MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis GSL 199

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021286	AAATTT	2	12	27570	27581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021286	CGGAGG	2	12	51957	51968	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021286	CGGAGG	2	12	56756	56767	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021286	ATTTGC	2	12	121952	121963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021286	AATTTA	2	12	173656	173667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021286	GGGGAA	2	12	206640	206651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021286	AGTGTC	2	12	225002	225013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021286	TATTCA	2	12	231505	231516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021286	GTTAAC	2	12	286373	286384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021286	TTTTAA	2	12	486793	486804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021286	TTGATC	2	12	515626	515637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021286	ACGTCA	2	12	532470	532481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021286	TGATGT	2	12	643330	643341	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021286	AATGAT	2	12	855791	855802	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021286	CTTTCG	2	12	865664	865675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021286	GTCTTC	2	12	879619	879630	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021286	AAGTTT	2	12	883985	883996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021286	AAAAAG	2	12	1033490	1033501	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021286	AGCTTT	2	12	1051732	1051743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021286	ATAAAA	2	12	1103651	1103662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021286	ATCAGA	2	12	1169868	1169879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021286	CAAAAA	2	12	1225019	1225030	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021286	GTTTCA	2	12	1228956	1228967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021286	CTACTT	2	12	1230053	1230064	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021286	ACCCAA	2	12	1246633	1246644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021286	ATTTCA	2	12	1264163	1264174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021286	TCTTCA	2	12	1280617	1280628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021286	TGCGCT	2	12	1284236	1284247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021286	AAAATA	2	12	1324789	1324800	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021286	AAAGTT	2	12	1340129	1340140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021286	TAACGC	2	12	1343700	1343711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021286	AGTTAC	2	12	1345983	1345994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021286	ATTTAA	2	12	1386566	1386577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021286	TTTTCC	2	12	1473969	1473980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021286	TTATTG	2	12	1593051	1593062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021286	CATTAG	2	12	1644959	1644970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021286	CTTCAG	2	12	1664651	1664662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021286	ATGAAT	2	12	1686824	1686835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021286	CTTTAC	2	12	1800919	1800930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021286	AGGCTC	2	12	1819985	1819996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021286	TGTAAA	2	12	1856838	1856849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021286	ATTTCA	2	12	1990450	1990461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021286	ATTTCA	2	12	2024873	2024884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021286	TTTTTA	2	12	2054594	2054605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021286	TTTTTA	2	12	2055118	2055129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021286	TATTCT	2	12	2171266	2171277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021286	ACAAGT	2	12	2217424	2217435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021286	AATTTA	2	12	2286388	2286399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021286	ATTTGT	2	12	2295086	2295097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021286	TGTAAA	2	12	2340076	2340087	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021286	CTGTGA	2	12	2351835	2351846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021286	TAAAGG	2	12	2360672	2360683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021286	GTATCT	2	12	2363544	2363555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021286	ATGTGC	2	12	2420321	2420332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021286	ATTTCA	2	12	2433684	2433695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021286	CTAAAT	2	12	2679286	2679297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021286	TATAGT	2	12	2689081	2689092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021286	CGTTTT	2	12	2716998	2717009	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021286	ATTTCA	2	12	2750027	2750038	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021286	ATTTTG	2	12	2798046	2798057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021286	CATCTT	2	12	2798180	2798191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021286	TATTAC	2	12	2831619	2831630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.