MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 1042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	CCG	2	6	184	189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527062
2	NC_021295	GAC	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
3	NC_021295	GCG	2	6	306	311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527062
4	NC_021295	CCT	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527062
5	NC_021295	GAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527062
6	NC_021295	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
7	NC_021295	TCG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
8	NC_021295	GCA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
9	NC_021295	CGG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527062
10	NC_021295	GTT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527062
11	NC_021295	TCC	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527062
12	NC_021295	GTC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
13	NC_021295	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
14	NC_021295	AAG	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527063
15	NC_021295	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527063
16	NC_021295	CAG	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527063
17	NC_021295	GAC	3	9	2606	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527063
18	NC_021295	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527063
19	NC_021295	GGA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527063
20	NC_021295	GGC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527063
21	NC_021295	AGA	2	6	2881	2886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527063
22	NC_021295	CAT	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527063
23	NC_021295	GGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527063
24	NC_021295	TTC	2	6	3151	3156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527063
25	NC_021295	TGG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527063
26	NC_021295	TGA	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527063
27	NC_021295	GAT	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527064
28	NC_021295	GCG	2	6	3464	3469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
29	NC_021295	GCA	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527064
30	NC_021295	ATC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527064
31	NC_021295	GCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
32	NC_021295	GAT	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527064
33	NC_021295	CGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527064
34	NC_021295	TCG	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527064
35	NC_021295	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527064
36	NC_021295	GCG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
37	NC_021295	GTT	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527064
38	NC_021295	CAA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527064
39	NC_021295	GCG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
40	NC_021295	ACA	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527064
41	NC_021295	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527065
42	NC_021295	TCG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527065
43	NC_021295	ATG	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527066
44	NC_021295	CAC	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527066
45	NC_021295	GTT	2	6	6555	6560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527066
46	NC_021295	TCG	2	6	6594	6599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527066
47	NC_021295	AGC	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527066
48	NC_021295	CGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527066
49	NC_021295	ATC	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527067
50	NC_021295	ACG	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527067
51	NC_021295	CGC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527067
52	NC_021295	TGA	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527068
53	NC_021295	GCC	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527068
54	NC_021295	CGC	2	6	7463	7468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527070
55	NC_021295	GCA	2	6	7488	7493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527070
56	NC_021295	CGT	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527070
57	NC_021295	CCA	2	6	7564	7569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527070
58	NC_021295	TTC	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527070
59	NC_021295	TGA	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527070
60	NC_021295	TCT	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527070
61	NC_021295	TCG	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527070
62	NC_021295	CCA	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527070
63	NC_021295	GCG	2	6	7760	7765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527070
64	NC_021295	GCG	2	6	7800	7805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527070
65	NC_021295	CGC	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527070
66	NC_021295	AAC	2	6	7991	7996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527070
67	NC_021295	GGC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
68	NC_021295	GGC	2	6	8532	8537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
69	NC_021295	CCG	2	6	8573	8578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
70	NC_021295	TCG	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
71	NC_021295	GGT	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527071
72	NC_021295	CCG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
73	NC_021295	CCG	2	6	8813	8818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
74	NC_021295	ATC	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527071
75	NC_021295	GCG	2	6	8897	8902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
76	NC_021295	CCA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527071
77	NC_021295	TCG	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
78	NC_021295	GCA	2	6	9066	9071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
79	NC_021295	CGA	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
80	NC_021295	CGG	2	6	9096	9101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
81	NC_021295	GGT	2	6	9108	9113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527071
82	NC_021295	ACG	2	6	9128	9133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
83	NC_021295	CCA	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527071
84	NC_021295	TGA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527071
85	NC_021295	GAC	2	6	9543	9548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
86	NC_021295	CGC	2	6	9557	9562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
87	NC_021295	CTG	2	6	9601	9606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
88	NC_021295	ACG	2	6	9632	9637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
89	NC_021295	TCG	3	9	9877	9885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
90	NC_021295	CAT	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
91	NC_021295	ATG	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527072
92	NC_021295	CGT	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
93	NC_021295	CGC	2	6	10063	10068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527072
94	NC_021295	TGG	2	6	10072	10077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
95	NC_021295	CAT	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
96	NC_021295	CTT	2	6	10196	10201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527072
97	NC_021295	CAT	2	6	10301	10306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
98	NC_021295	CTG	2	6	10335	10340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
99	NC_021295	TCG	2	6	10363	10368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
100	NC_021295	GTG	2	6	10545	10550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
101	NC_021295	GTC	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
102	NC_021295	CCT	2	6	10594	10599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527072
103	NC_021295	GTG	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
104	NC_021295	CCT	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527072
105	NC_021295	TCG	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
106	NC_021295	CGG	2	6	10697	10702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527072
107	NC_021295	GCT	2	6	10703	10708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
108	NC_021295	CGA	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527072
109	NC_021295	TGC	2	6	10756	10761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
110	NC_021295	TGC	2	6	10872	10877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
111	NC_021295	GCT	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
112	NC_021295	CGC	2	6	10984	10989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527073
113	NC_021295	GGT	2	6	11110	11115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527073
114	NC_021295	CTG	2	6	11180	11185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
115	NC_021295	CAC	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527073
116	NC_021295	CGG	2	6	11218	11223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
117	NC_021295	CGA	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527073
118	NC_021295	CTA	2	6	11290	11295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527073
119	NC_021295	CGA	2	6	11454	11459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527073
120	NC_021295	CGT	2	6	11515	11520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
121	NC_021295	CGG	3	9	11538	11546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
122	NC_021295	CGG	2	6	11566	11571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
123	NC_021295	CGA	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527073
124	NC_021295	GCC	2	6	11603	11608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527073
125	NC_021295	GCT	2	6	11656	11661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
126	NC_021295	CGG	2	6	11796	11801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
127	NC_021295	CGG	2	6	11896	11901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
128	NC_021295	GCC	2	6	12005	12010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527073
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252	NC_021295	GGA	2	6	18978	18983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527080
253	NC_021295	CGA	3	9	19193	19201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527080
254	NC_021295	GGC	2	6	19203	19208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527080
255	NC_021295	TCG	2	6	19255	19260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527080
256	NC_021295	CGC	2	6	19292	19297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527080
257	NC_021295	CCG	2	6	19383	19388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527080
258	NC_021295	ACG	2	6	19639	19644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527080
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260	NC_021295	GAT	2	6	19748	19753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527080
261	NC_021295	GAC	2	6	19837	19842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527080
262	NC_021295	TGC	2	6	19903	19908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527081
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266	NC_021295	CGA	2	6	20174	20179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527081
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270	NC_021295	CGC	2	6	20491	20496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527081
271	NC_021295	CTT	2	6	20540	20545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527081
272	NC_021295	GGT	2	6	20595	20600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527081
273	NC_021295	GTT	2	6	20643	20648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527082
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275	NC_021295	CAT	2	6	20821	20826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527083
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277	NC_021295	GCC	3	9	20873	20881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527083
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281	NC_021295	CGG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
282	NC_021295	CGG	2	6	21193	21198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
283	NC_021295	TCG	2	6	21266	21271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527083
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285	NC_021295	CGG	2	6	21334	21339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
286	NC_021295	CGG	2	6	21348	21353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
287	NC_021295	GTG	2	6	21461	21466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527083
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374	NC_021295	CGC	2	6	29095	29100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527096
375	NC_021295	GGC	2	6	29149	29154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527097
376	NC_021295	CAT	2	6	29193	29198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527097
377	NC_021295	CGC	2	6	29269	29274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527097
378	NC_021295	GAT	2	6	29278	29283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527097
379	NC_021295	CGA	2	6	29340	29345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527097
380	NC_021295	ATC	2	6	29435	29440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527097
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383	NC_021295	AAT	2	6	29912	29917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507527098
384	NC_021295	CGA	2	6	30074	30079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527098
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395	NC_021295	CAT	2	6	31787	31792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527101
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401	NC_021295	TGA	2	6	32050	32055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527101
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403	NC_021295	CAT	2	6	32168	32173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527101
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412	NC_021295	ACG	2	6	32648	32653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527101
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490	NC_021295	TGG	2	6	39811	39816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527110
491	NC_021295	CAG	2	6	39858	39863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527110
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493	NC_021295	GGT	2	6	40010	40015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527110
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495	NC_021295	GGA	2	6	40105	40110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527110
496	NC_021295	TCG	3	9	40203	40211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527110
497	NC_021295	GCA	2	6	40222	40227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527110
498	NC_021295	CGA	2	6	40294	40299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527110
499	NC_021295	GGC	2	6	40349	40354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527110
500	NC_021295	GGC	2	6	40372	40377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527110

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