MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021288	TTGAG	2	10	3426	3435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021288	TCGAG	2	10	4997	5006	20 %	20 %	40 %	20 %	507517446
3	NC_021288	TCGAT	2	10	5030	5039	20 %	40 %	20 %	20 %	507517446
4	NC_021288	GCGAT	2	10	7203	7212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021288	GCTCG	2	10	8193	8202	0 %	20 %	40 %	40 %	507517447
6	NC_021288	GCGCC	2	10	8253	8262	0 %	0 %	40 %	60 %	507517447
7	NC_021288	CGGCG	2	10	8613	8622	0 %	0 %	60 %	40 %	507517447
8	NC_021288	AAAAG	2	10	9486	9495	80 %	0 %	20 %	0 %	507517447
9	NC_021288	TGGCA	2	10	12746	12755	20 %	20 %	40 %	20 %	507517453
10	NC_021288	GCCGC	2	10	14902	14911	0 %	0 %	40 %	60 %	507517455
11	NC_021288	GCATT	2	10	15385	15394	20 %	40 %	20 %	20 %	507517456
12	NC_021288	CCGCG	2	10	15510	15519	0 %	0 %	40 %	60 %	507517456
13	NC_021288	GCGCC	2	10	16959	16968	0 %	0 %	40 %	60 %	507517458
14	NC_021288	CGACG	2	10	17443	17452	20 %	0 %	40 %	40 %	507517458
15	NC_021288	GCGTC	2	10	17727	17736	0 %	20 %	40 %	40 %	507517458
16	NC_021288	GCCGC	2	10	17902	17911	0 %	0 %	40 %	60 %	507517459
17	NC_021288	CGAAC	2	10	17982	17991	40 %	0 %	20 %	40 %	507517459
18	NC_021288	CGGCG	2	10	19284	19293	0 %	0 %	60 %	40 %	507517461
19	NC_021288	GATCA	2	10	20151	20160	40 %	20 %	20 %	20 %	507517462
20	NC_021288	AACGC	2	10	20298	20307	40 %	0 %	20 %	40 %	507517462
21	NC_021288	GGCAA	2	10	22233	22242	40 %	0 %	40 %	20 %	507517464
22	NC_021288	GCCGC	2	10	22743	22752	0 %	0 %	40 %	60 %	507517464
23	NC_021288	CGCTG	2	10	25041	25050	0 %	20 %	40 %	40 %	507517468
24	NC_021288	GATTC	2	10	27082	27091	20 %	40 %	20 %	20 %	507517470
25	NC_021288	TTCCG	2	10	28592	28601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021288	TTTGG	2	10	29296	29305	0 %	60 %	40 %	0 %	507517472
27	NC_021288	CTGGC	2	10	29614	29623	0 %	20 %	40 %	40 %	507517472
28	NC_021288	CGCAG	2	10	31961	31970	20 %	0 %	40 %	40 %	507517475
29	NC_021288	TCGCG	2	10	31979	31988	0 %	20 %	40 %	40 %	507517475
30	NC_021288	GCGCG	2	10	33161	33170	0 %	0 %	60 %	40 %	507517477
31	NC_021288	CGCGC	2	10	33878	33887	0 %	0 %	40 %	60 %	507517477
32	NC_021288	TGCGC	2	10	36052	36061	0 %	20 %	40 %	40 %	507517479
33	NC_021288	TCGAT	2	10	36288	36297	20 %	40 %	20 %	20 %	507517479
34	NC_021288	AATCA	2	10	38159	38168	60 %	20 %	0 %	20 %	507517480
35	NC_021288	AGCCC	2	10	38235	38244	20 %	0 %	20 %	60 %	507517480
36	NC_021288	GCCCG	2	10	38609	38618	0 %	0 %	40 %	60 %	507517480
37	NC_021288	AGCGC	2	10	40048	40057	20 %	0 %	40 %	40 %	507517482
38	NC_021288	CACGT	2	10	42547	42556	20 %	20 %	20 %	40 %	507517483
39	NC_021288	ACGCG	2	10	43548	43557	20 %	0 %	40 %	40 %	507517484
40	NC_021288	AGCCG	2	10	44219	44228	20 %	0 %	40 %	40 %	507517484
41	NC_021288	ACGCG	2	10	45358	45367	20 %	0 %	40 %	40 %	507517486
42	NC_021288	CACGC	2	10	45523	45532	20 %	0 %	20 %	60 %	507517486
43	NC_021288	AGCGC	2	10	45662	45671	20 %	0 %	40 %	40 %	507517486
44	NC_021288	CCAAT	2	10	45758	45767	40 %	20 %	0 %	40 %	507517486
45	NC_021288	CCGAT	2	10	47642	47651	20 %	20 %	20 %	40 %	507517488
46	NC_021288	GCTTC	2	10	48131	48140	0 %	40 %	20 %	40 %	507517489
47	NC_021288	ATCGA	2	10	48633	48642	40 %	20 %	20 %	20 %	507517490
48	NC_021288	TTCGA	2	10	49029	49038	20 %	40 %	20 %	20 %	507517490
49	NC_021288	GCGAA	2	10	50886	50895	40 %	0 %	40 %	20 %	507517492
50	NC_021288	CAGCG	2	10	52011	52020	20 %	0 %	40 %	40 %	507517494
51	NC_021288	CGGCG	2	10	52828	52837	0 %	0 %	60 %	40 %	507517496
52	NC_021288	TCGAT	2	10	55458	55467	20 %	40 %	20 %	20 %	507517496
53	NC_021288	CGCTC	2	10	56032	56041	0 %	20 %	20 %	60 %	507517496
54	NC_021288	ATCGA	2	10	56144	56153	40 %	20 %	20 %	20 %	507517496
55	NC_021288	TTTCG	2	10	57076	57085	0 %	60 %	20 %	20 %	507517497
56	NC_021288	CGATC	2	10	57474	57483	20 %	20 %	20 %	40 %	507517497
57	NC_021288	TGCCG	2	10	57660	57669	0 %	20 %	40 %	40 %	507517497
58	NC_021288	GCCGC	2	10	58367	58376	0 %	0 %	40 %	60 %	507517498
59	NC_021288	GCCGC	2	10	58759	58768	0 %	0 %	40 %	60 %	507517498
60	NC_021288	CTGGC	2	10	60318	60327	0 %	20 %	40 %	40 %	507517500
61	NC_021288	AGACC	2	10	62143	62152	40 %	0 %	20 %	40 %	507517502
62	NC_021288	CGGCG	2	10	64732	64741	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_021288	AGCTC	2	10	64762	64771	20 %	20 %	20 %	40 %	507517505
64	NC_021288	TCGTT	2	10	67874	67883	0 %	60 %	20 %	20 %	507517507
65	NC_021288	GACCG	2	10	68138	68147	20 %	0 %	40 %	40 %	507517508
66	NC_021288	GCGAT	2	10	68256	68265	20 %	20 %	40 %	20 %	507517508
67	NC_021288	GCCGC	2	10	68910	68919	0 %	0 %	40 %	60 %	507517509
68	NC_021288	CGAGC	2	10	70928	70937	20 %	0 %	40 %	40 %	507517510
69	NC_021288	TGACC	2	10	71242	71251	20 %	20 %	20 %	40 %	507517510
70	NC_021288	TGTTT	2	10	71923	71932	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021288	GTGCA	2	10	72406	72415	20 %	20 %	40 %	20 %	507517512
72	NC_021288	CCGGA	2	10	73911	73920	20 %	0 %	40 %	40 %	507517514
73	NC_021288	ACGCG	2	10	74640	74649	20 %	0 %	40 %	40 %	507517514
74	NC_021288	GTTGC	2	10	74996	75005	0 %	40 %	40 %	20 %	507517515
75	NC_021288	GCCGC	2	10	75841	75850	0 %	0 %	40 %	60 %	507517515
76	NC_021288	CGCGG	2	10	76678	76687	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_021288	AAACG	2	10	77160	77169	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021288	GCGCC	2	10	77667	77676	0 %	0 %	40 %	60 %	507517516
79	NC_021288	GAGTT	2	10	78278	78287	20 %	40 %	40 %	0 %	507517516
80	NC_021288	GATCG	2	10	78757	78766	20 %	20 %	40 %	20 %	507517516
81	NC_021288	CGAGC	2	10	79680	79689	20 %	0 %	40 %	40 %	507517517
82	NC_021288	GCGAC	2	10	80447	80456	20 %	0 %	40 %	40 %	507517517
83	NC_021288	ACCGC	2	10	81304	81313	20 %	0 %	20 %	60 %	507517519
84	NC_021288	GATGC	2	10	85102	85111	20 %	20 %	40 %	20 %	507517522
85	NC_021288	CGTGC	2	10	85381	85390	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021288	CACGA	2	10	87290	87299	40 %	0 %	20 %	40 %	507517524
87	NC_021288	ATTTC	2	10	88672	88681	20 %	60 %	0 %	20 %	507517525
88	NC_021288	CGACA	2	10	93169	93178	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_021288	GCGCC	2	10	93502	93511	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_021288	AATTG	2	10	94255	94264	40 %	40 %	20 %	0 %	507517532
91	NC_021288	GAACT	2	10	97094	97103	40 %	20 %	20 %	20 %	507517534
92	NC_021288	CGGGC	2	10	100364	100373	0 %	0 %	60 %	40 %	507517537
93	NC_021288	GCGAT	2	10	102483	102492	20 %	20 %	40 %	20 %	507517538
94	NC_021288	CGATG	2	10	102879	102888	20 %	20 %	40 %	20 %	507517539
95	NC_021288	GCGCC	2	10	103966	103975	0 %	0 %	40 %	60 %	507517540
96	NC_021288	ACCGC	2	10	104559	104568	20 %	0 %	20 %	60 %	507517540
97	NC_021288	GCCGA	2	10	106649	106658	20 %	0 %	40 %	40 %	507517542
98	NC_021288	GGGCA	2	10	107638	107647	20 %	0 %	60 %	20 %	507517543
99	NC_021288	CGCGC	2	10	108649	108658	0 %	0 %	40 %	60 %	507517545
100	NC_021288	CGCGC	2	10	108703	108712	0 %	0 %	40 %	60 %	507517545
101	NC_021288	ACGCG	2	10	108948	108957	20 %	0 %	40 %	40 %	507517545
102	NC_021288	TCGGC	2	10	110295	110304	0 %	20 %	40 %	40 %	507517547
103	NC_021288	CGGCG	2	10	111241	111250	0 %	0 %	60 %	40 %	507517549
104	NC_021288	AGCCG	2	10	112863	112872	20 %	0 %	40 %	40 %	507517550
105	NC_021288	CATCG	2	10	115442	115451	20 %	20 %	20 %	40 %	507517553
106	NC_021288	AGCGG	2	10	115624	115633	20 %	0 %	60 %	20 %	507517553
107	NC_021288	CGTCG	2	10	116307	116316	0 %	20 %	40 %	40 %	507517554
108	NC_021288	CGATT	2	10	116337	116346	20 %	40 %	20 %	20 %	507517554
109	NC_021288	CCGGA	2	10	116623	116632	20 %	0 %	40 %	40 %	507517554
110	NC_021288	CGGCG	2	10	117284	117293	0 %	0 %	60 %	40 %	507517555
111	NC_021288	CGACT	2	10	122744	122753	20 %	20 %	20 %	40 %	507517563
112	NC_021288	GTTTC	2	10	123822	123831	0 %	60 %	20 %	20 %	507517563
113	NC_021288	CGATT	2	10	127254	127263	20 %	40 %	20 %	20 %	507517568
114	NC_021288	TGACT	2	10	129065	129074	20 %	40 %	20 %	20 %	507517570
115	NC_021288	CGCGC	2	10	129445	129454	0 %	0 %	40 %	60 %	507517571
116	NC_021288	ACGGC	2	10	129716	129725	20 %	0 %	40 %	40 %	507517571
117	NC_021288	CGGCG	2	10	130861	130870	0 %	0 %	60 %	40 %	507517572
118	NC_021288	GGACG	2	10	131020	131029	20 %	0 %	60 %	20 %	507517573
119	NC_021288	CGGCA	2	10	131227	131236	20 %	0 %	40 %	40 %	507517573
120	NC_021288	TCGCG	2	10	131684	131693	0 %	20 %	40 %	40 %	507517573
121	NC_021288	ACGCG	2	10	132095	132104	20 %	0 %	40 %	40 %	507517573
122	NC_021288	CGTGC	2	10	132791	132800	0 %	20 %	40 %	40 %	507517574
123	NC_021288	GGCGA	2	10	132927	132936	20 %	0 %	60 %	20 %	507517574
124	NC_021288	TGCCG	2	10	133568	133577	0 %	20 %	40 %	40 %	507517575
125	NC_021288	GCGCC	2	10	133679	133688	0 %	0 %	40 %	60 %	507517575
126	NC_021288	GCCGC	2	10	134536	134545	0 %	0 %	40 %	60 %	507517576
127	NC_021288	GGCCG	2	10	135713	135722	0 %	0 %	60 %	40 %	507517577
128	NC_021288	ATTGC	2	10	136691	136700	20 %	40 %	20 %	20 %	507517579
129	NC_021288	GCGCG	2	10	137672	137681	0 %	0 %	60 %	40 %	507517579
130	NC_021288	GACCG	2	10	137737	137746	20 %	0 %	40 %	40 %	507517579
131	NC_021288	CGATG	2	10	139766	139775	20 %	20 %	40 %	20 %	507517581
132	NC_021288	CGACG	2	10	141170	141179	20 %	0 %	40 %	40 %	507517582
133	NC_021288	TGCGC	2	10	144362	144371	0 %	20 %	40 %	40 %	507517585
134	NC_021288	GCGAT	2	10	146061	146070	20 %	20 %	40 %	20 %	507517586
135	NC_021288	CGCGC	2	10	147518	147527	0 %	0 %	40 %	60 %	507517588
136	NC_021288	GGCTC	2	10	147771	147780	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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242	NC_021288	GTGAC	2	10	273504	273513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_021288	CGCGC	2	10	273873	273882	0 %	0 %	40 %	60 %	507517723
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245	NC_021288	TACGC	2	10	279202	279211	20 %	20 %	20 %	40 %	507517729
246	NC_021288	GCAAT	2	10	279673	279682	40 %	20 %	20 %	20 %	507517730
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248	NC_021288	GGGCA	2	10	283487	283496	20 %	0 %	60 %	20 %	507517733
249	NC_021288	ACGTG	2	10	284041	284050	20 %	20 %	40 %	20 %	507517734
250	NC_021288	CGAGG	2	10	284781	284790	20 %	0 %	60 %	20 %	507517734
251	NC_021288	GGCGC	2	10	284949	284958	0 %	0 %	60 %	40 %	507517735
252	NC_021288	GCGCC	2	10	287387	287396	0 %	0 %	40 %	60 %	507517738
253	NC_021288	GCCGG	2	10	288972	288981	0 %	0 %	60 %	40 %	507517739
254	NC_021288	TCGTC	2	10	292944	292953	0 %	40 %	20 %	40 %	507517745
255	NC_021288	CTCGA	2	10	293701	293710	20 %	20 %	20 %	40 %	507517745
256	NC_021288	ACGCG	2	10	295023	295032	20 %	0 %	40 %	40 %	507517747
257	NC_021288	CTGCC	2	10	295576	295585	0 %	20 %	20 %	60 %	507517747
258	NC_021288	AGCCG	2	10	296183	296192	20 %	0 %	40 %	40 %	507517749
259	NC_021288	GCACG	2	10	299323	299332	20 %	0 %	40 %	40 %	507517752
260	NC_021288	ATCGC	2	10	299808	299817	20 %	20 %	20 %	40 %	507517753
261	NC_021288	CGCGC	2	10	301030	301039	0 %	0 %	40 %	60 %	507517754
262	NC_021288	GCGCT	2	10	301482	301491	0 %	20 %	40 %	40 %	507517754
263	NC_021288	TGGGC	2	10	301750	301759	0 %	20 %	60 %	20 %	507517754
264	NC_021288	CACTG	2	10	304755	304764	20 %	20 %	20 %	40 %	507517759
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266	NC_021288	CAAGA	2	10	305616	305625	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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398	NC_021288	CGGAT	2	10	487620	487629	20 %	20 %	40 %	20 %	507517920
399	NC_021288	ACGCC	2	10	488608	488617	20 %	0 %	20 %	60 %	507517921
400	NC_021288	ACGTG	2	10	489811	489820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
401	NC_021288	GGCCG	2	10	490393	490402	0 %	0 %	60 %	40 %	507517922
402	NC_021288	GCCGC	2	10	490918	490927	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
403	NC_021288	GTGGC	2	10	494893	494902	0 %	20 %	60 %	20 %	507517926
404	NC_021288	CACGT	2	10	495085	495094	20 %	20 %	20 %	40 %	507517926
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406	NC_021288	CCAAC	2	10	497740	497749	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
407	NC_021288	TCGAC	2	10	498429	498438	20 %	20 %	20 %	40 %	507517928
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411	NC_021288	GCGCC	2	10	506370	506379	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
412	NC_021288	TCACG	2	10	507349	507358	20 %	20 %	20 %	40 %	507517936
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496	NC_021288	ATCGC	2	10	620969	620978	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
497	NC_021288	ACGCG	2	10	623075	623084	20 %	0 %	40 %	40 %	507518036
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500	NC_021288	CTCAA	2	10	625555	625564	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

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