MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas hydrophila ML09-119

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021290	AAATAA	2	12	33277	33288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021290	GTTGCC	2	12	46979	46990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021290	GGTATC	2	12	65147	65158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021290	GAAAAG	2	12	247936	247947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021290	GATTAA	2	12	265986	265997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021290	ACTTTC	2	12	308175	308186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021290	ATAGAG	2	12	309441	309452	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021290	TGATCC	2	12	319551	319562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021290	CCCGCT	2	12	340561	340572	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021290	ATCCAT	2	12	383526	383537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021290	GCTCAA	2	12	536528	536539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021290	CCCAGA	2	12	540585	540596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021290	GGTCGG	2	12	614963	614974	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021290	AGCCGG	2	12	646347	646358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021290	TTGAAA	2	12	754237	754248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021290	GCAGGA	2	12	888190	888201	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021290	CCTCTT	2	12	910796	910807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021290	GAGCGG	2	12	916162	916173	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021290	GAGGGG	2	12	917811	917822	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021290	AGCATG	2	12	1005051	1005062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021290	TGCCTG	2	12	1019683	1019694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021290	TATGCC	2	12	1087051	1087062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021290	GACAGG	2	12	1094126	1094137	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021290	GGGTCG	2	12	1100995	1101006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021290	TGATAG	2	12	1110764	1110775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021290	TGTATT	2	12	1232676	1232687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021290	AGGGAG	2	12	1278068	1278079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021290	AGAGGG	2	12	1291465	1291476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021290	TTCAGT	2	12	1307552	1307563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021290	TTTTCC	2	12	1393567	1393578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021290	TATTGA	2	12	1556283	1556294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021290	ATACGC	2	12	1556806	1556817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021290	ATTGAC	2	12	1582368	1582379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021290	CCTGAA	2	12	1610047	1610058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021290	TTGAGA	2	12	1659377	1659388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021290	CCGCTG	2	12	1687655	1687666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021290	TTTGTC	2	12	1697603	1697614	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021290	AGGGTG	2	12	1697638	1697649	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021290	GGAGAG	2	12	1700458	1700469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021290	GATCAG	2	12	1719813	1719824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021290	TGAAAA	2	12	1736048	1736059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021290	GCATTT	2	12	1759014	1759025	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021290	ATCTGA	2	12	1760905	1760916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021290	CAGATC	2	12	1765264	1765275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021290	GGCGGG	2	12	1774087	1774098	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021290	TGTTTT	2	12	1873432	1873443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021290	ATTCCC	2	12	1905501	1905512	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021290	TTTGCA	2	12	2004828	2004839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021290	ATCATT	2	12	2015870	2015881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021290	GAGATA	2	12	2028967	2028978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021290	CTTTTT	2	12	2073770	2073781	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021290	AAGCGT	2	12	2119154	2119165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021290	GGATGG	2	12	2172949	2172960	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021290	TAAAAT	2	12	2207661	2207672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021290	CAGGGC	2	12	2285525	2285536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021290	AGTGAA	2	12	2289849	2289860	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021290	AGATGA	2	12	2292928	2292939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021290	GCATTG	2	12	2298742	2298753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021290	CGTGAC	2	12	2299866	2299877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021290	TTACGT	2	12	2389488	2389499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021290	TTAATG	2	12	2395121	2395132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021290	ATGGCA	2	12	2417673	2417684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021290	ACAGTC	2	12	2474262	2474273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021290	GCTTTT	2	12	2478955	2478966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021290	GTGATG	2	12	2566391	2566402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021290	GTCGGG	2	12	2578403	2578414	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021290	GCAAGG	2	12	2598736	2598747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021290	GCCGGC	2	12	2604387	2604398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021290	CAACCA	2	12	2666926	2666937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021290	GATATA	2	12	2692533	2692544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021290	CTTTTT	2	12	2699052	2699063	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021290	CATTAT	2	12	2732090	2732101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021290	CCAGGC	2	12	2750546	2750557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021290	AATAAC	2	12	2761301	2761312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021290	CGCTGG	2	12	2841708	2841719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021290	GCTGGC	2	12	2841940	2841951	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021290	TGAAGG	2	12	2842734	2842745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021290	CTCTCC	2	12	2846073	2846084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021290	GCCGGC	2	12	2871384	2871395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021290	AAATCA	2	12	2892709	2892720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021290	TGAAAC	2	12	2898308	2898319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021290	ACAAAA	2	12	2906444	2906455	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021290	TGTGCC	2	12	2910072	2910083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021290	TATGAA	2	12	2912214	2912225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021290	GCCCCC	2	12	2915362	2915373	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_021290	CACAAA	2	12	2937992	2938003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021290	AATGAT	2	12	2954618	2954629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021290	CTCCTT	2	12	2963858	2963869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021290	GCTGAC	2	12	2968047	2968058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021290	CCCCAT	2	12	2971981	2971992	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021290	AAATTT	2	12	2976232	2976243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021290	TTCAAT	2	12	3026011	3026022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021290	GGATAT	2	12	3029022	3029033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021290	GGTTTT	2	12	3029187	3029198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021290	ATTTTG	2	12	3030153	3030164	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021290	AAAGAA	2	12	3036524	3036535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021290	CTGCCA	2	12	3037863	3037874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021290	TGTTTT	2	12	3057364	3057375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021290	AGGCAG	2	12	3074458	3074469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021290	TCCAGT	2	12	3078140	3078151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021290	CACAGC	2	12	3085255	3085266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021290	ATAACA	2	12	3114039	3114050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021290	GGCAGG	2	12	3154627	3154638	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021290	CAAGGC	2	12	3171953	3171964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021290	TTTTTA	2	12	3217719	3217730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021290	CAAAAA	2	12	3245390	3245401	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021290	GGCCAG	2	12	3262280	3262291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021290	CTGGCC	2	12	3270083	3270094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021290	CTGCAG	2	12	3316013	3316024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021290	GGTTGC	2	12	3318326	3318337	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021290	GATATA	2	12	3320761	3320772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021290	CAAAAA	2	12	3321948	3321959	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021290	AACCAG	2	12	3341090	3341101	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021290	ATTAAA	2	12	3371551	3371562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021290	TGCAGG	2	12	3383905	3383916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021290	ACAATA	2	12	3387139	3387150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021290	ATATAG	2	12	3388308	3388319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021290	ACCCTC	2	12	3393668	3393679	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021290	AGGAGA	2	12	3399748	3399759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021290	ATCAAA	2	12	3476449	3476460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021290	TGCCAT	2	12	3489652	3489663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021290	CTTTGT	2	12	3501211	3501222	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021290	TGAAAA	2	12	3519170	3519181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021290	TTTTTC	2	12	3576054	3576065	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021290	TGGCCT	2	12	3585162	3585173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021290	TTGCCC	2	12	3601930	3601941	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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128	NC_021290	ACCTTG	2	12	3615009	3615020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_021290	CCCGGC	2	12	3879529	3879540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.