGGA	2	12	2694691	2694702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021313	CTTCCT	2	12	2699674	2699685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021313	GAGGGG	2	12	2718156	2718167	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021313	GGGCTC	2	12	2764480	2764491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021313	AGAGGG	2	12	2855823	2855834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021313	TTTCAC	2	12	2858496	2858507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021313	GTCGGT	2	12	2860631	2860642	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021313	ATACCG	2	12	2893498	2893509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021313	TGCAAC	2	12	2965733	2965744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021313	TGGCGA	2	12	2966658	2966669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021313	ACCGCG	2	12	2975872	2975883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021313	CGTCAC	2	12	3021283	3021294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021313	GTGAGT	2	12	3040080	3040091	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021313	TCACTT	2	12	3083153	3083164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021313	CTCGAC	2	12	3085124	3085135	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021313	TGAATT	2	12	3100577	3100588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021313	TCGTCC	2	12	3127823	3127834	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021313	GAACCG	2	12	3128505	3128516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021313	GAGGCC	2	12	3151846	3151857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021313	TCGGCG	2	12	3202956	3202967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021313	CCTCGT	2	12	3222798	3222809	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.