MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	TGCGT	2	10	231	240	0 %	40 %	40 %	20 %	507527062
2	NC_021295	ATTTC	2	10	3055	3064	20 %	60 %	0 %	20 %	507527063
3	NC_021295	GGAGC	2	10	4225	4234	20 %	0 %	60 %	20 %	507527064
4	NC_021295	CAACG	2	10	7244	7253	40 %	0 %	20 %	40 %	507527068
5	NC_021295	AAGCC	2	10	7266	7275	40 %	0 %	20 %	40 %	507527068
6	NC_021295	GCGTG	2	10	7669	7678	0 %	20 %	60 %	20 %	507527070
7	NC_021295	CAGGC	2	10	10953	10962	20 %	0 %	40 %	40 %	507527073
8	NC_021295	GGCGA	2	10	13389	13398	20 %	0 %	60 %	20 %	507527075
9	NC_021295	GATCG	2	10	13594	13603	20 %	20 %	40 %	20 %	507527076
10	NC_021295	GCAGC	2	10	14026	14035	20 %	0 %	40 %	40 %	507527076
11	NC_021295	CGGCC	2	10	15263	15272	0 %	0 %	40 %	60 %	507527077
12	NC_021295	GTCCG	2	10	17620	17629	0 %	20 %	40 %	40 %	507527079
13	NC_021295	CAATG	2	10	21064	21073	40 %	20 %	20 %	20 %	507527083
14	NC_021295	GAGGC	2	10	21494	21503	20 %	0 %	60 %	20 %	507527083
15	NC_021295	TTCGC	2	10	23809	23818	0 %	40 %	20 %	40 %	507527085
16	NC_021295	GGCGG	2	10	24450	24459	0 %	0 %	80 %	20 %	507527086
17	NC_021295	CGATT	2	10	28394	28403	20 %	40 %	20 %	20 %	507527096
18	NC_021295	GCTTC	2	10	28561	28570	0 %	40 %	20 %	40 %	507527096
19	NC_021295	CGAGC	2	10	33133	33142	20 %	0 %	40 %	40 %	507527103
20	NC_021295	GCCCG	2	10	34888	34897	0 %	0 %	40 %	60 %	507527105
21	NC_021295	TCGAC	2	10	35434	35443	20 %	20 %	20 %	40 %	507527105
22	NC_021295	CTCGA	2	10	36753	36762	20 %	20 %	20 %	40 %	507527105
23	NC_021295	GTCGA	2	10	37995	38004	20 %	20 %	40 %	20 %	507527108
24	NC_021295	CCCGG	2	10	38628	38637	0 %	0 %	40 %	60 %	507527108
25	NC_021295	TTCTT	2	10	39344	39353	0 %	80 %	0 %	20 %	507527109
26	NC_021295	TCCCG	2	10	40426	40435	0 %	20 %	20 %	60 %	507527110
27	NC_021295	TACGA	2	10	41510	41519	40 %	20 %	20 %	20 %	507527110
28	NC_021295	CCCGG	2	10	45617	45626	0 %	0 %	40 %	60 %	507527115
29	NC_021295	AGGAG	2	10	48227	48236	40 %	0 %	60 %	0 %	507527118
30	NC_021295	GCGCC	2	10	50886	50895	0 %	0 %	40 %	60 %	507527122
31	NC_021295	GCCGA	2	10	52069	52078	20 %	0 %	40 %	40 %	507527123
32	NC_021295	GCCTG	2	10	54197	54206	0 %	20 %	40 %	40 %	507527124
33	NC_021295	TGGCG	2	10	57253	57262	0 %	20 %	60 %	20 %	507527128
34	NC_021295	GGGCC	2	10	57347	57356	0 %	0 %	60 %	40 %	507527128
35	NC_021295	TCGAA	2	10	57745	57754	40 %	20 %	20 %	20 %	507527129
36	NC_021295	GCGAT	2	10	59330	59339	20 %	20 %	40 %	20 %	507527130
37	NC_021295	GGTTG	2	10	60459	60468	0 %	40 %	60 %	0 %	507527130
38	NC_021295	GTCGG	2	10	60823	60832	0 %	20 %	60 %	20 %	507527130
39	NC_021295	GTCGA	2	10	61039	61048	20 %	20 %	40 %	20 %	507527131
40	NC_021295	CAGGC	2	10	63872	63881	20 %	0 %	40 %	40 %	507527134
41	NC_021295	GGTGT	2	10	65018	65027	0 %	40 %	60 %	0 %	507527135
42	NC_021295	TTCGA	2	10	66352	66361	20 %	40 %	20 %	20 %	507527136
43	NC_021295	GATCA	2	10	66773	66782	40 %	20 %	20 %	20 %	507527137
44	NC_021295	ATCCG	2	10	71549	71558	20 %	20 %	20 %	40 %	507527143
45	NC_021295	ATCAA	2	10	72283	72292	60 %	20 %	0 %	20 %	507527144
46	NC_021295	GATTC	2	10	72364	72373	20 %	40 %	20 %	20 %	507527144
47	NC_021295	GTCAC	2	10	74608	74617	20 %	20 %	20 %	40 %	507527148
48	NC_021295	ATGCA	2	10	76488	76497	40 %	20 %	20 %	20 %	507527149
49	NC_021295	TGACA	2	10	77177	77186	40 %	20 %	20 %	20 %	507527149
50	NC_021295	GCAGC	2	10	77284	77293	20 %	0 %	40 %	40 %	507527150
51	NC_021295	GGCCG	2	10	77547	77556	0 %	0 %	60 %	40 %	507527150
52	NC_021295	GGTCC	2	10	78831	78840	0 %	20 %	40 %	40 %	507527152
53	NC_021295	CTGGC	2	10	80241	80250	0 %	20 %	40 %	40 %	507527153
54	NC_021295	GTTTG	2	10	81713	81722	0 %	60 %	40 %	0 %	507527155
55	NC_021295	CTGGC	2	10	81765	81774	0 %	20 %	40 %	40 %	507527155
56	NC_021295	TGTCG	2	10	82490	82499	0 %	40 %	40 %	20 %	507527155
57	NC_021295	GCCCG	2	10	82887	82896	0 %	0 %	40 %	60 %	507527155
58	NC_021295	GCGAT	2	10	84987	84996	20 %	20 %	40 %	20 %	507527155
59	NC_021295	GCGTT	2	10	85025	85034	0 %	40 %	40 %	20 %	507527155

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.