MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	CT	3	6	47	52	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
2	NC_021295	GC	4	8	319	326	0 %	0 %	50 %	50 %	507527062
3	NC_021295	TC	3	6	541	546	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
4	NC_021295	CT	3	6	1111	1116	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
5	NC_021295	TG	3	6	2701	2706	0 %	50 %	50 %	0 %	507527063
6	NC_021295	CG	3	6	2940	2945	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
7	NC_021295	GC	3	6	3277	3282	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
8	NC_021295	CG	3	6	3338	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
9	NC_021295	GC	3	6	3766	3771	0 %	0 %	50 %	50 %	507527064
10	NC_021295	CG	3	6	3862	3867	0 %	0 %	50 %	50 %	507527064
11	NC_021295	AC	3	6	7000	7005	50 %	0 %	0 %	50 %	507527067
12	NC_021295	CG	3	6	7304	7309	0 %	0 %	50 %	50 %	507527068
13	NC_021295	CG	3	6	7997	8002	0 %	0 %	50 %	50 %	507527070
14	NC_021295	GC	3	6	8783	8788	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
15	NC_021295	CG	3	6	9020	9025	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
16	NC_021295	CG	3	6	9515	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
17	NC_021295	GC	3	6	10402	10407	0 %	0 %	50 %	50 %	507527072
18	NC_021295	GC	3	6	11478	11483	0 %	0 %	50 %	50 %	507527073
19	NC_021295	CG	3	6	11870	11875	0 %	0 %	50 %	50 %	507527073
20	NC_021295	CT	3	6	12567	12572	0 %	50 %	0 %	50 %	507527074
21	NC_021295	TG	3	6	12740	12745	0 %	50 %	50 %	0 %	507527074
22	NC_021295	CG	3	6	13073	13078	0 %	0 %	50 %	50 %	507527075
23	NC_021295	GC	3	6	13178	13183	0 %	0 %	50 %	50 %	507527075
24	NC_021295	TC	3	6	13271	13276	0 %	50 %	0 %	50 %	507527075
25	NC_021295	GC	3	6	13516	13521	0 %	0 %	50 %	50 %	507527075
26	NC_021295	GC	3	6	13749	13754	0 %	0 %	50 %	50 %	507527076
27	NC_021295	CG	3	6	13766	13771	0 %	0 %	50 %	50 %	507527076
28	NC_021295	TC	3	6	13975	13980	0 %	50 %	0 %	50 %	507527076
29	NC_021295	GT	3	6	13983	13988	0 %	50 %	50 %	0 %	507527076
30	NC_021295	CG	3	6	14224	14229	0 %	0 %	50 %	50 %	507527076
31	NC_021295	GC	3	6	14498	14503	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
32	NC_021295	CG	3	6	14778	14783	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
33	NC_021295	GC	3	6	14902	14907	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
34	NC_021295	CG	4	8	15155	15162	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
35	NC_021295	GC	3	6	15251	15256	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
36	NC_021295	GC	3	6	15372	15377	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
37	NC_021295	CG	3	6	15537	15542	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
38	NC_021295	CG	3	6	15769	15774	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
39	NC_021295	CG	3	6	16362	16367	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
40	NC_021295	GC	3	6	16437	16442	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
41	NC_021295	CA	3	6	16750	16755	50 %	0 %	0 %	50 %	507527078
42	NC_021295	CG	3	6	16910	16915	0 %	0 %	50 %	50 %	507527078
43	NC_021295	CG	3	6	17030	17035	0 %	0 %	50 %	50 %	507527078
44	NC_021295	CG	3	6	17788	17793	0 %	0 %	50 %	50 %	507527079
45	NC_021295	GC	3	6	17872	17877	0 %	0 %	50 %	50 %	507527079
46	NC_021295	CG	5	10	18125	18134	0 %	0 %	50 %	50 %	507527079
47	NC_021295	GC	3	6	18870	18875	0 %	0 %	50 %	50 %	507527080
48	NC_021295	GC	3	6	19024	19029	0 %	0 %	50 %	50 %	507527080
49	NC_021295	CG	3	6	19159	19164	0 %	0 %	50 %	50 %	507527080
50	NC_021295	CG	3	6	20036	20041	0 %	0 %	50 %	50 %	507527081
51	NC_021295	GC	3	6	20248	20253	0 %	0 %	50 %	50 %	507527081
52	NC_021295	GC	3	6	20379	20384	0 %	0 %	50 %	50 %	507527081
53	NC_021295	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	507527082
54	NC_021295	GC	3	6	21142	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	507527083
55	NC_021295	GT	3	6	21420	21425	0 %	50 %	50 %	0 %	507527083
56	NC_021295	GA	3	6	21474	21479	50 %	0 %	50 %	0 %	507527083
57	NC_021295	CG	3	6	22701	22706	0 %	0 %	50 %	50 %	507527084
58	NC_021295	GA	3	6	22731	22736	50 %	0 %	50 %	0 %	507527084
59	NC_021295	CG	3	6	24369	24374	0 %	0 %	50 %	50 %	507527086
60	NC_021295	CT	3	6	24719	24724	0 %	50 %	0 %	50 %	507527087
61	NC_021295	CG	3	6	25641	25646	0 %	0 %	50 %	50 %	507527089
62	NC_021295	CG	3	6	26458	26463	0 %	0 %	50 %	50 %	507527090
63	NC_021295	CG	3	6	26654	26659	0 %	0 %	50 %	50 %	507527090
64	NC_021295	CG	3	6	26811	26816	0 %	0 %	50 %	50 %	507527091
65	NC_021295	TC	3	6	26938	26943	0 %	50 %	0 %	50 %	507527092
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67	NC_021295	GC	3	6	27682	27687	0 %	0 %	50 %	50 %	507527094
68	NC_021295	TC	3	6	28660	28665	0 %	50 %	0 %	50 %	507527096
69	NC_021295	GA	3	6	29701	29706	50 %	0 %	50 %	0 %	507527097
70	NC_021295	GT	3	6	29927	29932	0 %	50 %	50 %	0 %	507527098
71	NC_021295	CG	3	6	31095	31100	0 %	0 %	50 %	50 %	507527100
72	NC_021295	CG	3	6	32604	32609	0 %	0 %	50 %	50 %	507527101
73	NC_021295	TC	3	6	33424	33429	0 %	50 %	0 %	50 %	507527103
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77	NC_021295	TC	3	6	35068	35073	0 %	50 %	0 %	50 %	507527105
78	NC_021295	GC	4	8	35644	35651	0 %	0 %	50 %	50 %	507527105
79	NC_021295	GC	3	6	35851	35856	0 %	0 %	50 %	50 %	507527105
80	NC_021295	GC	3	6	35974	35979	0 %	0 %	50 %	50 %	507527105
81	NC_021295	GC	3	6	36078	36083	0 %	0 %	50 %	50 %	507527105
82	NC_021295	CT	3	6	36393	36398	0 %	50 %	0 %	50 %	507527105
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87	NC_021295	AG	3	6	37875	37880	50 %	0 %	50 %	0 %	507527108
88	NC_021295	GC	3	6	40127	40132	0 %	0 %	50 %	50 %	507527110
89	NC_021295	CG	3	6	40317	40322	0 %	0 %	50 %	50 %	507527110
90	NC_021295	GC	3	6	40436	40441	0 %	0 %	50 %	50 %	507527110
91	NC_021295	TC	3	6	40661	40666	0 %	50 %	0 %	50 %	507527110
92	NC_021295	GC	3	6	40989	40994	0 %	0 %	50 %	50 %	507527110
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95	NC_021295	GC	3	6	41603	41608	0 %	0 %	50 %	50 %	507527110
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102	NC_021295	CG	3	6	45781	45786	0 %	0 %	50 %	50 %	507527115
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107	NC_021295	GC	3	6	47851	47856	0 %	0 %	50 %	50 %	507527118
108	NC_021295	CG	3	6	48194	48199	0 %	0 %	50 %	50 %	507527118
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110	NC_021295	CG	3	6	49578	49583	0 %	0 %	50 %	50 %	507527122
111	NC_021295	CG	4	8	49809	49816	0 %	0 %	50 %	50 %	507527122
112	NC_021295	GC	3	6	50462	50467	0 %	0 %	50 %	50 %	507527122
113	NC_021295	GC	3	6	51929	51934	0 %	0 %	50 %	50 %	507527123
114	NC_021295	GC	3	6	53489	53494	0 %	0 %	50 %	50 %	507527123
115	NC_021295	CG	3	6	54474	54479	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
116	NC_021295	GC	3	6	54586	54591	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
117	NC_021295	CG	3	6	54604	54609	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
118	NC_021295	GC	4	8	54924	54931	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
119	NC_021295	CG	3	6	54937	54942	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
120	NC_021295	GC	3	6	54956	54961	0 %	0 %	50 %	50 %	507527124
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124	NC_021295	GC	3	6	56179	56184	0 %	0 %	50 %	50 %	507527126
125	NC_021295	CG	3	6	57116	57121	0 %	0 %	50 %	50 %	507527128
126	NC_021295	GC	3	6	57948	57953	0 %	0 %	50 %	50 %	507527129
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129	NC_021295	GC	3	6	59662	59667	0 %	0 %	50 %	50 %	507527130
130	NC_021295	GC	3	6	59757	59762	0 %	0 %	50 %	50 %	507527130
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133	NC_021295	GC	3	6	62142	62147	0 %	0 %	50 %	50 %	507527132
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142	NC_021295	GA	3	6	66249	66254	50 %	0 %	50 %	0 %	507527136
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.