MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	ACGCGT	2	12	10344	10355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507527072
2	NC_021295	TTTGGC	2	12	10443	10454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507527072
3	NC_021295	TCACGC	2	12	11343	11354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527073
4	NC_021295	GACCGC	2	12	21034	21045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507527083
5	NC_021295	CTGCGG	2	12	25624	25635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507527089
6	NC_021295	GCTGAA	2	12	27183	27194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507527093
7	NC_021295	TCGATG	2	12	31208	31219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507527100
8	NC_021295	CTGGTT	2	12	41110	41121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507527110
9	NC_021295	ATCGTC	2	12	42065	42076	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507527110
10	NC_021295	CCGGCC	2	12	46976	46987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527117
11	NC_021295	GCCTGC	2	12	50234	50245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507527122
12	NC_021295	GCAATG	2	12	52783	52794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507527123
13	NC_021295	GCCCAT	2	12	57870	57881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527129
14	NC_021295	GCAGCC	2	12	58168	58179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507527129
15	NC_021295	TGTTCA	2	12	60524	60535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	507527130
16	NC_021295	ACGATC	2	12	62504	62515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507527133
17	NC_021295	GCGCGG	2	12	71390	71401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527143
18	NC_021295	ATCTGG	2	12	85426	85437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507527155
19	NC_021295	ATGGGA	2	12	86913	86924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	507527155

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.