MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021289	CGCCA	2	10	1579	1588	20 %	0 %	20 %	60 %	507518297
2	NC_021289	CCGTC	2	10	3088	3097	0 %	20 %	20 %	60 %	507518298
3	NC_021289	CAAGG	2	10	4298	4307	40 %	0 %	40 %	20 %	507518299
4	NC_021289	AGTCG	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	507518299
5	NC_021289	GCGAA	2	10	6036	6045	40 %	0 %	40 %	20 %	507518299
6	NC_021289	GCCGT	2	10	12116	12125	0 %	20 %	40 %	40 %	507518306
7	NC_021289	CGACG	2	10	12890	12899	20 %	0 %	40 %	40 %	507518307
8	NC_021289	ATTCG	2	10	14294	14303	20 %	40 %	20 %	20 %	507518307
9	NC_021289	ACGGC	2	10	16330	16339	20 %	0 %	40 %	40 %	507518309
10	NC_021289	CGGCG	2	10	16988	16997	0 %	0 %	60 %	40 %	507518310
11	NC_021289	GCGAA	2	10	17374	17383	40 %	0 %	40 %	20 %	507518310
12	NC_021289	TTCCG	2	10	19764	19773	0 %	40 %	20 %	40 %	507518312
13	NC_021289	TGCGC	2	10	20419	20428	0 %	20 %	40 %	40 %	507518313
14	NC_021289	GCGCC	2	10	20851	20860	0 %	0 %	40 %	60 %	507518314
15	NC_021289	TGGTG	2	10	21184	21193	0 %	40 %	60 %	0 %	507518314
16	NC_021289	GCGAG	2	10	23781	23790	20 %	0 %	60 %	20 %	507518319
17	NC_021289	AAAGC	2	10	25746	25755	60 %	0 %	20 %	20 %	507518321
18	NC_021289	GAAGC	2	10	26525	26534	40 %	0 %	40 %	20 %	507518322
19	NC_021289	GGCGA	2	10	27217	27226	20 %	0 %	60 %	20 %	507518323
20	NC_021289	GCGCG	2	10	29412	29421	0 %	0 %	60 %	40 %	507518325
21	NC_021289	CGCGA	2	10	33066	33075	20 %	0 %	40 %	40 %	507518330
22	NC_021289	GGCGC	2	10	34514	34523	0 %	0 %	60 %	40 %	507518332
23	NC_021289	GGCGC	2	10	34558	34567	0 %	0 %	60 %	40 %	507518332
24	NC_021289	CGATG	2	10	34801	34810	20 %	20 %	40 %	20 %	507518332
25	NC_021289	CACGG	2	10	35334	35343	20 %	0 %	40 %	40 %	507518333
26	NC_021289	GCCGC	2	10	35485	35494	0 %	0 %	40 %	60 %	507518334
27	NC_021289	CGCGC	2	10	35736	35745	0 %	0 %	40 %	60 %	507518334
28	NC_021289	CGGCG	2	10	36801	36810	0 %	0 %	60 %	40 %	507518335
29	NC_021289	GGCGC	2	10	36859	36868	0 %	0 %	60 %	40 %	507518335
30	NC_021289	GCAGC	2	10	37209	37218	20 %	0 %	40 %	40 %	507518335
31	NC_021289	CGGCG	2	10	37845	37854	0 %	0 %	60 %	40 %	507518335
32	NC_021289	TCACG	2	10	41661	41670	20 %	20 %	20 %	40 %	507518338
33	NC_021289	CGGCT	2	10	41731	41740	0 %	20 %	40 %	40 %	507518338
34	NC_021289	TCCCG	2	10	42090	42099	0 %	20 %	20 %	60 %	507518338
35	NC_021289	CGCGC	2	10	42450	42459	0 %	0 %	40 %	60 %	507518339
36	NC_021289	TGCGC	2	10	42497	42506	0 %	20 %	40 %	40 %	507518339
37	NC_021289	GCGCG	2	10	42666	42675	0 %	0 %	60 %	40 %	507518339
38	NC_021289	GCGCG	2	10	42702	42711	0 %	0 %	60 %	40 %	507518339
39	NC_021289	GCCGC	3	15	46803	46817	0 %	0 %	40 %	60 %	507518343
40	NC_021289	AGCGC	2	10	47503	47512	20 %	0 %	40 %	40 %	507518344
41	NC_021289	GCGAC	2	10	48582	48591	20 %	0 %	40 %	40 %	507518345
42	NC_021289	GCGCC	2	10	51890	51899	0 %	0 %	40 %	60 %	507518348
43	NC_021289	ACCGG	2	10	52210	52219	20 %	0 %	40 %	40 %	507518349
44	NC_021289	GCGCA	2	10	52873	52882	20 %	0 %	40 %	40 %	507518349
45	NC_021289	CCGCA	2	10	54357	54366	20 %	0 %	20 %	60 %	507518352
46	NC_021289	CACGC	2	10	57036	57045	20 %	0 %	20 %	60 %	507518357
47	NC_021289	ACGCC	2	10	57598	57607	20 %	0 %	20 %	60 %	507518358
48	NC_021289	CCGGC	2	10	59569	59578	0 %	0 %	40 %	60 %	507518360
49	NC_021289	TGCGC	2	10	59939	59948	0 %	20 %	40 %	40 %	507518360
50	NC_021289	GATCT	2	10	60497	60506	20 %	40 %	20 %	20 %	507518361
51	NC_021289	TCGGC	2	10	60708	60717	0 %	20 %	40 %	40 %	507518361
52	NC_021289	CTGCG	2	10	61958	61967	0 %	20 %	40 %	40 %	507518362
53	NC_021289	ACTGC	2	10	61983	61992	20 %	20 %	20 %	40 %	507518362
54	NC_021289	TCGGC	2	10	62344	62353	0 %	20 %	40 %	40 %	507518362
55	NC_021289	GGTCG	2	10	64168	64177	0 %	20 %	60 %	20 %	507518365
56	NC_021289	GCGCC	2	10	66536	66545	0 %	0 %	40 %	60 %	507518367
57	NC_021289	GCGCG	2	10	69328	69337	0 %	0 %	60 %	40 %	507518368
58	NC_021289	TGCGC	2	10	71585	71594	0 %	20 %	40 %	40 %	507518371
59	NC_021289	CGCGC	2	10	74337	74346	0 %	0 %	40 %	60 %	507518374
60	NC_021289	CGGTC	2	10	76307	76316	0 %	20 %	40 %	40 %	507518375
61	NC_021289	CTGAA	2	10	76586	76595	40 %	20 %	20 %	20 %	507518375
62	NC_021289	AGCCG	2	10	77654	77663	20 %	0 %	40 %	40 %	507518376
63	NC_021289	ATTCG	2	10	79631	79640	20 %	40 %	20 %	20 %	507518378
64	NC_021289	GGCTC	2	10	79753	79762	0 %	20 %	40 %	40 %	507518378
65	NC_021289	CGAGC	2	10	81181	81190	20 %	0 %	40 %	40 %	507518379
66	NC_021289	GCTTC	2	10	82887	82896	0 %	40 %	20 %	40 %	507518380
67	NC_021289	CTTGC	2	10	82960	82969	0 %	40 %	20 %	40 %	507518380
68	NC_021289	GCCGC	3	15	83502	83516	0 %	0 %	40 %	60 %	507518381
69	NC_021289	CGACA	2	10	84460	84469	40 %	0 %	20 %	40 %	507518382
70	NC_021289	GTTCG	2	10	86364	86373	0 %	40 %	40 %	20 %	507518384
71	NC_021289	CGGCG	2	10	86565	86574	0 %	0 %	60 %	40 %	507518384
72	NC_021289	CCGAG	2	10	87522	87531	20 %	0 %	40 %	40 %	507518386
73	NC_021289	GAATT	2	10	87543	87552	40 %	40 %	20 %	0 %	507518386
74	NC_021289	GCGCG	2	10	89143	89152	0 %	0 %	60 %	40 %	507518388
75	NC_021289	ATCGC	2	10	93245	93254	20 %	20 %	20 %	40 %	507518391
76	NC_021289	ATCAA	2	10	95324	95333	60 %	20 %	0 %	20 %	507518392
77	NC_021289	GCCGC	2	10	95465	95474	0 %	0 %	40 %	60 %	507518392
78	NC_021289	ATGCC	2	10	97264	97273	20 %	20 %	20 %	40 %	507518393
79	NC_021289	TGCCG	2	10	97294	97303	0 %	20 %	40 %	40 %	507518393
80	NC_021289	GCCAA	2	10	102384	102393	40 %	0 %	20 %	40 %	507518397
81	NC_021289	GCATG	2	10	104271	104280	20 %	20 %	40 %	20 %	507518399
82	NC_021289	ACGAC	2	10	105863	105872	40 %	0 %	20 %	40 %	507518400
83	NC_021289	CATCA	2	10	107826	107835	40 %	20 %	0 %	40 %	507518402
84	NC_021289	TGAAG	2	10	107903	107912	40 %	20 %	40 %	0 %	507518402
85	NC_021289	CAGGG	2	10	108442	108451	20 %	0 %	60 %	20 %	507518402
86	NC_021289	AACTG	2	10	109017	109026	40 %	20 %	20 %	20 %	507518403
87	NC_021289	CGCGC	2	10	110411	110420	0 %	0 %	40 %	60 %	507518405
88	NC_021289	ATTCG	2	10	110542	110551	20 %	40 %	20 %	20 %	507518405
89	NC_021289	GATGT	2	10	110828	110837	20 %	40 %	40 %	0 %	507518405
90	NC_021289	GCAAT	2	10	111628	111637	40 %	20 %	20 %	20 %	507518406
91	NC_021289	AACGC	2	10	113735	113744	40 %	0 %	20 %	40 %	507518410
92	NC_021289	CGATG	2	10	114141	114150	20 %	20 %	40 %	20 %	507518410
93	NC_021289	CGATG	2	10	117903	117912	20 %	20 %	40 %	20 %	507518414
94	NC_021289	CGAGC	2	10	118302	118311	20 %	0 %	40 %	40 %	507518414
95	NC_021289	GACGC	2	10	120523	120532	20 %	0 %	40 %	40 %	507518415
96	NC_021289	GATCT	2	10	120892	120901	20 %	40 %	20 %	20 %	507518415
97	NC_021289	GACAT	2	10	121177	121186	40 %	20 %	20 %	20 %	507518416
98	NC_021289	GCCGC	2	10	121545	121554	0 %	0 %	40 %	60 %	507518416
99	NC_021289	CGGCG	2	10	122823	122832	0 %	0 %	60 %	40 %	507518418
100	NC_021289	CGCGA	2	10	123127	123136	20 %	0 %	40 %	40 %	507518418
101	NC_021289	TTCGA	2	10	124143	124152	20 %	40 %	20 %	20 %	507518419
102	NC_021289	GCATC	2	10	125194	125203	20 %	20 %	20 %	40 %	507518420
103	NC_021289	GCCGC	2	10	126630	126639	0 %	0 %	40 %	60 %	507518422
104	NC_021289	GCCTC	2	10	127703	127712	0 %	20 %	20 %	60 %	507518423
105	NC_021289	CGCGA	2	10	130594	130603	20 %	0 %	40 %	40 %	507518425
106	NC_021289	TGCGA	2	10	130799	130808	20 %	20 %	40 %	20 %	507518425
107	NC_021289	CGAGA	2	10	131555	131564	40 %	0 %	40 %	20 %	507518426
108	NC_021289	GCGAC	2	10	131944	131953	20 %	0 %	40 %	40 %	507518426
109	NC_021289	CGCGA	2	10	134015	134024	20 %	0 %	40 %	40 %	507518429
110	NC_021289	TCGAC	2	10	134164	134173	20 %	20 %	20 %	40 %	507518429
111	NC_021289	GGCGC	2	10	136319	136328	0 %	0 %	60 %	40 %	507518431
112	NC_021289	CGACG	2	10	136808	136817	20 %	0 %	40 %	40 %	507518431
113	NC_021289	TCGTC	2	10	137919	137928	0 %	40 %	20 %	40 %	507518434
114	NC_021289	CGCGG	2	10	138197	138206	0 %	0 %	60 %	40 %	507518434
115	NC_021289	TCGAT	2	10	142545	142554	20 %	40 %	20 %	20 %	507518437
116	NC_021289	ACGCG	2	10	145135	145144	20 %	0 %	40 %	40 %	507518439
117	NC_021289	CGCGC	2	10	147974	147983	0 %	0 %	40 %	60 %	507518443
118	NC_021289	GACAG	2	10	149657	149666	40 %	0 %	40 %	20 %	507518445
119	NC_021289	CGCGC	2	10	151357	151366	0 %	0 %	40 %	60 %	507518448
120	NC_021289	TTCGA	2	10	155273	155282	20 %	40 %	20 %	20 %	507518451
121	NC_021289	GTTCG	2	10	155455	155464	0 %	40 %	40 %	20 %	507518451
122	NC_021289	CGGCT	2	10	158562	158571	0 %	20 %	40 %	40 %	507518456
123	NC_021289	TCGGC	2	10	159118	159127	0 %	20 %	40 %	40 %	507518456
124	NC_021289	GCTTC	2	10	159282	159291	0 %	40 %	20 %	40 %	507518457
125	NC_021289	GCAAG	2	10	161061	161070	40 %	0 %	40 %	20 %	507518458
126	NC_021289	GCGCC	2	10	161814	161823	0 %	0 %	40 %	60 %	507518459
127	NC_021289	TGGCC	2	10	162194	162203	0 %	20 %	40 %	40 %	507518459
128	NC_021289	GCCGT	2	10	162869	162878	0 %	20 %	40 %	40 %	507518460
129	NC_021289	CCGCG	2	10	163826	163835	0 %	0 %	40 %	60 %	507518461
130	NC_021289	CGAGC	2	10	165977	165986	20 %	0 %	40 %	40 %	507518462
131	NC_021289	TCCAC	2	10	169442	169451	20 %	20 %	0 %	60 %	507518464
132	NC_021289	TCGCG	2	10	170603	170612	0 %	20 %	40 %	40 %	507518466
133	NC_021289	GCGCT	2	10	171511	171520	0 %	20 %	40 %	40 %	507518467
134	NC_021289	CGCGC	2	10	172749	172758	0 %	0 %	40 %	60 %	507518468
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247	NC_021289	GTCGA	2	10	310559	310568	20 %	20 %	40 %	20 %	507518590
248	NC_021289	CGGTG	2	10	314113	314122	0 %	20 %	60 %	20 %	507518592
249	NC_021289	CGCGA	2	10	314723	314732	20 %	0 %	40 %	40 %	507518592
250	NC_021289	CGCAC	2	10	315802	315811	20 %	0 %	20 %	60 %	507518594
251	NC_021289	CGTGA	2	10	317653	317662	20 %	20 %	40 %	20 %	507518595
252	NC_021289	GCGCC	2	10	321840	321849	0 %	0 %	40 %	60 %	507518601
253	NC_021289	CGCTG	2	10	321873	321882	0 %	20 %	40 %	40 %	507518601
254	NC_021289	CACGC	2	10	322915	322924	20 %	0 %	20 %	60 %	507518602
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257	NC_021289	CCGGA	2	10	326578	326587	20 %	0 %	40 %	40 %	507518605
258	NC_021289	CGATG	2	10	327907	327916	20 %	20 %	40 %	20 %	507518606
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260	NC_021289	CGCGC	2	10	328820	328829	0 %	0 %	40 %	60 %	507518607
261	NC_021289	GCGCG	2	10	330077	330086	0 %	0 %	60 %	40 %	507518610
262	NC_021289	CGGCG	2	10	331246	331255	0 %	0 %	60 %	40 %	507518610
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