MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma syrphidicola EA-1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021284	AAAAAG	2	12	72168	72179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021284	GGGAAA	2	12	82680	82691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021284	ACATCA	2	12	83353	83364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021284	AATATT	2	12	90877	90888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021284	TAATTG	2	12	113383	113394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021284	GAAAAA	2	12	142655	142666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021284	TTAGTA	2	12	146352	146363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021284	GTTATT	2	12	171417	171428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021284	TATTTT	2	12	173052	173063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021284	ATGAAT	2	12	194884	194895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021284	CAAATA	2	12	213528	213539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021284	CATCAA	2	12	220190	220201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021284	TTTTTA	2	12	278447	278458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021284	GAGGAA	2	12	313720	313731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021284	TTGTTT	2	12	393859	393870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021284	ATTTTT	2	12	419442	419453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021284	TTCGGG	2	12	428373	428384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021284	TCCCTC	2	12	428393	428404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021284	GAAAGC	2	12	434295	434306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021284	TTTTAT	2	12	459485	459496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021284	TTTTAA	2	12	478661	478672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021284	TTTAAT	2	12	505487	505498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021284	AAAATT	2	12	505584	505595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021284	AAAATA	2	12	533330	533341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021284	GTAAAA	2	12	544676	544687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021284	ATAAAA	2	12	547338	547349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021284	TATAAG	2	12	569941	569952	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021284	TATAGA	3	18	574747	574764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021284	ACTATA	2	12	579871	579882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021284	TTTAAA	2	12	646875	646886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021284	ATAACT	2	12	654947	654958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021284	ATTTTT	2	12	684488	684499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021284	ATAAAA	2	12	684532	684543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021284	AAACAT	2	12	688445	688456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021284	TTGGGT	2	12	707030	707041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021284	TCTTTC	2	12	719692	719703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021284	GATTAA	2	12	741431	741442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021284	TTGATA	2	12	746793	746804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021284	TTTTTA	2	12	748179	748190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021284	ATAAAA	2	12	753238	753249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021284	CTTTTT	2	12	794361	794372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021284	TTTATT	2	12	830385	830396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021284	TTATAA	2	12	831286	831297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021284	CTTTTA	2	12	883483	883494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021284	ATAAAA	2	12	902505	902516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021284	AAAATA	2	12	905083	905094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021284	ATTTAT	2	12	906016	906027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021284	TAATTT	2	12	916212	916223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021284	TAAAAA	2	12	919453	919464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021284	TTAAAT	2	12	959263	959274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021284	TTTATT	2	12	985935	985946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021284	TAAAAA	2	12	999496	999507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021284	AAATTA	2	12	1013767	1013778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021284	ATTTTT	2	12	1036227	1036238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021284	TTAAAT	2	12	1088686	1088697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021284	CAAAAA	2	12	1093222	1093233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021284	TAAATT	2	12	1107259	1107270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.