MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 66646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021313	GCG	2	6	38	43	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021313	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021313	GCG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021313	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021313	GCG	2	6	238	243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021313	AGG	2	6	259	264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021313	CGT	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021313	TAC	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021313	GAG	2	6	506	511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880086
10	NC_021313	CTC	2	6	536	541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880086
11	NC_021313	GAC	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880086
12	NC_021313	CGA	2	6	633	638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880086
13	NC_021313	CCA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880086
14	NC_021313	GAG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880086
15	NC_021313	CGA	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880086
16	NC_021313	TGG	3	9	920	928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880087
17	NC_021313	CTC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880087
18	NC_021313	TCG	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880087
19	NC_021313	TGC	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880087
20	NC_021313	CGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021313	CGA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021313	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021313	CGT	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880088
24	NC_021313	ACG	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
25	NC_021313	ACG	2	6	1419	1424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
26	NC_021313	GTC	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880088
27	NC_021313	CGA	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
28	NC_021313	GGT	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880088
29	NC_021313	CGA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
30	NC_021313	GAC	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
31	NC_021313	GTA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880088
32	NC_021313	GAC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
33	NC_021313	TCC	2	6	2312	2317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880088
34	NC_021313	GAC	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880088
35	NC_021313	TCG	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880088
36	NC_021313	TCC	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880088
37	NC_021313	GAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880088
38	NC_021313	CGT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021313	GTA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021313	TCG	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021313	CGA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021313	TCG	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880089
43	NC_021313	CGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
44	NC_021313	AGG	2	6	2772	2777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880089
45	NC_021313	CGA	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
46	NC_021313	CGT	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880089
47	NC_021313	GTT	2	6	2836	2841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	510880089
48	NC_021313	GAG	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880089
49	NC_021313	CGC	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880089
50	NC_021313	CAG	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
51	NC_021313	CCG	2	6	3034	3039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880089
52	NC_021313	GGT	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880089
53	NC_021313	CGA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
54	NC_021313	CGA	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
55	NC_021313	CGA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
56	NC_021313	ACT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880089
57	NC_021313	CGA	2	6	3247	3252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
58	NC_021313	GTC	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880089
59	NC_021313	TCG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880089
60	NC_021313	GCC	2	6	3440	3445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880089
61	NC_021313	GAC	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880089
62	NC_021313	GAC	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021313	CCG	2	6	3571	3576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021313	AGC	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021313	GAC	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
66	NC_021313	TGG	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880090
67	NC_021313	TCG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880090
68	NC_021313	CGA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
69	NC_021313	CGC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880090
70	NC_021313	CGA	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
71	NC_021313	CGC	2	6	3903	3908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880090
72	NC_021313	TCC	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880090
73	NC_021313	GAC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
74	NC_021313	AGC	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
75	NC_021313	ACC	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880090
76	NC_021313	ACG	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
77	NC_021313	CGA	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
78	NC_021313	ACG	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
79	NC_021313	TCG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880090
80	NC_021313	TGC	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880090
81	NC_021313	ACG	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
82	NC_021313	GGT	2	6	4517	4522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880090
83	NC_021313	GTC	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880090
84	NC_021313	CGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
85	NC_021313	CGA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880090
86	NC_021313	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880091
87	NC_021313	TCC	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880091
88	NC_021313	CGT	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880091
89	NC_021313	CCT	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880091
90	NC_021313	CGA	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880091
91	NC_021313	CGT	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880091
92	NC_021313	TCG	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880091
93	NC_021313	GTC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880091
94	NC_021313	GAC	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880091
95	NC_021313	GTG	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880091
96	NC_021313	AGG	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880092
97	NC_021313	CCT	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880092
98	NC_021313	CGG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880092
99	NC_021313	CGC	2	6	5648	5653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880092
100	NC_021313	CTC	2	6	5700	5705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880092
101	NC_021313	GGA	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880092
102	NC_021313	GCG	2	6	5835	5840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021313	ATG	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880093
104	NC_021313	GGA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880093
105	NC_021313	CTA	2	6	5997	6002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880093
106	NC_021313	ACC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880093
107	NC_021313	CGA	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880093
108	NC_021313	TCC	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880093
109	NC_021313	CCA	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880093
110	NC_021313	CTC	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880093
111	NC_021313	ACG	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880093
112	NC_021313	CAC	2	6	6277	6282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880093
113	NC_021313	CGA	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880093
114	NC_021313	ACC	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880093
115	NC_021313	CGA	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880093
116	NC_021313	TCC	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880093
117	NC_021313	GTC	2	6	6517	6522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880093
118	NC_021313	GGA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880093
119	NC_021313	GGA	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880094
120	NC_021313	GGA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880094
121	NC_021313	TGG	2	6	6893	6898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880094
122	NC_021313	GAC	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880094
123	NC_021313	CTC	2	6	7012	7017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880094
124	NC_021313	GAG	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880094
125	NC_021313	CAT	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880094
126	NC_021313	GAG	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880094
127	NC_021313	GAC	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880094
128	NC_021313	GAG	2	6	7243	7248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880094
129	NC_021313	TCG	2	6	7262	7267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021313	CAG	2	6	7278	7283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021313	GAC	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
132	NC_021313	ACC	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880095
133	NC_021313	GAG	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880095
134	NC_021313	CGA	2	6	7782	7787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
135	NC_021313	GGC	2	6	7815	7820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880095
136	NC_021313	AGG	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880095
137	NC_021313	CGT	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880095
138	NC_021313	ACG	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
139	NC_021313	TCG	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880095
140	NC_021313	CGA	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
141	NC_021313	CAG	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
142	NC_021313	GAC	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880095
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152	NC_021313	TCG	2	6	8444	8449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880095
153	NC_021313	AAG	2	6	8482	8487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880095
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161	NC_021313	TCG	2	6	8797	8802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880096
162	NC_021313	GTC	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880096
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180	NC_021313	CGC	2	6	9736	9741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_021313	CAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	510880098
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379	NC_021313	CGC	2	6	19222	19227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
380	NC_021313	CTC	2	6	19277	19282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880105
381	NC_021313	AGC	2	6	19368	19373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880105
382	NC_021313	CGA	2	6	19378	19383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880105
383	NC_021313	GTC	2	6	19385	19390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880105
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400	NC_021313	GTC	2	6	19916	19921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_021313	GCG	2	6	22253	22258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_021313	GGC	2	6	22447	22452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_021313	GGT	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
456	NC_021313	CGT	2	6	22581	22586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880108
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491	NC_021313	CGA	2	6	24625	24630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880110
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497	NC_021313	CCT	2	6	25069	25074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
498	NC_021313	GAC	2	6	25161	25166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880111
499	NC_021313	GAG	2	6	25182	25187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880111
500	NC_021313	ACG	4	12	25201	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880111

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