MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	CGCGAG	2	12	9845	9856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021295	ACGCGT	2	12	10344	10355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507527072
3	NC_021295	TTTGGC	2	12	10443	10454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507527072
4	NC_021295	TCACGC	2	12	11343	11354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527073
5	NC_021295	GACCGC	2	12	21034	21045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507527083
6	NC_021295	CTGCGG	2	12	25624	25635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507527089
7	NC_021295	GCTGAA	2	12	27183	27194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507527093
8	NC_021295	TCGATG	2	12	31208	31219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507527100
9	NC_021295	ATCGTA	2	12	39667	39678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021295	CTGGTT	2	12	41110	41121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507527110
11	NC_021295	ATCGTC	2	12	42065	42076	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507527110
12	NC_021295	CCGGCC	2	12	46976	46987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527117
13	NC_021295	GCCTGC	2	12	50234	50245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507527122
14	NC_021295	GCAATG	2	12	52783	52794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507527123
15	NC_021295	TGCATC	2	12	56730	56741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021295	GCCCAT	2	12	57870	57881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527129
17	NC_021295	GCAGCC	2	12	58168	58179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507527129
18	NC_021295	TGTTCA	2	12	60524	60535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	507527130
19	NC_021295	ACGATC	2	12	62504	62515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507527133
20	NC_021295	GCGCGG	2	12	71390	71401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527143
21	NC_021295	CGGACG	2	12	81100	81111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021295	ATCTGG	2	12	85426	85437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507527155
23	NC_021295	ATGGGA	2	12	86913	86924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	507527155
24	NC_021295	CAGCTT	2	12	87309	87320	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021295	CCGGAC	2	12	95197	95208	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021295	AGCGTG	2	12	95729	95740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021295	GATGCC	2	12	99705	99716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021295	GCCGCG	2	12	104426	104437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021295	CGGTCG	2	12	106365	106376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021295	CTTCAG	2	12	106543	106554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021295	CACCGC	2	12	106564	106575	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021295	CCGCGC	2	12	110794	110805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021295	GCGCCC	2	12	111106	111117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021295	ATCACC	2	12	114144	114155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021295	CGCTGA	2	12	115409	115420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021295	CGTGGA	2	12	116022	116033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021295	CAAGGC	2	12	119149	119160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021295	CCGATG	2	12	121801	121812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021295	TCGACA	2	12	123000	123011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021295	GCATCG	2	12	123049	123060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021295	GATCTG	2	12	125076	125087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021295	TCTGAC	2	12	130009	130020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021295	ACGGCG	2	12	130475	130486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021295	CGCTGG	2	12	136740	136751	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021295	CCCGAA	2	12	150232	150243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021295	GATGCC	2	12	152307	152318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021295	CGCTGT	2	12	153295	153306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021295	AACACG	2	12	154178	154189	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021295	GGCCAG	2	12	155112	155123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021295	GCGTCG	2	12	158529	158540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021295	TTCACG	2	12	160441	160452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021295	CGCGAT	2	12	162211	162222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021295	GCTCGC	2	12	166529	166540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021295	TCATCG	2	12	167038	167049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021295	GCTTCC	2	12	168427	168438	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021295	CGCCTG	2	12	170021	170032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021295	TCGCCG	2	12	170115	170126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021295	TTCCAG	2	12	170399	170410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021295	CCCGGC	2	12	172266	172277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021295	ACGCTC	2	12	178958	178969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021295	TCAGAT	2	12	181359	181370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021295	TCGAAC	2	12	185428	185439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021295	GCGCCT	2	12	193206	193217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021295	CGAGCA	2	12	193777	193788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021295	CTGCGG	2	12	194012	194023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021295	CGGCAC	2	12	195680	195691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021295	GTCGAG	2	12	196094	196105	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021295	GCGAAC	2	12	198701	198712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021295	ACGCGC	2	12	198936	198947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021295	ATGACG	2	12	199169	199180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021295	GCGCGA	2	12	199350	199361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021295	TGCCGA	2	12	199485	199496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021295	GTCGAA	2	12	200369	200380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021295	CGGTAA	2	12	204054	204065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021295	GGACTC	2	12	208769	208780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021295	GCGGTC	2	12	209727	209738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021295	GATTCA	2	12	219062	219073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021295	ATCAGC	2	12	230243	230254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021295	TCCTCG	2	12	230849	230860	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021295	GCTCGC	2	12	231889	231900	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021295	CGCGTG	2	12	232893	232904	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021295	AAGCCG	2	12	234698	234709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021295	CGACCT	2	12	236308	236319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021295	ACCTTC	2	12	240896	240907	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021295	AGCGCC	2	12	242360	242371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021295	CAACAG	2	12	242524	242535	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021295	AGCACC	2	12	243250	243261	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021295	CGAACA	2	12	243305	243316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021295	GCCTCG	2	12	244809	244820	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021295	CACGAC	2	12	245063	245074	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021295	TCGCGA	2	12	247983	247994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021295	CCGCGC	2	12	248343	248354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021295	CACGCC	2	12	252760	252771	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021295	CGATGC	2	12	254185	254196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021295	CGATGG	2	12	255522	255533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021295	TCGCGC	2	12	261178	261189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021295	AAGTAG	2	12	261859	261870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021295	CGAACA	2	12	262490	262501	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021295	CGATGC	2	12	262903	262914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021295	TCGACA	2	12	264882	264893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021295	CGAGCG	2	12	268076	268087	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021295	CCAGAA	2	12	271325	271336	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021295	GTCTGG	2	12	274408	274419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021295	TACGCT	2	12	277096	277107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021295	CGTCAA	2	12	277377	277388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021295	TGCTGA	2	12	280789	280800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021295	GCGAGA	2	12	285685	285696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021295	TCGCGC	2	12	288112	288123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021295	AGCGAG	2	12	291869	291880	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021295	AGCGCA	2	12	295512	295523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021295	ACGATC	2	12	297669	297680	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021295	TGCATC	2	12	297869	297880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021295	GCGGGC	2	12	306323	306334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.