MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 2687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021287	TCACG	2	10	3632	3641	20 %	20 %	20 %	40 %	507514536
2	NC_021287	AGCGC	2	10	3727	3736	20 %	0 %	40 %	40 %	507514536
3	NC_021287	GCTAT	2	10	6018	6027	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021287	AATAA	2	10	7346	7355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021287	ATTGC	2	10	9669	9678	20 %	40 %	20 %	20 %	507514539
6	NC_021287	GGCGC	2	10	10011	10020	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021287	CGGAT	2	10	11263	11272	20 %	20 %	40 %	20 %	507514541
8	NC_021287	CGATC	2	10	11391	11400	20 %	20 %	20 %	40 %	507514541
9	NC_021287	CGCAG	2	10	13287	13296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021287	ATCGA	2	10	14243	14252	40 %	20 %	20 %	20 %	507514542
11	NC_021287	GCGCC	2	10	16540	16549	0 %	0 %	40 %	60 %	507514545
12	NC_021287	GCTCG	2	10	22390	22399	0 %	20 %	40 %	40 %	507514552
13	NC_021287	CGTGC	2	10	22516	22525	0 %	20 %	40 %	40 %	507514552
14	NC_021287	GCACG	2	10	24696	24705	20 %	0 %	40 %	40 %	507514554
15	NC_021287	CCGGC	2	10	24785	24794	0 %	0 %	40 %	60 %	507514554
16	NC_021287	ACGAC	2	10	24911	24920	40 %	0 %	20 %	40 %	507514554
17	NC_021287	CGGTG	2	10	26293	26302	0 %	20 %	60 %	20 %	507514555
18	NC_021287	GCGCC	2	10	28708	28717	0 %	0 %	40 %	60 %	507514557
19	NC_021287	GAACG	2	10	29582	29591	40 %	0 %	40 %	20 %	507514557
20	NC_021287	TGGCG	2	10	30910	30919	0 %	20 %	60 %	20 %	507514560
21	NC_021287	GGGGC	2	10	31719	31728	0 %	0 %	80 %	20 %	507514561
22	NC_021287	GCGCG	2	10	33583	33592	0 %	0 %	60 %	40 %	507514564
23	NC_021287	ACGCG	2	10	33853	33862	20 %	0 %	40 %	40 %	507514564
24	NC_021287	CGTGC	2	10	34429	34438	0 %	20 %	40 %	40 %	507514564
25	NC_021287	ACGTG	2	10	34578	34587	20 %	20 %	40 %	20 %	507514564
26	NC_021287	CGAGC	2	10	36115	36124	20 %	0 %	40 %	40 %	507514566
27	NC_021287	CGCGG	2	10	36755	36764	0 %	0 %	60 %	40 %	507514566
28	NC_021287	ACGCA	2	10	37431	37440	40 %	0 %	20 %	40 %	507514566
29	NC_021287	CACGA	2	10	39346	39355	40 %	0 %	20 %	40 %	507514568
30	NC_021287	CTTTT	2	10	41254	41263	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021287	CGGGC	2	10	44330	44339	0 %	0 %	60 %	40 %	507514573
32	NC_021287	GGCGC	2	10	44465	44474	0 %	0 %	60 %	40 %	507514573
33	NC_021287	GCGCC	2	10	44593	44602	0 %	0 %	40 %	60 %	507514573
34	NC_021287	GGTCG	2	10	45530	45539	0 %	20 %	60 %	20 %	507514574
35	NC_021287	GATGC	2	10	45551	45560	20 %	20 %	40 %	20 %	507514574
36	NC_021287	GACGC	2	10	46414	46423	20 %	0 %	40 %	40 %	507514575
37	NC_021287	GCAGC	2	10	46568	46577	20 %	0 %	40 %	40 %	507514575
38	NC_021287	GCGCG	2	10	50156	50165	0 %	0 %	60 %	40 %	507514577
39	NC_021287	GGCGC	2	10	51192	51201	0 %	0 %	60 %	40 %	507514578
40	NC_021287	GCACG	2	10	51219	51228	20 %	0 %	40 %	40 %	507514578
41	NC_021287	CTCGA	2	10	52342	52351	20 %	20 %	20 %	40 %	507514580
42	NC_021287	CGCAG	2	10	53319	53328	20 %	0 %	40 %	40 %	507514580
43	NC_021287	CGTGC	2	10	53643	53652	0 %	20 %	40 %	40 %	507514580
44	NC_021287	CGCGC	2	10	54014	54023	0 %	0 %	40 %	60 %	507514581
45	NC_021287	ATCAG	2	10	54073	54082	40 %	20 %	20 %	20 %	507514581
46	NC_021287	GCTCG	2	10	55479	55488	0 %	20 %	40 %	40 %	507514582
47	NC_021287	GCCGC	2	10	58923	58932	0 %	0 %	40 %	60 %	507514585
48	NC_021287	AGCGC	2	10	59840	59849	20 %	0 %	40 %	40 %	507514586
49	NC_021287	CGCGG	2	10	60373	60382	0 %	0 %	60 %	40 %	507514587
50	NC_021287	ACGCA	2	10	63010	63019	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021287	ATCGC	2	10	66593	66602	20 %	20 %	20 %	40 %	507514593
52	NC_021287	GCGCA	2	10	67120	67129	20 %	0 %	40 %	40 %	507514593
53	NC_021287	CTCAA	2	10	70605	70614	40 %	20 %	0 %	40 %	507514595
54	NC_021287	CCGCG	2	10	71904	71913	0 %	0 %	40 %	60 %	507514596
55	NC_021287	CAGCG	2	10	72002	72011	20 %	0 %	40 %	40 %	507514596
56	NC_021287	AGCGC	2	10	72027	72036	20 %	0 %	40 %	40 %	507514596
57	NC_021287	GCCGC	2	10	73847	73856	0 %	0 %	40 %	60 %	507514597
58	NC_021287	CCGCG	2	10	74519	74528	0 %	0 %	40 %	60 %	507514597
59	NC_021287	TCTCG	2	10	78368	78377	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021287	GCACG	2	10	79238	79247	20 %	0 %	40 %	40 %	507514600
61	NC_021287	CGCGA	2	10	79556	79565	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021287	GCTTC	2	10	81615	81624	0 %	40 %	20 %	40 %	507514604
63	NC_021287	AGGCC	2	10	81669	81678	20 %	0 %	40 %	40 %	507514604
64	NC_021287	ACGCG	2	10	82625	82634	20 %	0 %	40 %	40 %	507514605
65	NC_021287	GCGAG	2	10	83837	83846	20 %	0 %	60 %	20 %	507514606
66	NC_021287	GCGAA	2	10	86259	86268	40 %	0 %	40 %	20 %	507514609
67	NC_021287	GGCAG	2	10	87045	87054	20 %	0 %	60 %	20 %	507514609
68	NC_021287	TCACG	2	10	93610	93619	20 %	20 %	20 %	40 %	507514618
69	NC_021287	CTTCG	2	10	93871	93880	0 %	40 %	20 %	40 %	507514618
70	NC_021287	CAGCC	2	10	93974	93983	20 %	0 %	20 %	60 %	507514618
71	NC_021287	TGAAA	2	10	94211	94220	60 %	20 %	20 %	0 %	507514619
72	NC_021287	TGGCC	2	10	94408	94417	0 %	20 %	40 %	40 %	507514619
73	NC_021287	CGCGC	2	10	95362	95371	0 %	0 %	40 %	60 %	507514620
74	NC_021287	AGCCG	2	10	97367	97376	20 %	0 %	40 %	40 %	507514622
75	NC_021287	GCGAG	2	10	98080	98089	20 %	0 %	60 %	20 %	507514623
76	NC_021287	AGCGC	2	10	98299	98308	20 %	0 %	40 %	40 %	507514623
77	NC_021287	CGCTG	2	10	98474	98483	0 %	20 %	40 %	40 %	507514623
78	NC_021287	GCGCG	2	10	99348	99357	0 %	0 %	60 %	40 %	507514624
79	NC_021287	GCGAC	2	10	99768	99777	20 %	0 %	40 %	40 %	507514624
80	NC_021287	ACGGC	2	10	100848	100857	20 %	0 %	40 %	40 %	507514626
81	NC_021287	TCGGC	2	10	101781	101790	0 %	20 %	40 %	40 %	507514626
82	NC_021287	TGCAC	2	10	102102	102111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021287	GCGCG	2	10	102554	102563	0 %	0 %	60 %	40 %	507514627
84	NC_021287	CGGCG	2	10	102584	102593	0 %	0 %	60 %	40 %	507514627
85	NC_021287	GTTCG	2	10	102910	102919	0 %	40 %	40 %	20 %	507514628
86	NC_021287	CTCGC	2	10	103515	103524	0 %	20 %	20 %	60 %	507514629
87	NC_021287	CCGGC	2	10	104790	104799	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_021287	GCGCC	2	10	106477	106486	0 %	0 %	40 %	60 %	507514632
89	NC_021287	AGCCG	2	10	108926	108935	20 %	0 %	40 %	40 %	507514634
90	NC_021287	GCAGC	2	10	110131	110140	20 %	0 %	40 %	40 %	507514635
91	NC_021287	GCCCA	2	10	110615	110624	20 %	0 %	20 %	60 %	507514636
92	NC_021287	GTTCG	2	10	111403	111412	0 %	40 %	40 %	20 %	507514636
93	NC_021287	TGGCG	2	10	111951	111960	0 %	20 %	60 %	20 %	507514636
94	NC_021287	TCGAA	2	10	114344	114353	40 %	20 %	20 %	20 %	507514639
95	NC_021287	GTGCC	2	10	116347	116356	0 %	20 %	40 %	40 %	507514640
96	NC_021287	GCGAT	2	10	116929	116938	20 %	20 %	40 %	20 %	507514640
97	NC_021287	CGCTG	2	10	116960	116969	0 %	20 %	40 %	40 %	507514640
98	NC_021287	CACGA	2	10	120561	120570	40 %	0 %	20 %	40 %	507514642
99	NC_021287	TCGCG	2	10	122979	122988	0 %	20 %	40 %	40 %	507514646
100	NC_021287	GCGCC	2	10	123003	123012	0 %	0 %	40 %	60 %	507514646
101	NC_021287	TGCGT	2	10	125111	125120	0 %	40 %	40 %	20 %	507514649
102	NC_021287	AATCG	2	10	128658	128667	40 %	20 %	20 %	20 %	507514653
103	NC_021287	GCGCG	2	10	131598	131607	0 %	0 %	60 %	40 %	507514658
104	NC_021287	CAGGA	2	10	135239	135248	40 %	0 %	40 %	20 %	507514661
105	NC_021287	GTCGC	2	10	136216	136225	0 %	20 %	40 %	40 %	507514662
106	NC_021287	CGCGG	2	10	136519	136528	0 %	0 %	60 %	40 %	507514662
107	NC_021287	TCGCG	2	10	136712	136721	0 %	20 %	40 %	40 %	507514662
108	NC_021287	GCGCA	2	10	136924	136933	20 %	0 %	40 %	40 %	507514662
109	NC_021287	CGAAG	2	10	138941	138950	40 %	0 %	40 %	20 %	507514664
110	NC_021287	GCGCG	2	10	143845	143854	0 %	0 %	60 %	40 %	507514670
111	NC_021287	CGGCG	2	10	144480	144489	0 %	0 %	60 %	40 %	507514670
112	NC_021287	GCCGG	2	10	144700	144709	0 %	0 %	60 %	40 %	507514671
113	NC_021287	TTCGA	2	10	145603	145612	20 %	40 %	20 %	20 %	507514672
114	NC_021287	GAGGC	2	10	146357	146366	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021287	GCGAC	2	10	147284	147293	20 %	0 %	40 %	40 %	507514673
116	NC_021287	CCATG	2	10	148466	148475	20 %	20 %	20 %	40 %	507514675
117	NC_021287	CGCGC	2	10	150042	150051	0 %	0 %	40 %	60 %	507514677
118	NC_021287	TTGCC	2	10	151647	151656	0 %	40 %	20 %	40 %	507514677
119	NC_021287	CAGCG	2	10	152317	152326	20 %	0 %	40 %	40 %	507514678
120	NC_021287	GCAGC	2	10	153045	153054	20 %	0 %	40 %	40 %	507514678
121	NC_021287	GTTCG	2	10	154817	154826	0 %	40 %	40 %	20 %	507514681
122	NC_021287	CGCGG	2	10	154900	154909	0 %	0 %	60 %	40 %	507514681
123	NC_021287	GCTTC	2	10	155155	155164	0 %	40 %	20 %	40 %	507514681
124	NC_021287	CATCG	2	10	155751	155760	20 %	20 %	20 %	40 %	507514681
125	NC_021287	TCGAA	2	10	156130	156139	40 %	20 %	20 %	20 %	507514682
126	NC_021287	GACTC	2	10	156382	156391	20 %	20 %	20 %	40 %	507514682
127	NC_021287	GGCAG	2	10	156807	156816	20 %	0 %	60 %	20 %	507514682
128	NC_021287	GACGC	2	10	157719	157728	20 %	0 %	40 %	40 %	507514683
129	NC_021287	GCCGC	2	10	160578	160587	0 %	0 %	40 %	60 %	507514686
130	NC_021287	GCCGC	2	10	160806	160815	0 %	0 %	40 %	60 %	507514686
131	NC_021287	TCCGA	2	10	161141	161150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_021287	AGACG	2	10	163432	163441	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021287	CGGCG	2	10	164982	164991	0 %	0 %	60 %	40 %	507514693
134	NC_021287	CCGCG	2	10	165071	165080	0 %	0 %	40 %	60 %	507514693
135	NC_021287	ACGCG	2	10	165850	165859	20 %	0 %	40 %	40 %	507514694
136	NC_021287	GCGCG	2	10	165883	165892	0 %	0 %	60 %	40 %	507514694
137	NC_021287	CGGGC	2	10	169957	169966	0 %	0 %	60 %	40 %	507514699
138	NC_021287	ACGGA	2	10	170014	170023	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021287	CCCGA	2	10	173247	173256	20 %	0 %	20 %	60 %	507514704
140	NC_021287	CGGTC	2	10	175423	175432	0 %	20 %	40 %	40 %	507514705
141	NC_021287	CCGAC	2	10	175592	175601	20 %	0 %	20 %	60 %	507514706
142	NC_021287	GCCGC	2	10	178762	178771	0 %	0 %	40 %	60 %	507514710
143	NC_021287	ACGCG	2	10	179502	179511	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021287	TGTCG	2	10	180807	180816	0 %	40 %	40 %	20 %	507514712
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146	NC_021287	GAGCA	2	10	183372	183381	40 %	0 %	40 %	20 %	507514715
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149	NC_021287	AAGTC	2	10	185991	186000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021287	CTCGC	2	10	186339	186348	0 %	20 %	20 %	60 %	507514718
151	NC_021287	GCGCG	2	10	187442	187451	0 %	0 %	60 %	40 %	507514718
152	NC_021287	GCGCG	2	10	188178	188187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_021287	GCGCC	2	10	191792	191801	0 %	0 %	40 %	60 %	507514722
154	NC_021287	TCATT	2	10	193730	193739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_021287	CTCGA	2	10	195294	195303	20 %	20 %	20 %	40 %	507514726
156	NC_021287	GCTTG	2	10	195827	195836	0 %	40 %	40 %	20 %	507514726
157	NC_021287	TTCCA	2	10	196067	196076	20 %	40 %	0 %	40 %	507514727
158	NC_021287	CGCGG	2	10	196864	196873	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_021287	TCGAC	2	10	197058	197067	20 %	20 %	20 %	40 %	507514728
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161	NC_021287	CGAAG	2	10	200663	200672	40 %	0 %	40 %	20 %	507514732
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163	NC_021287	CACGA	2	10	201010	201019	40 %	0 %	20 %	40 %	507514733
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165	NC_021287	CGCAG	2	10	203573	203582	20 %	0 %	40 %	40 %	507514736
166	NC_021287	GCGCG	2	10	203669	203678	0 %	0 %	60 %	40 %	507514736
167	NC_021287	CGCAG	2	10	206956	206965	20 %	0 %	40 %	40 %	507514739
168	NC_021287	GGCGC	2	10	208430	208439	0 %	0 %	60 %	40 %	507514740
169	NC_021287	GCCGC	2	10	208755	208764	0 %	0 %	40 %	60 %	507514740
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171	NC_021287	ATTGA	2	10	211365	211374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021287	GCCGC	2	10	212127	212136	0 %	0 %	40 %	60 %	507514746
173	NC_021287	GCGCC	2	10	212377	212386	0 %	0 %	40 %	60 %	507514747
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175	NC_021287	GCCGC	2	10	213997	214006	0 %	0 %	40 %	60 %	507514748
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177	NC_021287	CCGCA	2	10	214286	214295	20 %	0 %	20 %	60 %	507514749
178	NC_021287	GTTGT	2	10	215132	215141	0 %	60 %	40 %	0 %	507514750
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181	NC_021287	CCGCG	2	10	219379	219388	0 %	0 %	40 %	60 %	507514756
182	NC_021287	CGGCG	2	10	219779	219788	0 %	0 %	60 %	40 %	507514756
183	NC_021287	CCGCG	2	10	219851	219860	0 %	0 %	40 %	60 %	507514756
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187	NC_021287	CGATC	2	10	221109	221118	20 %	20 %	20 %	40 %	507514757
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197	NC_021287	GCGCG	2	10	225268	225277	0 %	0 %	60 %	40 %	507514759
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208	NC_021287	CGCGC	2	10	241302	241311	0 %	0 %	40 %	60 %	507514776
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211	NC_021287	GCGCT	2	10	244228	244237	0 %	20 %	40 %	40 %	507514779
212	NC_021287	CGGCA	2	10	244896	244905	20 %	0 %	40 %	40 %	507514779
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214	NC_021287	TTCGG	2	10	248458	248467	0 %	40 %	40 %	20 %	507514783
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216	NC_021287	GCGCC	2	10	249446	249455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
217	NC_021287	GATCG	2	10	252179	252188	20 %	20 %	40 %	20 %	507514788
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219	NC_021287	GCGCG	2	10	255666	255675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
220	NC_021287	TCGCG	2	10	257117	257126	0 %	20 %	40 %	40 %	507514793
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225	NC_021287	TGGCT	2	10	265303	265312	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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228	NC_021287	TTGAT	2	10	267712	267721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
229	NC_021287	GCGAA	2	10	267983	267992	40 %	0 %	40 %	20 %	507514803
230	NC_021287	GCGAT	2	10	268454	268463	20 %	20 %	40 %	20 %	507514803
231	NC_021287	AGGTT	2	10	268641	268650	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
232	NC_021287	TGCGG	2	10	270744	270753	0 %	20 %	60 %	20 %	507514806
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239	NC_021287	GGCTT	2	10	279484	279493	0 %	40 %	40 %	20 %	507514813
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242	NC_021287	TTCGT	2	10	281050	281059	0 %	60 %	20 %	20 %	507514815
243	NC_021287	GATGC	2	10	281355	281364	20 %	20 %	40 %	20 %	507514815
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246	NC_021287	GATCA	2	10	285394	285403	40 %	20 %	20 %	20 %	507514819
247	NC_021287	CGATG	2	10	286094	286103	20 %	20 %	40 %	20 %	507514819
248	NC_021287	CTGTC	2	10	286791	286800	0 %	40 %	20 %	40 %	507514820
249	NC_021287	GCCGG	2	10	287228	287237	0 %	0 %	60 %	40 %	507514820
250	NC_021287	GCGCG	2	10	287863	287872	0 %	0 %	60 %	40 %	507514821
251	NC_021287	GATCG	2	10	288014	288023	20 %	20 %	40 %	20 %	507514821
252	NC_021287	GCGCG	2	10	288681	288690	0 %	0 %	60 %	40 %	507514822
253	NC_021287	ACGCC	2	10	289539	289548	20 %	0 %	20 %	60 %	507514822
254	NC_021287	CTGCG	2	10	292900	292909	0 %	20 %	40 %	40 %	507514825
255	NC_021287	TCGCG	2	10	293712	293721	0 %	20 %	40 %	40 %	507514825
256	NC_021287	GCGCC	2	10	294789	294798	0 %	0 %	40 %	60 %	507514826
257	NC_021287	TAGAA	2	10	297295	297304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021287	AGCGA	2	10	297975	297984	40 %	0 %	40 %	20 %	507514830
259	NC_021287	TTCGA	2	10	298381	298390	20 %	40 %	20 %	20 %	507514831
260	NC_021287	CGCGC	2	10	299833	299842	0 %	0 %	40 %	60 %	507514832
261	NC_021287	CCGGC	2	10	300111	300120	0 %	0 %	40 %	60 %	507514832
262	NC_021287	CGGCG	2	10	300300	300309	0 %	0 %	60 %	40 %	507514832
263	NC_021287	TGAAC	2	10	302074	302083	40 %	20 %	20 %	20 %	507514835
264	NC_021287	CGCGC	2	10	304054	304063	0 %	0 %	40 %	60 %	507514836
265	NC_021287	GCGGT	2	10	306067	306076	0 %	20 %	60 %	20 %	507514838
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267	NC_021287	GCCGA	2	10	307038	307047	20 %	0 %	40 %	40 %	507514839
268	NC_021287	GGCGA	2	10	307332	307341	20 %	0 %	60 %	20 %	507514839
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281	NC_021287	GCCGA	2	10	328169	328178	20 %	0 %	40 %	40 %	507514858
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285	NC_021287	CAGGG	2	10	331221	331230	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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394	NC_021287	GGCGC	2	10	435949	435958	0 %	0 %	60 %	40 %	507514957
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399	NC_021287	GCCGC	2	10	440116	440125	0 %	0 %	40 %	60 %	507514962
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