MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiribacter salinus M19-40

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021291	CCAG	2	8	14	21	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021291	TAAA	2	8	1547	1554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021291	CAGA	2	8	1557	1564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021291	GCCT	2	8	1589	1596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021291	TTGA	2	8	10527	10534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021291	CCCA	2	8	12267	12274	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_021291	TGAC	2	8	63710	63717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021291	GCCC	2	8	64338	64345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_021291	TCGG	2	8	78076	78083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021291	ATCG	2	8	107463	107470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021291	GTCA	2	8	111294	111301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021291	CCGG	2	8	117805	117812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021291	CGGT	2	8	129681	129688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021291	CTTC	2	8	140039	140046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021291	TTCT	2	8	141498	141505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021291	GCTC	2	8	141518	141525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021291	GTTT	2	8	141582	141589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021291	TGCA	2	8	142176	142183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021291	ACTC	2	8	149209	149216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021291	TGCG	2	8	149685	149692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021291	GGGC	2	8	161468	161475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021291	GCCC	2	8	161480	161487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021291	AACG	2	8	169331	169338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021291	GATC	2	8	169712	169719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021291	GATG	2	8	170096	170103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021291	ATGA	2	8	170436	170443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021291	AGCC	2	8	173558	173565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021291	CCTG	2	8	178784	178791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021291	ACGG	2	8	188575	188582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021291	CGCA	2	8	248193	248200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021291	GCCA	2	8	286039	286046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021291	GATC	2	8	297439	297446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021291	AGTC	2	8	303869	303876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021291	AGCC	2	8	319811	319818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021291	CAAT	2	8	324662	324669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021291	GTCG	2	8	330589	330596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021291	GTTG	2	8	339589	339596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021291	AGGC	2	8	347863	347870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021291	GGGT	2	8	368445	368452	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021291	GCTT	2	8	368490	368497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021291	CCGC	2	8	378097	378104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_021291	AGCA	2	8	387249	387256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021291	TTGG	2	8	403850	403857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021291	CAAA	2	8	403890	403897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021291	GGAA	2	8	404434	404441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021291	GTTC	2	8	404678	404685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021291	TGCC	2	8	408433	408440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021291	CACC	2	8	410559	410566	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_021291	GGCT	2	8	410623	410630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021291	CCTA	2	8	412226	412233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021291	CCTG	2	8	416018	416025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021291	TGGG	2	8	416078	416085	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021291	AGTC	2	8	432558	432565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021291	CGTT	2	8	435340	435347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021291	TGAA	2	8	458932	458939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021291	CTGG	2	8	458981	458988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021291	TGCG	2	8	459034	459041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021291	AGGA	2	8	462587	462594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021291	GCGG	2	8	465615	465622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021291	TCGG	2	8	466115	466122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021291	CCTT	2	8	467860	467867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021291	TTCG	2	8	468405	468412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021291	CCGG	2	8	468582	468589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021291	ATCA	2	8	469243	469250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021291	GCAT	2	8	476368	476375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021291	TGAG	2	8	476422	476429	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021291	GACC	2	8	481205	481212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021291	ACCC	2	8	483938	483945	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_021291	CGCA	2	8	485986	485993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021291	GAAG	2	8	502611	502618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021291	AGAC	2	8	563131	563138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021291	GGCG	2	8	563606	563613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021291	TGAC	2	8	568571	568578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021291	GTTG	2	8	570076	570083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021291	CGGT	2	8	570158	570165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021291	CCCT	2	8	575462	575469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_021291	TGAA	2	8	584974	584981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021291	TGGG	2	8	600295	600302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021291	CCTC	2	8	611008	611015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_021291	GAAT	2	8	614260	614267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021291	GGCC	2	8	614682	614689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021291	GGGC	2	8	617884	617891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021291	TCCC	2	8	617942	617949	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_021291	ACTG	2	8	619134	619141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021291	TGGC	2	8	622992	622999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021291	CATT	2	8	628714	628721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021291	ACTC	2	8	659412	659419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021291	GAAG	2	8	666052	666059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021291	GACA	2	8	674876	674883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021291	ACGA	2	8	695901	695908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021291	TTTA	2	8	704458	704465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021291	CGAG	2	8	709684	709691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021291	GTTT	2	8	715360	715367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021291	ATTA	2	8	717801	717808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021291	CAAC	2	8	719598	719605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021291	TTGT	2	8	722304	722311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021291	GACT	2	8	722533	722540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021291	GATG	2	8	722980	722987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021291	TTTC	2	8	727176	727183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021291	CCTT	2	8	727184	727191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021291	GGGT	2	8	730091	730098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021291	CGTC	2	8	752336	752343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021291	GGTC	2	8	758350	758357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021291	GGCC	2	8	761279	761286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021291	AGGT	2	8	770332	770339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021291	TCGA	2	8	774568	774575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021291	GGAG	2	8	774668	774675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021291	CACC	2	8	784258	784265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_021291	TCGG	2	8	809464	809471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021291	GCCC	2	8	809482	809489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_021291	ATCC	2	8	818788	818795	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021291	GGAA	2	8	821874	821881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021291	GCGA	2	8	844256	844263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021291	GTGC	2	8	844420	844427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021291	GATC	2	8	863299	863306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021291	GAGG	2	8	876688	876695	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021291	GATT	2	8	876696	876703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021291	GAGG	2	8	876837	876844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021291	GGCC	2	8	901307	901314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021291	CCTG	2	8	929002	929009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021291	GCCG	2	8	929024	929031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021291	CTCG	2	8	937897	937904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021291	AATC	2	8	940800	940807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021291	TTGA	2	8	941373	941380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021291	GCTT	2	8	945324	945331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021291	GACT	2	8	960550	960557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021291	GGAT	2	8	975418	975425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021291	GGGC	2	8	983894	983901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021291	TGCC	2	8	986554	986561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021291	GGAG	2	8	987812	987819	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021291	TTAT	2	8	987869	987876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021291	TGAC	2	8	996809	996816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021291	GGCA	2	8	1003584	1003591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021291	TGGA	2	8	1004670	1004677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021291	CTGA	2	8	1021555	1021562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021291	TCGC	2	8	1030202	1030209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021291	CGTT	2	8	1065934	1065941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021291	CTGT	2	8	1081693	1081700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021291	GAGG	2	8	1081900	1081907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021291	AAGC	2	8	1095368	1095375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021291	GCCG	2	8	1100513	1100520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021291	CCGA	2	8	1101219	1101226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021291	GAGG	2	8	1103345	1103352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021291	GATT	2	8	1103353	1103360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021291	GAGG	2	8	1103524	1103531	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021291	GCCC	2	8	1103712	1103719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_021291	CCGC	2	8	1120532	1120539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_021291	GTCC	2	8	1134201	1134208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021291	GCCA	2	8	1150792	1150799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021291	GCAG	2	8	1150912	1150919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021291	GATT	2	8	1167549	1167556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021291	ACCT	2	8	1186798	1186805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021291	CGGG	2	8	1194109	1194116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_021291	GCCA	2	8	1229337	1229344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021291	TCCC	2	8	1252168	1252175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
156	NC_021291	CGAT	2	8	1252179	1252186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_021291	CCAC	2	8	1276041	1276048	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_021291	GCCC	2	8	1280971	1280978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_021291	TGTC	2	8	1286969	1286976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_021291	GATG	2	8	1290719	1290726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021291	CAGT	2	8	1306094	1306101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021291	GTTT	2	8	1358478	1358485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021291	TGGC	2	8	1367999	1368006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_021291	GCCG	2	8	1375518	1375525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_021291	CGTT	2	8	1386427	1386434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_021291	CACC	2	8	1386891	1386898	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_021291	CCCA	2	8	1388046	1388053	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
168	NC_021291	GAAA	2	8	1416718	1416725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021291	TCAT	2	8	1416766	1416773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_021291	CTGC	2	8	1424069	1424076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_021291	CTGG	2	8	1458000	1458007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_021291	CCGG	2	8	1498517	1498524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_021291	GATC	2	8	1498556	1498563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_021291	AAAC	2	8	1510631	1510638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_021291	AACG	2	8	1527182	1527189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
176	NC_021291	GCCG	2	8	1535702	1535709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_021291	GACC	2	8	1539234	1539241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
178	NC_021291	CCTC	2	8	1541003	1541010	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
179	NC_021291	CCAA	2	8	1545392	1545399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_021291	GGTA	2	8	1545492	1545499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021291	TCCC	2	8	1551468	1551475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
182	NC_021291	CTCC	2	8	1555104	1555111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
183	NC_021291	TTCC	2	8	1576614	1576621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_021291	GCCT	2	8	1577605	1577612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_021291	TCCG	2	8	1577617	1577624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_021291	CTTT	2	8	1578262	1578269	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_021291	CTGT	2	8	1578302	1578309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
188	NC_021291	GTCT	2	8	1578405	1578412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_021291	AAGT	2	8	1578759	1578766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_021291	TCGC	2	8	1579084	1579091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
191	NC_021291	CTTT	2	8	1579749	1579756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_021291	CCGA	2	8	1580157	1580164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_021291	CAAT	2	8	1593188	1593195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_021291	TCCT	2	8	1600005	1600012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
195	NC_021291	ACGC	2	8	1602078	1602085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
196	NC_021291	CCTG	2	8	1613752	1613759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_021291	GAAT	2	8	1616897	1616904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021291	TTGA	2	8	1628145	1628152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021291	CTCC	2	8	1636728	1636735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
200	NC_021291	CTTA	2	8	1640258	1640265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
201	NC_021291	CGGG	2	8	1665223	1665230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
202	NC_021291	GGAC	2	8	1667642	1667649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
203	NC_021291	ATTC	2	8	1683066	1683073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
204	NC_021291	TTTC	2	8	1688217	1688224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
205	NC_021291	AGGG	2	8	1704317	1704324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
206	NC_021291	CTCG	2	8	1713943	1713950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
207	NC_021291	TCAA	2	8	1715763	1715770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
208	NC_021291	TTGG	2	8	1726318	1726325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
209	NC_021291	CAGC	2	8	1739422	1739429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.