MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 21724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021289	TTC	2	6	27	32	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021289	GAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021289	GCC	2	6	167	172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
4	NC_021289	AGC	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
5	NC_021289	ACC	2	6	305	310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518296
6	NC_021289	CCG	2	6	324	329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
7	NC_021289	GAC	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
8	NC_021289	GCT	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
9	NC_021289	GCC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
10	NC_021289	GCT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
11	NC_021289	CGT	3	9	702	710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
12	NC_021289	CGT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
13	NC_021289	CGA	2	6	808	813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
14	NC_021289	ACG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
15	NC_021289	ATC	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518296
16	NC_021289	CGC	2	6	837	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
17	NC_021289	CTG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
18	NC_021289	CTG	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
19	NC_021289	GAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518296
20	NC_021289	CGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
21	NC_021289	TGC	2	6	1095	1100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
22	NC_021289	GCA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
23	NC_021289	CTC	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021289	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021289	GAA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
26	NC_021289	ATC	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518297
27	NC_021289	CGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518297
28	NC_021289	GAA	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
29	NC_021289	TTC	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518297
30	NC_021289	CTG	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518297
31	NC_021289	AGC	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518297
32	NC_021289	GCG	2	6	1958	1963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518297
33	NC_021289	CGC	2	6	2006	2011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518297
34	NC_021289	CGA	3	9	2017	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518297
35	NC_021289	TGT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518297
36	NC_021289	GAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
37	NC_021289	CGT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518297
38	NC_021289	TCA	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518297
39	NC_021289	TAG	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021289	CGC	2	6	2298	2303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021289	TAG	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021289	GAA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021289	CAA	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021289	CTG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021289	TCC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021289	CGC	2	6	2635	2640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
47	NC_021289	GCT	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
48	NC_021289	CGC	2	6	2810	2815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
49	NC_021289	TCA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
50	NC_021289	GCC	2	6	3015	3020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
51	NC_021289	CGA	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
52	NC_021289	TCA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
53	NC_021289	CTG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
54	NC_021289	CTT	2	6	3258	3263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518298
55	NC_021289	GTC	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
56	NC_021289	GAG	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518298
57	NC_021289	CGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
58	NC_021289	TCA	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
59	NC_021289	GAA	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518298
60	NC_021289	GCC	2	6	3620	3625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
61	NC_021289	TTC	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518298
62	NC_021289	GTT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518298
63	NC_021289	AGC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
64	NC_021289	CGA	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021289	GTG	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021289	TCA	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021289	GAA	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021289	TGC	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021289	GCA	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021289	CAG	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021289	ATC	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021289	GTC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021289	GAG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021289	TCG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
75	NC_021289	CAG	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
76	NC_021289	ACC	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518299
77	NC_021289	GCT	3	9	4543	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
78	NC_021289	CGT	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
79	NC_021289	GCT	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
80	NC_021289	GAT	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
81	NC_021289	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
82	NC_021289	GAA	3	9	4874	4882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
83	NC_021289	ACG	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
84	NC_021289	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
85	NC_021289	CGA	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
86	NC_021289	GAC	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
87	NC_021289	GCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
88	NC_021289	GCG	4	12	5093	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
89	NC_021289	GTC	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
90	NC_021289	CAG	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
91	NC_021289	TGC	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
92	NC_021289	TCG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
93	NC_021289	GAC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
94	NC_021289	AGC	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
95	NC_021289	GAT	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
96	NC_021289	AAG	2	6	5549	5554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
97	NC_021289	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
98	NC_021289	GTG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518299
99	NC_021289	CAA	2	6	5755	5760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518299
100	NC_021289	GCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
101	NC_021289	AGC	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
102	NC_021289	CGG	2	6	5967	5972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
103	NC_021289	GCC	2	6	5975	5980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518299
104	NC_021289	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
105	NC_021289	CGC	2	6	6030	6035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518299
106	NC_021289	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
107	NC_021289	CGG	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021289	GCC	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021289	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021289	CGA	2	6	6377	6382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518300
111	NC_021289	AGC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518300
112	NC_021289	CGC	2	6	6446	6451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518300
113	NC_021289	GCG	2	6	6500	6505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518300
114	NC_021289	TGA	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518300
115	NC_021289	GGC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518300
116	NC_021289	CAC	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021289	TCG	3	9	6891	6899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021289	TCA	2	6	7038	7043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518301
119	NC_021289	GCC	2	6	7079	7084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518301
120	NC_021289	TGG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518301
121	NC_021289	ACG	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518301
122	NC_021289	CAG	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518301
123	NC_021289	CAA	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518301
124	NC_021289	CGA	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518301
125	NC_021289	CGT	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518301
126	NC_021289	ACT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518301
127	NC_021289	GGC	2	6	7586	7591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518301
128	NC_021289	CGC	2	6	7691	7696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518301
129	NC_021289	CGC	2	6	7710	7715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518301
130	NC_021289	GCG	2	6	7736	7741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518301
131	NC_021289	GCG	2	6	7843	7848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518302
132	NC_021289	GCC	2	6	7852	7857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518302
133	NC_021289	GCG	2	6	7870	7875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518302
134	NC_021289	CGT	2	6	7910	7915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518302
135	NC_021289	TCG	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518302
136	NC_021289	GCC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518302
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141	NC_021289	CGA	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518302
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143	NC_021289	CGA	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518302
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153	NC_021289	CGG	2	6	8975	8980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518302
154	NC_021289	GCT	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518302
155	NC_021289	GGC	2	6	9075	9080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518302
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160	NC_021289	CGC	2	6	9251	9256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518302
161	NC_021289	CGA	2	6	9263	9268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518302
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163	NC_021289	GAT	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021289	ATC	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021289	CGC	2	6	9544	9549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518303
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246	NC_021289	CGG	2	6	14535	14540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_021289	CCG	2	6	14641	14646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_021289	CAT	2	6	14702	14707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518308
249	NC_021289	TGC	2	6	14791	14796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518308
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252	NC_021289	CGT	2	6	14815	14820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518308
253	NC_021289	GCG	2	6	14821	14826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518308
254	NC_021289	TGA	2	6	14839	14844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518308
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256	NC_021289	CGA	2	6	14960	14965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518308
257	NC_021289	CGC	2	6	14975	14980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518308
258	NC_021289	ATG	2	6	14985	14990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518308
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262	NC_021289	GCC	2	6	15327	15332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518308
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352	NC_021289	CAA	2	6	19801	19806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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377	NC_021289	CGC	2	6	21013	21018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
378	NC_021289	CGT	2	6	21052	21057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518314
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